最新乙型肝炎病毒的异质性-及临床意义教学讲义PPT课件.ppt

《最新乙型肝炎病毒的异质性-及临床意义教学讲义PPT课件.ppt》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。

1、乙型肝炎病毒的异质性-及临床意义HBV的感染过程除了4个主要亚型外，还有adyr、adwr、adyw/aywr和adywr等复合亚型。不同亚型在外膜蛋白的前-S区序列和全基因组序列亦有相应的差异。复合亚型第二部分乙型肝炎病毒的基因型HBV基因型的定义分型方法是根据HBsAg主蛋白基因或全基因组核苷酸序列差异性进行的基因型分型，差异大于8%即被确定为另一基因型，按照这种分型方法，将HBV分为6种基因型，分别命名为A-F型，另有学者新定义了G、H型，尚待确定。国内流行病学资料国内主要的基因型为B、C两型，台湾省的研究资料提示除E型外

2、，其他基因型均可在华人HBV感染者中检出，B和C型占患者人群的85%。HBV的异质性基因型基因型*地理分布A北欧、西欧、美国、非洲B中国、印度尼西亚、越南C中国、越南、朝鲜、日本D地中海区、中东、印度E西非F美国（印地安拿人）、波利尼西亚G欧洲、美国*根据HBV全序列中核苷酸差异≥8%ChuCJetal.Hepatology2002;35(5):1274第三部分乙型肝炎病毒基因准种的特点问题不同的慢性乙型肝炎患者之间血清中乙型肝炎病毒基因序列是不同的，因此可以根据序列的差别分成不同的血清型（adr、ayw、adw等），也可以分成

3、不同的基因型（A、B、C、D、E、F、G、H）。问：同一个患者血液中不同的乙型肝炎病毒之间其基因序列是否相同？答：相同！或不同！型与准种基因型（不同个体之间）血清型（不同个体之间）准种（单一个体）乙型肝炎病毒准种的定义乙型肝炎病毒在长期复制过程中，由于逆转录过程其多聚酶缺乏严格的校正机制，从而产生自发点突变，造成子代病毒基因序列之间的微小差别，因而血清中的乙型肝炎病毒基因序列是不同的。这种差别一般小于全长基因组的5%。有微小基因序列差别、但序列十分相近的乙型肝炎病毒组成的病毒群，这一病毒群时刻处于动态变化之中，乙型肝炎病毒的这

4、种存在状态称为“准种”。英文：quasispecies为什么以前没有注意？方法比较既往方案：收集血清↓提取血清中HBVDNA↓设计重叠PCR引物↓PCR扩增↓产物直接测序（单一克隆序列）本研究方案收集血清↓提取血清中HBVDNA↓设计PCR引物↓PCR扩增↓TA克隆入质粒载体中↓随机选择单克隆测序（多个克隆序列）S基因准种的特点（前-S1、前-S2、S）ProtocolofHumanSomaticGeneTherapyS基因全长PCR,1400bp1234M5671400bpHBV全S基因RFLP结果遗传树分析E853-A3

5、E845-A12E845-B4E845-A16E845-A8RenbaoGanN19E5N19A3N19A8N19E19EJ1B13EJ1A4E67B5E67A1E67A8E67B1E67B8N19E5EJ1B6EJ1A12EJ1B16HBV准种特点分析—————————————————————HBVDNASRegionHBVDNAXRegionHBVDNAPRegionHBVDNACRegionHBVDNAPre-C区HBVDNA全长HBVDNA——————————————————————基因准种的个体化特点HBsAg氨基酸序

6、列RT702A3MENTT-----LFGGA-----VPFAQWFAG-RT702A14MENTT-----LFGGA-----VPFAQWFAG-RT702B3MENTT-----LFGGA-----VPFAQWFAG-RT702A10MENTT-----LFGGA-----VPFAQWFAG-RT522B7MESTT-----LFGGA-----VPFVQWFVG-RT522A5MESTT-----LFGGA-----VPFVQWFVG-RT522B11MESTT-----LFGGA-----VPFVQWFVG-RTXJA2

7、MENTT-----LFGEA-----VPFVQWFVG-RTXJA6MENTT-----LFGEA-----VPFVQ*FVG-RTXJB5MENTT-----LFGEA-----VPFVQWFVG-RTXJC4MENTT-----LFGEA-----VPFVQWFVG-变异的一些特点（逆转录酶区）RT702A3-SSNLSWLS-----SHPIVLGF-----VIGSWGTLPQEHIVLKIK-RT702A14-SSNLSWLS-----SHPIVLGF-----VIGSWGTLPQEHIVLKIK-RT702B3-SS

8、NLSWLS-----SHPIVLGF-----VIGSWGTLPQEHIVLKIK-RT702A10-SSNLSWLS-----SHPIVLGF-----VIGSWGTLPQEHIVLKIK-RT522B7-SSNLTWLS----