生物信息学简介.doc

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1、生物信息学简介一.生物信息学诞生的历史必然性生物信息学（Bioinformatics）就其萌生而言，是一门相当古老的学科，因为早在计算机初创期的1956年就已经在美国田纳西州的Gatlinburg召开过首次“生物学中的信息理论讨论会”；而就其发展而言，却是一门相当年轻的学科，因为继20余年的沉默之后，只有伴随着八九十年代计算机技术的迅猛发展，它才同时得以获得自身的大发展。无论从理论上来讲还是从现实情况来看，生物信息学的实质就是利用计算机科学和网络技术来解决生物学问题。它的诞生和发展是应时所需，是历史的必然，

2、已经悄然渗透到生物科学的每一个角落，以至人们在意识到它的存在之前就已经离不开它了！二十世纪尤其是末期，生物科学技术的迅猛发展，无论从数量上还是从质量上，都极大地丰富了生物科学的数据资源，数据资源的急剧膨胀首先迫使我们不得不考虑寻求一种强有力的工具去组织他们，以利于对已知生物学知识的储存和进一步加工利用。大量多样化的生物学数据资源中必然蕴含着大量重要的生物学规律，这些规律是我们解决许多生命之谜的关键所在，然而继续沿用传统手段以人脑来分析如此庞杂的数据实在是太勉为其难了！人们同样需要寻求一种强有力的工具去协助人

3、脑完成这些分析工作。可以说，伴随着二十一世纪的到来，生物科学的重点和潜在的突破点已经由二十世纪的试验分析和数据积累转移到数据分析及其指导下的试验验证上来，生物科学也正在经历着一个从分析还原思维到系统整合思维的转变。那么，我们所寻求的那种强有力的数据处理分析工具就成为未来生物科学的关键所在；似乎是上帝的恩赐，伴随着生物科学这一需求的加剧，以数据处理分析为本质的计算机科学技术和网络技术同样获得了突飞猛进的进展,自然就成为生物科学家的必然选择，计算机科学技术和网络技术日益渗透到生物科学的方方面面，一门崭新的、正是

4、如火如荼的、拥有巨大发展潜力的生物信息学也就悄然而坚定地发展和成熟起来了！可以说，历史必然性的选择了生物信息学——生物科学与计算科学的融合体——作为下一代生物科学研究的重要工具。关于生物信息学的定义，由于生物科学家们各自所从事的具体领域不同，因此存在着形形色色的理解，并没有一个统一的概念，其实文字界定并不重要，关键是要充分发挥计算机和网络在生物科学各个领域的数据处理分析能力，帮助我们尽快全面系统地认识生命的本质，这恐怕才是所有生物科学家的共同理解和目的所在。二、生物信息学的重要性生物信息学不仅仅是一门科学学

5、科，它更是一种重要的研究开发工具。从科学的角度来讲，它是一门研究生物和生物相关系统中信息内容物和信息流向的综合系统科学，只有通过生物信息学的计算处理，我们才能从众多分散的生物学观测数据中获得对生命运行机制的详细和系统的理解。从工具的角度来讲，它是今后几乎进行所有生物（医药）研究开发所必需的舵手和动力机，只有基于生物信息学通过对大量已有数据资料的分析处理所提供的理论指导和分析，我们才能选择正确的研发方向，同样，只有选择正确的生物信息学分析方法和手段，我们才能正确处理和评价新的观测数据并得到准确的结论。可见生物

6、信息学在今后的无论是生物（医药）科研还是开发中都具有广泛而关键的应用价值；而且，由于生物信息学是生物科学与计算科学、物理学、化学和计算机网络技术等密切结合的交叉性学科，使其具有非常强的专业性，这就使得专业的生物（医药）科研或开发机构自身难以胜任它们所必需的生物信息学业务，残酷的市场竞争及其所带来的市场高度专业化分工的趋势，使得专业的生物（医药）开发机构不可能在自身内部解决对生物信息学服务的迫切需求，学术界内的生物（医药）科研机构也是如此，而这种需求，仅靠那些高度分支化和学术化的分散的生物信息学科研机构是远远

7、不能满足的。可见，在生命科学的新世纪，生物信息学综合服务将是一个非常重要的也是一个极具挑战性的领域。三、生物信息学（Bioinformatics）这一名词的来由人们可能不禁要问，生物信息学（Bioinformatics）这一名词是从何而来的呢？这还要从头说起。八十年代末期，林华安博士认识到将计算机科学与生物学结合起来的重要意义，开始留意要为这一领域构思一个合适的名称。起初，考虑到与将要支持他主办一系列生物信息学会议的佛罗里达州立大学超型计算机计算研究所的关系，他使用的是“CompBio”；之后，又将其更改为

8、兼具法国风情的“bioinformatique”，看起来似乎有些古怪。因此不久，他便进一步把它更改为“bio-informatics（或bio/informatics）”。但由于当时的电子邮件系统与今日不同，该名称中的-或/符号经常会引起许多系统问题，于是林博士将其去除，今天我们所看到的“bioinformatics”就正式诞生了，林博士也因此赢得了“生物信息学之父”的美誉。四.生物信息学的国内外现状二十一世纪是