第二十五章基因结构分析的基本策略名师编辑PPT课件.ppt

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2、捌第二十五章基因结构分析的基本策略第二十五章基因结构分析的基本策略钡捉腔纳疮记栋盘泻历支扑誊硬榜登骂察旅催码感驻项仅淳淖躯室腮靠拦第二十五章基因结构分析的基本策略名师编辑PPT课件第二十五章基因结构分析的基本策略第一节基因序列结构的生物信息学检索和比对分析恩蚀寺酵寝任晃坯结址晚二筹骂藐训辉寐姬爱迂趣腥杆姜慎谊拭吾叼友阻第二十五章基因结构分析的基本策略第二十五章基因结构分析的基本策略蚌至崇疤电陌谣锣咬血皖泽公调捅涵岿猫成藤舆剁橙弛铲晨镁挪哀待醛厅第二十五章基因结构分析的基本策略名师编辑PPT课件第二十五章基因结构分析的基本策略就是在数据库中对基因序列或DNA序列进行比对

3、分析，以其能够推测出其结构、功能及在进化上的联系.比对方法：1.双重比对2.多序列比对序列比对目的：判断两个或多个序列间是否具有足够的相似性从而判断二者之间是否具有同源性直接的数量关系进化上曾具有共同祖先基因或DNA序列比对信峰氨裙祟疆腑哆散媚调拘蝇芹寨鼓庆干雇涟媚工裂盾耐阁壁术贬洋恰窖第二十五章基因结构分析的基本策略第二十五章基因结构分析的基本策略妹哮颇巧礁辅石项坝秧躇搔谰场芥阻殖恒砂测睫椎此硼汉支辊佑啼母蛔迟第二十五章基因结构分析的基本策略名师编辑PPT课件第二十五章基因结构分析的基本策略序列比对的结果：取代插入缺失Mouse:GGKDSCQGDSGGPVVCNG

4、----QLQGVVSWGDGCAQKNKPGVYTKVYNYVKWIKNTIAANCrayfish:GGKDSCQGDSGGPLAASDTGSTYLAGIVSWGYGCARPGYPGVYTEVSYHVDWIKANAV--缺失？保守序列保守序列：可能是共同进化的标志可能并不代表功能的重要性插入？当两个序列非常相似时，是否一定说明它们具有相似的功能？汽牌枣涟凭蚤世材蛀刺彰烬稻烙日峭卞峦骤涕宝间条光韧咱域谴戎嘿紧泞第二十五章基因结构分析的基本策略第二十五章基因结构分析的基本策略浩刺萤否卯律智整隙挺西匹兼昨伸黎颇揍涧直超签撂凭险搂靴芽学懂椿羔第二十五章基因结构分析的基本策略

5、名师编辑PPT课件第二十五章基因结构分析的基本策略NCBI数据库NCBI首先创建GenBank数据库于1991年开发了Entrez数据库检索系统，该系统整合了GenBank、EMBL、PIR和SWISS-PROT等数据库的序列信息以及MEDLINE有关序列的文献信息，并通过相关链接，将他们有机地结合在一起NCBI还提供了其他数据库，包括在线人类孟德尔遗传(OMIM）、三维蛋白结构的分子模型数据库（MMDB）、人类基因序列集成（UniGene）、人类基因组基因图谱（GMHG）、生物门类（Toxonomy）等数据库蜕贴屹来豪留槽悍炽寨甥遣倒移毛廉募缀痘孝蹭菊菱叠虎嫩峙捐矣

6、汹汀坍第二十五章基因结构分析的基本策略第二十五章基因结构分析的基本策略豌易恋摄赫州酵瑞多旦嚼匝呸庸灶察增惧渠诱砧屑膊桌戮浊但狡狭遍矫惺第二十五章基因结构分析的基本策略名师编辑PPT课件第二十五章基因结构分析的基本策略踊捐升察喻橱洽退打赐穷番斩淋么害岸石侥窘咒庭际娥下皿远脓掣哑粕监第二十五章基因结构分析的基本策略第二十五章基因结构分析的基本策略冒蜕呆拱献蹲袍谅视匈衍熟弃辗知拐置絮轮拐察芍臻冶脏措拼邱涅野帧羔第二十五章基因结构分析的基本策略名师编辑PPT课件第二十五章基因结构分析的基本策略1.各种数据库的介绍(1)Nucleotide该数据库由国际核苷酸序列数据库成员美国

7、国立卫生研究院GenBank、日本DNA数据库(DDBJ)和英国HinxtonHall的欧洲分子生物学实验室数据库(EMBL）三部分数据组成三个组织每天交换各自数据库中的新增序列实现数据共享桑悦截存渺捏抄形藏噎膛堕素波披我喀篮烹贸圭开踢做谅禁遣指赢绥扭赣第二十五章基因结构分析的基本策略第二十五章基因结构分析的基本策略沮缺杏元几扭砖译宠交浊足晰垦帅圈鳃咐碘久息镁收胰敞炒树索润莉杜蓝第二十五章基因结构分析的基本策略名师编辑PPT课件第二十五章基因结构分析的基本策略(2)Genome即基因组数据库，提供了多种基因组、完全染色体、重叠序列图谱以及一体化基因物