癌症基因蓝图.doc

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1、癌症基因蓝图在过去的几十年，综合测序的成果已经显示了中国癌症常见形式的基因蓝图，对于大多数的癌症类型，这个蓝图包含了小数量的“山脉”（高百分比的肿瘤基因改变）和大数目的“丘陵”（基因改变的很少）。至今，这些研究揭示了140个基因：当基因内的突变发生改变，将促进或者“驱使”肿瘤的发生。一个典型的肿瘤包含了二到八个这样的“驱使基因”突变，剩下的突变是那些不给予选择性生长优势的突变。驱动基因可分为12个信号通路调节细胞的三个核心步骤：细胞命运，细胞生存和基因组的维护。更好的理解这些途径是在基础癌症研究中最紧迫需求的一个途径。即使到现在，然后，我们关于癌症基因的知识是足够领导发展减少癌症发病

2、率和死亡率的更有效的方法。十年前，所有癌症基因突变可以通过碱基对分辨的想法就像科幻小说。而今天，此类全基因组分析通过外显子测序或者全基因组测序是常见的。原型的癌症外显子研究评估~20种肿瘤花费>100,000$/案例（1-3),今天这个测序的花费已经减少了100fold，研究报导的给出类型的100多种肿瘤的测序已成为标准（TABLES1A),尽管现在大量的数据很容易获得，在有意义的方面解密这些信息仍然一直在变化。这儿，我们将复习从这些测序研究中学到的癌症基因—并且，更重要的是，这些信息教了我们生物学和未来癌症的管理策略。多少个癌症基因在典型的人类癌症中完成了巧妙的突变。在普通的固体肿

3、瘤中例如从结肠、胸部、大脑、胰腺等，平均33到66个基因显示微妙的体细胞突变,会改变他们的蛋白质产品(图1)。95%的这些突变是单碱基替换（例如C>G),然而剩下的是一个或几个基地的缺失或者插入（例如CTT>CA)（TABLES1B),基地的替换，90.7%导致了错义突变，7.6%导致无义突变，1.7%导致了接合点的改变和非编码区域马上临近的开始或者终止密码子（TABLES1B)。某个肿瘤展示了很多比平均更多或者更少的突变（图1b)。尤其值得注意的在这些异常的尤其是黑色癌和肺癌，每种肿瘤中大约包含了200个非同义突变（TABLES1C)，这些大数据反应了在这些癌症类型的发病机理中有效

4、突变（分别为紫外线和香烟）的牵连。因此肺癌在吸烟者中有十倍的体细胞突变相比较于不吸烟者。在DNA修复上有缺陷的肿瘤形成了离群团体。例如，有错配修复缺陷的肿瘤可以含有几千个突变(Fig.1B)。