基因工程实验报告(程庆佳,生物技术,20091070004).doc

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1、大肠杆菌核糖核苷酸HII基因的克隆及其检测(基因工程实验报告)程庆佳(云南大学,生命科学学院,生物技术,)(班级:周二下午实验班;组号:第八组;老师:赖建华;同组员:顾聚)摘要:此次实验的目的是对大肠杆菌核糖核苷酸HII基因的克隆及其检测,其中的关键步骤包括了大肠杆菌基因DNA的提取,PCR扩增,DNA体外重组,感受态细胞的制备,重组DNA的转化,重组转化的检测等多种具有紧密连接性的实验,使学生可以掌握一套具有连贯性的实验过程,帮助学生塑造连贯试验的观念,从而得到更好地成长与进步。关键词:提取、扩增、重组、感受态细胞、转化、检测正文:此次实验的最终目

2、的是要使学生连贯性的掌握本学期的实验,所以要求我们要熟悉每个实验的原理过程,以及实验结果的准确分析,只有这样才能保证实验最终结果的准确性,才能真正地掌握此次实验。1、大肠杆菌基因组DNA的提取原理:DNA是一个环形的大分子DNA,真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内。不同种属的生物,以及不同形式的细胞(如菌类、培养细胞、植物组织,动物组织)基因组提取的方法是不同的,但其基本原则是类似的,即既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含十二烷基硫酸钠(SDS)和蛋白酶K的溶液中消

3、化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。SDS的作用机理是由于其能结合蛋白,中和蛋白的电性,使蛋白质的非共价键受到破坏,失去二级结构,从而变形失活,蛋白酶K的重要特性是能在SDS和EDTA(乙二胺四乙酸二钠)存在的情况下保持很高的活性。在匀浆后提取DNA的反应体系中,SDS可通过失活蛋白破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离;而蛋白酶K可将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来。CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中((

4、0.7mol/LNaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3mol/LNaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB-核酸的复合物与蛋白,多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA,而CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去。简要步骤:(1)、菌种活化:将菌落接种于LB培养基中,37度培养过夜(2)、取1ml菌液转入1.5ml离心管中,5000rpm离心1分钟,去上清。(3)、加入500ulTE,50ul10%SDS,5ul蛋白酶K,混匀,55度,保温20min(4)、加入50ul,5MNacl混匀,再加入50ulCTAB提取液,混匀,65度

5、,20min(5)、去蛋白:300ul的酚和氯仿,轻轻混匀,10000rpm,2min(6)、上清转入另一个干净的1.5ml离心管,加入等体积氯仿异戊醇,轻轻混匀,10000rpm,2min,上清转入干净的1.5ml离心管中(7)、加入1/10体积的醋酸钠,2倍体积的无水乙醇轻轻旋转小试管,可见絮状沉淀,即为染色体丝,10000qpm,3min收集沉淀(8)、弃上清,沉淀用500ul75%乙醇洗涤两次(每次10000rpm离心1min)(9)、室温下稍干,加适量(约50ul)RTE溶解,37度30min(10)、电泳观察结果12如图所示,1号为本组实

6、验结果。对比maker,第一条带为正常大肠杆菌基因组,中间可以看见模糊的条带,可能为断裂的基因组片段,下面最亮的为RNA。出现断裂的基因组可能是由于操作过于剧烈。本组电泳带还比较清晰整齐,其他组不整齐的带可能是电泳技术问题。RNA含量很大,所以显示比较清晰。在电泳过程中应注意的是胶浓度要与DNA分子量呈线性关系,所以胶浓度对于实验结果检测的成败有重要的意义。另外,在实验过程中应避免用力,以此来保障DNA样品结构的完整性与稳定性。1、PCR扩增目的基因核糖核苷酸酶HII基因原理:聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)是一

7、种体外DNA扩增技术。该技术能在几小时的实验操作中,将人为选定的一段DNA扩增几百万倍,具有灵敏度高、特异性强、操作简便和应用广泛等优点。PCR的工作原理类似于DNA的体内复制过程,是将待扩增的DNA片断和与其两侧互补的寡核苷酸链引物经变性、退火及延伸三步反应的多次循环,使特定的DNA片断在数量上呈指数增加。PCR扩增首先需要一对引物,根据待扩增区域两侧的已知序列合成两个与模板DNA互补的寡核苷酸作为引物,引物序列将决定扩增片段的特异性和片段长度。反应体系由模板DNA、一对引物、dNTP、耐高温的DNA聚合酶、酶反应缓冲体系及必须的离子等所组成。PC

8、R反应循环的第一步为加热变性,使双链模板DNA变性为单链;第二步为复性,每个引物将与互补的DNA序列杂交;第

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