实时荧光定量PCR的数据分析方法-论文.pdf

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1、技术通讯⋯一,N140LETrIvTI.ERSINBIOTECHNOLOGYVOI.ZO。o.·1lJan.,2un1l5jdoi:10.39690.issn.1009—0002.2015.01.O3l综述实时荧光定量PCR的数据分析方法易健明,屈武斌,张成岗1,21.军事医学科学院放射与辐射医学研究所,蛋白质组学国家重点实验室,全军军事认知与心理卫生研究中心,北京100850;2.安徽医科大学研究生院,安徽合肥230032[摘要]实时荧光定量PCR是目前检测目的核酸拷贝数及分析靶基因在mRNA表达水平相对变化的主流技术。研究表明,分析结果的准确性依赖

2、于数据分析方法的可靠性。我们简要综述实时荧光定量PCR的数据分析方法。[关键词]实时荧光定量PCR;绝对定量;相对定量;动力学法[中图分类号]Q89[文献标识码]A[文章编号]1009一o002(2015)01—0140—06DataAnalysisMethodsofReal__TimeFluorescentQuantitativePCRY/Jian—Ming,QuWu—Bin,ZHANGCheng—Gang,1.BeijingInstituteofRadiationMedicine,StateKeyLaboratoryofProteomics,Mil

3、itaryCognitiveandMentalHealthResearchCenter,Beijing100850;2.GraduateSchool,AnhuiMedicalUniversity,Hefei230032;ChinaCo—correspondingauthors,QUWu~Bin,E—maihquwubin@gmail.com;ZHANGCheng—Gang,E—mail:zhangcg@bmi.ac.cn[Abstract]Real—timefluorescentquantitativePCR(Q-PCR)isaneleganttech

4、niquewhichwasusedtoquantifythecopynumberofnucleicacidaswellastoanalyzethemRNAexpressionleveloftargetgene.Itwasshownthattheaccuracyofresultwasdependentonthevalidityofdataanalysismethod.Inthisarticle,thedataanaly—sismethodsofQ—PCRwerereviewed.[Keywords]real-timefluorescentquantita

5、tivePCR;absolutequantitation;relativequantitation;kineticmethod实时荧光定量PCR(real—timefluorescence1指数模型数据分析法quantitativePCR,Q—PCR)是目前检测核酸含量以及分析基因在mRNA表达水平相对变化的主流技术,指数模型数据分析法的理论基础认为nu:在产具有准确性高、特异性强、灵敏度高和操作简便等优物扩增曲线的指数扩增期(图1),反应体系内的引点,广泛应用于临床医学和生命科学等多个学科领物和底物过量,DNA聚合酶过量且保持高活性,因域]。Q—PC

6、R反应的工作原理是在PCR反应体系此PCR反应的扩增效率保持最大值不变,扩增产物内加入荧光基团(荧光探针或荧光染料),利用荧光的数量以指数形式增加,相应的指数函数表达式(方信号积累实时检测整个PCR反应过程,得到产物扩程1)为X.=X0(1+),其中表示第轮循环反应结增曲线(图1),然后采用合适的数据分析方法,计束后的扩增产物数量,表示初始模板数量,表示算初始模板数量(绝对定量)或初始模板数量的相对平均扩增效率。方程1经过对数变换后,得到方程比值(相对定量[7-8]oQ—PCR反应的数据分析方法,1.6按照定量分析的目的,可划分为绝对定量法和相对1。4

7、定量法;按照数据分析方法基于的理论基础和数学1.2模型,可划分为指数模型数据分析法和动力学法--。1.Ot-0.8LI-O6收稿日期:2014—05—09O.4基金项目:国家重点基础研究发展计划(2012CB518200);国家自然O.2科学基金(30900862,30973107,81070741,81172770,31371345);蛋白质组学国家重点实验室开放课题(SKLP—O201104,SKLP—0.OK201004,SKLP一0201002);国家科技重点专项(2012ZX09102301—016)cycle作者简介:易健明(1985一),

8、男,硕士研究生通信作者:屈武斌,(E—mail)quwubin@gmaf1.com;张成岗,(

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