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时间:2018-01-24
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1、蛋白表达研究系列之——WesternBlot试验操作指南目录目录1一、总蛋白的提取21试验类型和蛋白类型22样品组织类型33蛋白表达峰度判断44总蛋白提取的基本步骤44.1细胞样品总蛋白的提取操作步骤54.2组织样品总蛋白的提取操作步骤5二、总蛋白BCA定量6三、SDS-PAGE凝胶电泳7四、转膜8五、信号增强剂处理膜9六、封闭、一抗孵育、二抗孵育91封闭92一抗孵育93二抗孵育13七、曝光显色14八、灰度分析15九、抗体及相关溶液配制151抗体172相关溶液配制表1717蛋白检测相对于DNA/RNA的检测来讲要困难
2、许多,WesternBlot作为蛋白检测的经典方法短时间内仍然无法被取代。WesternBlot的原理并不复杂,网上有很多这方面的材料,这里不作过多的介绍。虽然原理、操作并不复杂,但做好WesternBlot、得到满意的图片并非易事。其操作过程中涉及到:蛋白提取、电泳、转膜、杂交、显色、抗体的选择、试剂的选择、设备应用等诸多内容,其中每一个环节的差错对最后的试验结果都会产生不小的影响,最终导致试验失败。很多同学都在抱怨自己的WesternBlot没有信号、目的条带太弱、杂带太多、条带弯曲、泳道中有涂抹状背景等诸多问题
3、,大部分情况都会最终把矛头指向抗体,认为这个抗体质量不好。抗体质量肯定会对试验产生相当重要的影响,但绝不是全部。你的操作方法可能是对的,但,是否合理、是否适合你的试验要求,你可能未必了解。我们课题组WesternBlot的任务量极重(每年ECL的用量都在5L以上),课题组里面的一些同学总是在不停的问我关于条件优化的问题,我不可能为每一个人找到问题的关键点,因此,写一份关于WesternBlot的系统性材料非常有必要,希望你们可以针对自己的问题,自我分析、自我解决,这样也能锻炼你们独立解决问题的能力。一、总蛋白的提取总
4、蛋白作为WesternBlot试验的原始材料,可以说是试验的根基。蛋白提取不好、提取效率差、试剂选取不合理,后面的试验就基本不用做了,肯定会发生没有信号、信号弱、背景高、泳道中有涂抹状背景等问题。做试验之前这些信息需要考虑和查询:(1)试验类型;(2)目的蛋白类型;(3)样品组织类型;(4)蛋白表达峰度判断。1试验类型和蛋白类型(1)如果是IP试验,样品的蛋白提取务必使用碧云天的Western及IP细胞裂解液(货号:P0013)。HaiGene的超强RIPA裂解液虽然能有效的裂解样品,但其成分对后续分离蛋白复合物有影
5、响。如果是细胞核内的蛋白研究,样品裂解30min后,放置到超生破碎仪上30~50W,工作4s,间隙6s,超声5次。这样能有效的将细胞核裂解,并打碎基因组DNA和RNA,有两个目的:第一,碧云天的Western及IP细胞裂解液对细胞核有一定的裂解能力,但并不能完全裂解细胞核,通过超声可将细胞核完全裂解,从而释放更多的核蛋白,这样后续检测能获得更高的灵敏度;第二,细胞核中的蛋白总是与基因组DNA结合在一起,如果不将DNA打碎,核蛋白仍然跟基因组DNA结合在一起,样品离心过程中,容易发生基因组DNA-蛋白复合物大分子沉淀,
6、从而丢失这部分核蛋白,通过超声将DNA打碎后,彻底释放核蛋白,从而获得更多的目的蛋白。17(2)如果是单纯的WesternBlot试验,使用HaiGene的超强RIPA裂解液(货号:C2501)和Benzonase核酸酶(货号:C2001)。这个RIPA裂解液裂解能力更强,可获得更多的总蛋白,它可以完全裂解细胞核、线粒体,并可提取到更多的膜蛋白。如果后续杂交的蛋白有细胞核、线粒体和膜蛋白,则务必使用这个RIPA裂解液,它能提取到很多Western及IP细胞裂解液提取不到的蛋白。但使用HaiGene的超强RIPA裂解液
7、必须要使用Benzonase核酸酶,这个酶能迅速降解基因组DNA和RNA,从而使样品不粘稠(粘稠的样品,在胶孔上样时将很困难),还能提高总蛋白提取效率(尤其是核蛋白)。总结:根据试验类型和目的蛋白的表达定位情况,选取合适的裂解液,确定是否需要超声处理即可。2样品组织类型我们组的样品就两种:细胞和动物组织。(1)先说一下细胞样品的处理,细胞样品由于很纯、都是单个细胞,容易裂解,处理非常容易。可能遗漏点在凋亡(或死亡)的那部分悬浮细胞。WesternBlot试验要求细胞至少6孔板一孔(融合度85%),最好2~3孔,这样细
8、胞量比较足。当然也要看蛋白的表达峰度情况,蛋白表达峰度低的可用一个25cm2培养瓶的细胞。细胞于胰酶消化、终止后,8000rmp离心5~10min(1.5mlEP管),留底部细胞团块,加入1mlPBS,不重悬底部细胞,只是冲洗一下EP管,再离心2min。倒掉PBS,用移液器将剩余PBS吸取干净,再加入40~50μlPBS重悬细胞*1,加入150
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