生物化学知识要点.doc

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1、生物化学知识要点(上)第一章蛋白质名词解释简单蛋白质(simpleprotein)结合蛋白质(conjugatedprotein)球状蛋白质(globularprotein)纤维状蛋白质(fibrousprotein)单体蛋白质(monomericprotein)寡聚蛋白质(oligomericprotein)等电点(isoelectricpoint)氨基酸残基(aminoacidprotein)肽键(peptidebond)肽键平面(peptideplane)同源蛋白质(homologousprotein)蛋白质一级结构(prim

2、arystructureofprotein)构型和构象(configurationandconformation)蛋白质二级结构(secondarystructureofprotein)a-螺旋(ahelix)b-折叠(bconformation)b-转角(bturn)超二级结构(super-secondarystructure)结构域(domain)蛋白质三级结构(tertiarystructureofprotein)蛋白质四级结构(quaternarystructureofprotein)疏水相互作用(hydrophobicin

3、teraction)别构蛋白质(allostericprotein)别构效应(allostericeffect)透析(dialysis)超过滤(ultra-filtration)盐析(saltingout)蛋白质的沉淀(precipitationofprotein)蛋白质的变性作用(denaturationofprotein)分配层析(partitionchromatography)凝胶过滤层析(gelfiltrationchromatography)离子交换层析(ion-exchangechromatography)电泳(elec

4、trophoresis)聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)等电聚焦(isoelectricfocusing)双向电泳(twodimensionalelectrophoresis,2DE)蛋白质组和蛋白质组学(proteome,proteomics)知识要点一、蛋白质的通论1.元素组成2.分类:简单蛋白和结合蛋白,单体蛋白和寡聚蛋白,纤维状蛋白和球状蛋白3.蛋白质功能的多样性二、蛋白质的基本结构单位------氨基酸1.结构通式:a-氨基酸,掌握20种氨基酸的化学结构式及三字缩写符号;2.氨基酸的分类:(掌握20种氨基酸分别归属于以下哪类

5、)(1)按R基化学结构分类:脂肪族氨基酸(包含6类)、芳香族氨基酸、杂环氨基酸(2)按R基极性分类:非极性R基氨基酸、不带电荷的极性R基氨基酸、带正电荷的极性R基氨基酸,带负电荷的极性R基氨基酸3.氨基酸的重要理化性质:(1)旋光性:L-氨基酸和D-氨基酸7(2)光吸收:具有紫外吸收特性的氨基酸、蛋白质最大紫外吸收峰(3)酸碱性质:两性电解质、氨基酸解离曲线、Handerson-Hasselbalch公式及应用、等电点、等电点计算(4)氨基酸的化学反应:·a-氨基参与的反应:与HNO2的反应、与丹磺酰氯(DNS)的反应、与2,4一二

6、硝基氟苯(DNFB)的反应、与苯异硫氰酸酯(PITC)的反应·a-羧基参与的反应:成盐成酯反应·a-氨基和a-羧基共同参与的反应:与茚三酮的反应、成肽反应·侧链R基参与的反应:-OH磷酸化反应,-SH的氧化和二硫键的断裂、黄色反应等(5)氨基酸分析分离法的原理和应用:纸层析、薄层层析(TLC)、阳离子交换层析、阴离子交换层析、高效液相色谱(HPLC)、气相色谱(GC)三、蛋白质的结构1.一级结构:(1)多肽链:结构通式、氨基酸残基、肽链极性(N端和C端)(2)肽键:部分双键性质、肽平面、构型(反式/顺式)(3)一级结构的特点:举例:

7、谷胱甘肽、胰岛素、牛胰核糖核酸酶(4)蛋白质的氨基酸顺序测定:·氨基酸组成分析:酸水解和碱水解·N末端测定:DNFB法、PITC法、氨肽酶法·C末端测定:羧肽酶法、肼解法·多肽链的断裂:胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶、嗜热菌蛋白酶、木瓜蛋白酶、溴化氢、羟胺等酶切位点2.高级结构(三维结构,空间构象)稳定蛋白质分子的作用力---次级键(非共价键):包括氢键、范德华力、疏水相互作用、盐键。(1)蛋白质的二级结构:种类和特点(a-螺旋、b-折叠、b-转角、b-突起、无规卷曲)(2)蛋白质的超二级结构:种类和特点(aa、bab、bb)(3

8、)结构域:存在的优越性(4)蛋白质的三级结构:·种类:全a结构、a,b结构、全b结构、富含金属或二硫键的蛋白质·结构特点:举例:肌红蛋白(Mb)·蛋白质的折叠:蛋白质的变性、折叠原则(自我装配原则)、折叠的热力学因素(△G)、折叠的动

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