严超赣的静息态数据处理DataProcessing教学教材.ppt

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1、严超赣的静息态数据处理DataProcessing预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimingRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filter:0.01-0.082数据整理被试信息整理3数据整理被试信息整理4数据整理被试信息整理原始数据整理静息功能数据结构数据DTI数据5数据整理被试信息整理原始数据整理静息功能数据结构数据DTI数据6预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimingRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filter:0.01-0.087DICO

2、M->NIFTIMRIcroN’sdcm2niiguiSPM5’sDICOMImport8预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimingRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filter:0.01-0.089预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimingRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filter:0.01-0.0810SliceTimingWhy?11SliceTimingWhy?Huetteletal.,200412SliceTiming1:2:33,

3、2:2:323322-(2/33)3313SliceTiming14预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimingRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filter:0.01-0.0815RealignWhy?16Realign17Realign检查头动?b=load(‘rp_name.txt’);c=max(abs(b));c(4:6)=c(4:6)*180/pi;18预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimingRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filt

4、er:0.01-0.0819NormalizeWhy?Huetteletal.,200420mean_name.imgr*.imgEPI.nii-90-126-72;909010833321Normalize22预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimingRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filter:0.01-0.0823SmoothWhy?减少被试间的空间结构差异；有利统计检验的有效性;24w*.img平滑核Smooth25预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimin

5、gRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filter:0.01-0.0826去线性漂移27预处理数据整理DICOM->NIFTI去前10个时间点SliceTimingRealignNormalizeSmooth去线性漂移Filter:0.01-0.0828滤波Why?关心低频的活动29滤波30Outline预处理ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理31ALFFZangetal.,200732ALFF33ReHo注意：预处理时不做平滑，计算完ReHo后再进行平滑。Zangetal.,200434ReHo35功能连接提取协变量头

6、动参数:rp_name.txt全脑信号、脑脊液、白质信号36提取协变量37提取协变量38提取协变量39提取协变量40提取协变量41提取协变量42提取协变量43功能连接提取协变量头动参数:rp_name.txt全脑信号、脑脊液、白质信号协变量组合：RPCov=load('rp_name.txt');BCWCov=load('ROI_FCMap_name.txt');Cov=[RPCov,BCWCov];save('Cov.txt','Cov','-ASCII','-DOUBLE','-TABS');44功能连接Voxel-wiseROI-wiser=0.

7、3645Voxel-wise46Voxel-wise47Voxel-wise48Voxel-wise49Voxel-wise50Voxel-wise51Voxel-wise1by1Cov.txt52ROI-wise53ROI-wise54ROI-wise1by1Cov.txt55Outline预处理ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理56统计单样本T检验双样本T检验57单样本T检验统计准备ALFF:mALFFReHo:smReHoFC:zFC58单样本T检验mALFF-1,smReHo-1m图像1by1i1-159单样本T检验m*-1图像;

8、zFC图像存放SPM.mat的目录60单样本T检验上一步生成的spm.mat61单样本T检验上