植物罹病组织中象耳豆根结线虫的LAMP快速检测方法-论文.pdf

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1、中国农业科学2013,46(3):534.544ScientiaAgriculturaSinicadoi:10.3864~.issn.0578-1752.2013.03.010植物罹病组织中象耳豆根结线虫的LAMP快速检测方法何旭峰,彭焕,丁中,贺文婷,黄文坤,彭德良(‘中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193:湖南农业大学生物安全科技学院,长沙410128)摘要:【目的】建立一种基于环介导等温扩增(Loop-mediatedisotherma1amplification,LAMP)技术,

2、从植物罹病组织中直接检测象耳豆根结线虫(Meloidogyneenterolobii)的快速检测方法,为象耳豆根结线虫的监测和防治提供技术支持。【方法】根据象耳豆根结线虫与其它根结线虫ITS序列差异设计LAMP特异性引物,通过对LAMP反应条件中的Mg、dNTPs、甜菜碱和反应时间进行优化,同时对检测体系的特异性和灵敏度进行验证,建立一种从罹病植物组织中检测象耳豆根结线虫的LAMP快速检测方法。【结果】象耳豆根结线虫LAMP检测体系优化结果表明在Mg的浓度为5.0mmol·L~、dNTPs的浓度为2.4mmol·L~、不添加

3、甜菜碱、反应时间为45min的条件下,扩增效率最优。本研究建立的LAMP检测方法能够从11个植物线虫种群中特异检测出象耳豆根结线虫,检测灵敏度为1/200000头线虫DNA,比普通PCR灵敏100倍,能够直接从植物根结中检测出象耳豆根结线虫,准确度为100%。【结论】本研究以rONA—ITS序列为靶基因建立象耳豆根结线虫LAMP快速分子检测方法,具有特异性强、灵敏度高、简单、快速、经济等特征,能够从罹病植物组织中快速准确地检测出象耳豆根结线虫,具有极高的实践应用价值。关键词:象耳豆根结线虫;环介导恒温扩增;特异性;灵敏度;快

4、速检测Loop—MediatedIsothermalAmplificationAssayforRapidDiagnosisofMeloidogyneenterolobfiDirectlyfrOmInfectedPlantsHEXu.feng,PENGHuan,DINGZhong,HEWen.ting,HUANGWen-kun,PENGDe.1iang(StateKeyLaboratoryforBiologyofPlantDiseasesandInsectPests,InstituteofPlantProtection,Chi

5、neseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100193;CollegeofBiosafetyScienceandTechno~gy,HunanAgriculturalUniversity,Changsha410128)Abstract:[Objective]TheobjectiveofthisstudyistoestablisharapiddiagnosticmethodforMeloidogyneenterolobiifromtheinfectedplantsbasedonthelo

6、op—mediatedisothermalamplification(LAMP),andtoprovidetechnicalsupportsformonitoringandpreventionofM.enterolobii.[Method]TheLAMPspecificprimersweredesignedaccordingtothedistinctionoflTS(intemaltranscribedspacer)sequencesbetweenenterolobiiandotherMeloidogynespp..Ther

7、eactionconditionsofLAMP,includingtheconcentrationsofM,dNTPs,betainandreactiontimeswereoptimized,andthespecificityandsensitivityoftheLAMPweretestified.ArapidmethodforenterolobiifrominfectedplantsbyLAMPWasestablishedonthisbasis.[Result]TheoptimumconditionsforLAMPreac

8、tioncouldbecarriedoutundertheconcentrationsof5.0mmol·L。Mg抖and2.4mmol·L~dNTPs.withoutbetainand45minutesofreaction.Themethoddevelopedinthispaperwas

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