兽医微生物_细菌的分类与命名.pdf

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1、第六章细菌的分类与命名第一节细菌的分类地位第二节细菌的命名第三节细菌分类鉴定的标准第四节细菌分类的方法第五节细菌的分类体系第六节细菌的鉴定Keywords第六章family科genus属细菌的分类与命名species种subspecies亚种type型subtype亚型strain菌株第一节细菌的分类地位第六章一、生物的分类六界：动物界、植物界、真菌界、原细菌的分类与命名生生物界、原核生物界、病毒界。细菌分类层次与其他生物相同，即：界、门、纲、目、科(Family)、属(Genus)、种(Spec

2、ies)。第一节细菌的分类地位第六章1.属（Genus）（P70）是具有共性的若干种的组合，应与细菌的分类与命名其他属有明显的差异。不同属之间的16SrRNA序列有较大的差异（差异应大于5%-7%）。第一节细菌的分类地位第六章2.种（Species)生物分类的基本单位。凡属同种的细菌的分类与命名生物，均具有共同的基本性状特征。它是生物在一定演化阶段，具有相对稳定的一定性状特征的实体。16SrRNA序列同源性大于97%第一节细菌的分类地位第六章3.种以下的分类单位(1)亚种(subspecies)：种内可能存在一细

3、菌的分类与命名些在某些性状上相互差异的类别。(2)型(type)与亚型(subtype)：仅仅是某一方面的性状，如血清型。型内还可按进一步的性状差异区分为不同亚型。第一节细菌的分类地位第六章(3)菌株(strain)：是指同种细菌中不同来源的纯培养物。细菌的分类与命名具有典型特征的菌株称为典型株/代表株/标准株。不同菌株可能性状完全相同，也可能有某种微小差异。第二节细菌的命名第六章“双名法”命名（国际细菌命名法规）细菌的分类与命名由属名和种名两部分组成。属名（第一字母大写）在前，种名在后。均用拉丁文或拉丁化

4、的文字表示。在出版物中，属名和种名均应排成斜体。如Staphylococcusaureus翻译时，种名在前，属名在后。第二节细菌的命名第六章未确定种名的细菌命名：在属名后加上sp.或spp.（正体）。细菌的分类与命名新种的命名：在学名之后加注sp.nov.（novospecies）（正体）。亚种的命名：ssp.或subsp.（正体）。第三节细菌分类鉴定的标准第六章一、细菌分类的指征1.形态学特性2.培养特性细菌的分类与命名3.生活方式4.生理生化特性5.抗原构造6.对噬菌体的敏感性7．对抗生素及其他化学物

5、质的敏感性8．病原性9．遗传学特征第三节细菌分类鉴定的标准第六章二、细菌种系发生关系的研究方法1）DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定细菌的分类与命名（G+C）mol%含量：某一生物DNA中的G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的百分数（反映该生物遗传性状的一种本质特征）。测定方法：梯度密度离心法、解链温度法(Tm)等。第三节细菌分类鉴定的标准第六章2）DNA或RNA同源性的测定DNA-DNA杂交试验(hybridization)细菌的分类与命名原理：同源DNA单链或非同源DNA单链，只要它们彼此在核苷酸

6、序列上有相应互补的部分，就可产生不同程度的结合。第三节细菌分类鉴定的标准第六章2）DNA或RNA同源性的测定应用：通过在体外测定菌株间DNA细菌的分类与命名的杂合率，据此推算出DNA的相似程度，判断它们在亲缘关系上的亲疏，帮助分类鉴定。DNA-RNA杂交试验第三节细菌分类鉴定的标准第六章3）rRNA的分析细菌的分类与命名rRNA在遗传信息传递中起重要作用，特别是16SrRNA能反映各种细菌间在系统发生方面的关系。从该rRNA的碱基序列可绘制系统发生树。第四节细菌分类的方法第六章1.数值分类法2.分子生物学分类

7、法细菌的分类与命名3.血清学方法4.化学分类法第四节细菌分类的方法第六章1.数值分类法细菌的分类与命名根据数值分析，借助电子计算机，将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定位。第五节细菌的分类体系第六章国际系统与进化微生物学杂志（InternationalJournalofSystematicand细菌的分类与命名EvolutionaryMicrobiology,IJSEM)分离鉴定的新细菌论文副本2年第五节细菌的分类体系第六章细菌分类有三个主要体系前苏联、法国、美国细菌的分类与命名《伯杰氏分类系统细菌学手册》（

8、第2版），共五卷。1994年出版了《伯杰氏鉴定细菌学手册》第9版，将细菌门分为33个部分，其中与兽医学和医学有关的计13个部分。第五节细菌的分类体系第六章国际著名的菌种保藏机构ATCC（美国）细菌的分类与命名（AmericanTypeCultureCollection)NCTC（英国）(NationalCollectionofTypeCultures