第十章微生物的分类和鉴定ppt课件.ppt

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1、第十章微生物的分类和鉴定生物物种约为150余万种其中微生物为15万~20万种任务有3个:分类、鉴定和命名分类:解决从个别到一般或从具体到抽象的问题,通过收集大量描述有关个体的文献资料,经过科学的归纳和理性的思考,整理成一个科学的分类系统。鉴定:从一般到特殊或从抽象到具体的过程,通过详细观察和描述个未知名称纯种微生物的各种性状特征,然后查找现成的分类系统,以达到对其知类、辨名的目的。命名:为一个新发现的微生物确定一个新学名。第一节微生物分类(一)通用分类单元界Kingdom(拉:Regnum)门Phylum(拉:Phylum))纲Cl

2、ass(拉:Classis)目Order(拉:Ordo)科Family(拉:Familia)属Genus(拉:Genus)种Species(拉:Species)(二)种的概念种是一个基本分类单元,是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内的其他物种有着明显差异的一大群菌株的总称。典型菌株、模式种:在微生物中,一种只能用该种内的一个典型菌株(typestrain)当作它的具体代表,故此菌株就成了该种的模式种(typespecies)。新种:是指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。学名+“sp.no

3、v”例如Corynebacteriumpekinensesp.novAS1.299(北京棒杆菌AS1.299,新种)C.crenatumsp.novAS1.524钝齿棒杆菌AS1.524新种(三)、学名俗名(commonname,vemacularname),具有大众化和简明等优点。学名(scientificname),它是某一菌种按“国际命名法规”进行命名并受国际学术界公认的通用正式名称。物种的学名是拉丁词或拉丁化的词组成的。1、双名法指一个物种的学名由前面一个属名和后面一个种名加词两部分组成。学名=属名+种名加词+(首次定名人)

4、+现名定名人+现名定名年份例:大肠埃希氏菌(大肠杆菌)Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers1919学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定名人+年份排斜体字排正体字(一般省略)Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers19192、三名法当某种微生物是一个亚种或变种时,学名就按三名法拼写。学名=属名+种名加词+符号subsp或var+亚种或变种的加词。例1.苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种Bacillusthuringiensis(subsp)ga

5、lleria例2.酿酒酵母椭圆变种(椭圆酿酒酵母)Saccharomycescerevisiae(var)ellipsoideus学名=属名+种名加词+subsp或va+亚种加词斜体正体(可省)斜体苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种(Bacillusthuringiensis(subsp)galleria(四)有关学名的其他知识1.属名是一个表示该微生物主要特征的名词或用作名词的形容词,单数,第一个字母应大写。可缩写:如Trichodermaviride;Trichodermaharzianaum可缩成:Tri.Viride;Tri.harzi

6、anaum芽孢杆菌属:Bacillus可缩写成B.或Bac.。2、种名加词种名加词又称种加词,它代表一个物种的次要特征。种名加词也由拉丁词、希腊词或拉丁化的外来词所组成,字首一律小写,可由形容词或名词组成。(五)、亚种以下的几个分类名词1、亚种亚种进一步细分种时所用的单元,一般指除某一明显而稳定的特征外,其余鉴定特征与模式种相同的种。2、菌株又称品系(在非细胞型的病毒中则称毒株或株),表示任何由一个独立分离的单细胞(或单个病毒粒)繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代。模式菌株:是一个种的具体活标本,必须是该菌种的活培养物,是由一个被指

7、定为命名的模式菌株传代而来。菌株为一个物种内遗传多态性的客观反应,其数目是无数的。菌株强调的是遗传型纯的谱系。菌株与克隆的概念相同。菌株的特性:同一种的不同菌株间,不作鉴定用的一些性状可能存在很大差异。菌株的名称可随意确定,一般可用字母加编号表示如EscherichiacoliK12怎样区分菌株、菌落、菌苔、斜面、菌种(培养物)、克隆、分离物或纯培养物?第二节微生物在生物界的地位生物的界级分类学说动物界植物界林奈动物界植物界原生生物界Haeckel植物界动物界原始生物界菌界Copeland植物界动物界原核生物界原生生物界真菌界Whi

8、ttaker五界上加上病毒界细菌域古生菌域真核生物域Woese三域学说及其发展三域学说:20世纪70年代末美国C.R.Woese等人对大量微生物和其他生物进行16S和18SrRNA的寡核苷酸测序,并比较其同源性水平后,提出了一个与以往

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