利用高通量测序分析云南豆豉中细菌群落多样性-论文.pdf

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1、利用高通量测序分析云南豆豉中细菌群落多样性李晓然，李洁，刘晓峰，冯阳，柳陈坚(昆IjJ】理r大学生命科学j技术学院，云昆[f』】650500)摘要：发酵食品是人类饮食的重要组成之一，其中豆豉风味独特，富含多种生理活性物质。微生物在食品发酵过程中起着极为重要的作用。作者选择云南豆豉为研究对象，使用焦磷酸高通量测序．可以全面地分析豆豉中的细菌群落，能够得到其中稀少群落rarebiosphere)的信息。乳酸杆茵是丰度最高的细菌，占总序列数的72％，在豆豉发酵中起重要作用；芽孢杆菌也是重要的细菌，占序

2、列总数的10％。此外，还发现了属于人类致病茵(．sllaflexneri)和植物病原茵(Erwiniapersicina)的序列，显示出传统方法制作的豆豉中存在着食品安全隐患。关键词：发酵食品；细菌；群落多样性；乳酸菌中图分类号：TS201．3文献标志码：A文章编号：1673一l689(2014)O2—0137一O6AnalysisofBacterialCommunityDiversityinFermentedSoybeanUsingPyr0sequencingLIXiao—ran，LIJie，

3、LIUXiao-feng，FENGYang，LIUChen-jian(FacultyofLifeScienceandTechnology，KunmingUniversityofScienceandTechnology，Kunming650500，China)Abstract：Fermentedfoodplaysasubstantialroleinhumandiet．Fermentedsoybeanhasspecialflavorandavarietyofphysiologicallyactive

4、substances．Microorganismsplayveryimportantrolesduringthefermentationprocess．Inthisstudy，fermentedsoybeaninYunnanprovincewasselectedtoanalyzethebacterialcommunitydiversityusinghigh——putpyrosequencingwhichcancoverthemajorityorganismsthatcomprisethe”rar

5、e”biosphere．ResultsrevealedthatLactobacilluswasthemostabundantbacteria(representing72％ofall16SrRNAgenesequences)whichwasveryimportantduringthefermentationprocessoffermentedsoybean．Bacilluswasthesecondabundant(10％)．Besides，sequencesbelongingtopathogen

6、icbacteriaofhuman(Shigellaflexneri)andplants(Erwiniapersicina)werealsodetectedwhichsuggestedhiddentroubleinfoodsafety．Keywords：fermentedfood，bacteria，communitydiversity，lacticacidbacteria收稿日期：2013一O5一O1基金项目：国家自然科学基金项目(31160309，31260397)；昆明理工大学人才培养基金项

7、目(KKSY201226110)。作者简介：李晓然(1984一)，女，河北邯郸人，理学博士，副教授，硕士研究生导师，主要从事微生物分子生态学方面的研究。E—mail：starkeyran@163．COIl通信作者：柳陈坚(1968一)，男，浙江象山人，农学博士，教授，硕士研究生导师，主要从事应用微生物与食品安全营养方面的研究。F—maj1．neWStaar8@hotmail．c0m食品5t物披术学报2014年第33卷第2期I37LIAlao—ran，etal：Anaqs,sofIJacterla

8、lL,ommumWuwers~WinFermentedSoybeanUsingPyrOsequencing发酵食品是指利用微生物加丁制造成的一行测序分析。基于PyrosequencingII测序法一次能类具有独特Jx【味营养价值的食品，诸如酸奶、奶够测定100万个长度达到400bp的核苷酸序列．其酪、泡菜、豆豉等。其中豆豉是以大豆或黄豆为主要费用只相当于使用Sanger法测定几丁个序列的费原料，经南原料处理、制曲及后发酵三阶段酿制而用：由于该方法不需要克隆．可解决构建克隆文库成，它不仅风昧独特，