中国马铃薯晚疫病菌aflp遗传多样性分析

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1、中国马铃薯晚疫病菌AFLP遗传多样性分析中国马铃薯晚疫病菌AFLP遗传多样性分析杨志辉朱杰华?张凤国河北农业大学植物保护学院河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心保定071001摘要：应用AFLP分子标记检测了我国部分马铃薯主要产区马铃薯晚疫病菌的遗传多样性及不同地区菌株间的亲缘关系。在200对引物组合中，利用6个菌株筛选出12对多态性好、带型清晰的引物组合。利用这12对引物组合对1997-2002年间采自我国黑龙江、河北、四川和云南4省的50株菌株进行了PCR扩增，共扩增出922条谱带，其中多态性标记530条，占57.5%。利用NTSYSpc软件中UPGMA算法构建了我国马铃薯晚

2、疫病菌的亲缘关系树状图，聚类分析结果表明我国马铃薯晚疫病菌的遗传多样性与病原菌的地理来源有一定的相关性，而与交配型、生理小种和对甲霜灵的抗性无明显的相关性。用POPGENE软件计算了各群体间的遗传多样性参数，结果表明我国马铃薯晚疫病菌的遗传多样性程度不高，不同地区种群间分化不明显。关键词：致病疫霉，分子标记，遗传变异，群体结构GeneticdiversityofChineseisolatesofPhytophthorainfestansrevealedbyAFLPanalysisYANGZhi-HuiZHUJie-Hua*ZHANGFeng-GuoDepartmentofPlantPa

3、thology,AgriculturalUniversityofHebei,ResearchCentreofP1antPathogenandPestControlofHebeiProvince,Baoding071001,ChinaAbstract：ThegeneticdiversityofthepopulationsofPhytophthorainfestansfromsomemajorpotatoproductionregionsinChinaweredetectedbyamplifiedrestrictionfragmentpolymorphism(AFLP)analysis.A

4、mong200combinationsofprimerpairscreened,12combinationscouldgenerateconsistentpolymorphicbandsusingsixtestedisolates.ThetwelvecombinationswereusedtoamplifythegenomicDNAof50isolatescollectedinChinafrom1997to2002.Atotalof922AFLPbandswereobtained,and530ofthem，covering57.5%,showedpolymorphism.Cluster

5、analysisusingtheunweightedpair-groupmethodwitharithmeticaverages(UPGMA)separated50isolatesintofiveAFLPgroupswhichwerecorrelatedtogroupsdefinedbygeographicalorigin,however,theywerenotcorrelatedtogroupsdefinedbymatingtype,orresponsetometalaxylandvirulence.ParametersofgeneticdiversitycalculatedbyPO

6、PGENEsoftwareindicatedthatthegeneticdiversitylevelofPhytophtorainfestanspopulationinChinawasnothigh.Keywords:Phytophthorainfestans,molecularmarker,geneticvariation,populationstructure　　19世纪中叶马铃薯晚疫病菌PhytophthorainfestansdeBary首次成功地从起源中心墨西哥随种薯经美国传入欧洲，而后传遍全球（Goodwinetal.1994）。由于晚疫病菌是异宗配合真菌，在Hohl&Is

7、elin（1984）于瑞士发现A2交配型以前，除墨西哥以外其他马铃薯种植区仅存在A1交配型，不能进行有性生殖。20世纪80年代以后，不同国家陆续发现了晚疫病菌A2交配型，晚疫病菌群体遗传结构组成逐渐变得复杂，并且马铃薯晚疫病在全球再度严重流行（Fry&Goodwin1997）。近年来各种分子标记，如RAPD、RFLP、SSR和AFLP被广泛用于晚疫病菌群体遗传多样性的研究（Mahukuetal.2000;Ochwoetal.2002;Cooke