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时间:2018-02-02
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1、介绍一、1、进入NCBI网站,左侧有sequencesubmissions,点击进入SubmittoGenBank利用BankIt在线投递,特点是比较方便,你按照程序的说明一步步跟着操作就可以了,满简单的。2、从NCBI的ftp上下载提交序列的软件sequin,利用软件进行提交。NCBI的ftp地址是ftp.ncbi.nih.gov两中方法都不难,如果不懂的话找个说明书看一下就可以了,一般如果你只提交单条序列的话可以到NCBI的站点上利用方法1直接提交就可以了,比较简单。但是如果你想批量提交很多条序列
2、的话,最好用sequin软件,这样更具有效率。介绍二、转帖(from生技论坛bbschief)略有改动向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin。用那种办法,根据不同的需要。BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/1.适合单个或少量几个的提交2.喜欢用在线的方式提交,无需下载个软件3.你的序列的注释不复杂4.提交你的序列时不需要用到序列的分析Sequin(下载页面:http://www.ncbi
3、.nlm.nih.gov/Sequin/index.html)1.提交的是批量而且比较复杂的序列2.youaresubmittingmutation,phylogenetic,population,environmental,orsegmentedsets3.喜欢图形的界面,有更的选项和功能,可以批量修改4.获得相关的分析工具这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt,Sequin也是大同小异的。1,进入GenBank2,左栏点击SubmittoGenBank3,左边出现几个工具的选择,点击Bank
4、It。在BankIt提交页面的最下面,填上你要提交的序列的长度,点New4,点New后,会生成一个bankit号,记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字啊,序列之类的5,填好资料后,你可以保存一份在你的电脑。如果确认无误,点提交(Validateandcontinue)6,如果你填的资料有误,或漏填了。就会有ERROR的提醒。像名字,电话,Email,序列等都是必须的。最后NCBI会给您发个邮件,等过几个月后如果没有问题就能得到您的登录号了,如果有问题NCBI会邮件和您联系。如果是用Sequ
5、in,填好资料过程中可以随时保存,最后你只需把最后确认的文件向NCBI发封邮件就可以了。本人是在他人指点下进行了操作,假如你选择“--Tobereleasedimmediatelyafterprocessing”递交成功后立刻就收到“gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov”发来的邮件,显示你递交的新基因的信息,两天后还会收到登陆号;再过一段时间将会收到正式文件通知。介绍三如何向NCBI提交基因序列2011-03-2919:44:36
6、 分类:知识点滴阅读93评论0 字号:大中小 订阅向
7、NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin。用那种办法,根据不同的需要。BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/1.适合单个或少量几个的提交2.喜欢用在线的方式提交,无需下载个软件3.你的序列的注释不复杂4.提交你的序列时不需要用到序列的分析Sequin(下载页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html)1.提交的是批量而且比较复杂的序列2.yo
8、uaresubmittingmutation,phylogenetic系统发育的,population,environmental,orsegmentedsets3.喜欢图形的界面,有更的选项和功能,可以批量修改4.获得相关的分析工具这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt,Sequin也是大同小异的。1,进入GenBank2,左栏点击SubmittoGenBank3,左边出现几个工具的选择,点击BankIt。在BankIt提交页面的最下面,填上你要提交的序列的长度,点New4,点New后,会生成
9、一个bankit号,记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字啊,序列之类的5,填好资料后,你可以保存一份在你的电脑。如果确认无误,点提交(确认Validateandcontinue)6,如果你填的资料有误,或漏填了。就会有ERROR的提醒。像名字,电话,Email:gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov,序列等都是必须的。用Sequin软件编写好,你要提交的序列和基本信息之后。在research下拉栏里面,点击Validate,确认无
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