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1、重庆医学2008年1月第37卷第1期91综述乙型肝炎病毒基因分型研究进展周霞综述,王宇明审校(第三军医大学西南医院感染病专科,重庆400038)关键词:乙肝;病毒;基因分型中图分类号:R512.63;Q754文献标识码:A文章编号:16718348(2008)01009103乙型肝炎病毒(HBV)是嗜肝DNA病毒,是引起急、慢性分子诊断和大范围调查,但不足之处在于非特异性扩增较高。肝炎的主要病原之一,并可导致肝硬化、肝功能衰竭和肝癌。(4)分子杂交法:该法是将基因扩增、核酸分子杂
2、交和酶联免疫HBV在复制过程中,容易发生核苷酸的错误配对,导致同一病显色融为一体,相对较为复杂,影响因素多。(5)单克隆抗体毒核苷酸序列的差异,表现为HBV不同的基因型。近年来国ELASA法:HBV基因组前S2区7种抗原决定簇的产物在不内外学者从流行病学、分子生物学、临床医学等方面对HBV同基因型中有特异的组合,利用此原理制订单克隆抗体,并行基因型进行了大量研究,表明HBV基因型与乙型肝炎的临床辣根过氧化酶标记,该方法简单易行,但对混合感染和特异性表现、治疗、预后都有密切关系。现将HBV基因型的研究进表
3、位存在突变时不能分型。几种方法各有优缺点,根据使用的展综述如下。范围和要求不同选择不同的分型方法。1基因分型历史及基因分型的方法2流行病学特点1988年Okamoto等对18株不同亚型的HBV基因序列HBV基因型呈一定的地理区域性分布,在不同人种中的两两比较后,根据核苷酸序列异源性8%,将18株HBV流行及传播的方式也存在差异。如美国和欧洲主要流行A型DNA序列分为A、B、C、D4个基因型,从而提出了HBV基因和D型,D型的分布最广泛,是地中海地区和中东的优势基因[6]型的概念。Norder等对3
4、2例HBV患者S基因序列测序结果型,也发现于亚洲少数地区。亚洲主要流行B型和C型,Bj进行分析,除证实了Okamoto的结果外,还发现了2个新的基亚型在日本HBV基因型B感染者中占主要地位,所占比例高因型E、F,并发现S基因序列的变化同全基因序列的变化一达88%,而Ba亚型流行于包括中国在内的所有其他亚洲国致,证实了F型是人类HBV最早的一族,A、D和E型亲缘关家[5]。E基因型主要见于非洲西部,基因型F多见于美国土著系较近,而B和C型较近。后来研究者又相继发现了G、H居民和玻利尼西亚。G型首先在美国和
5、法国发现,在世界上有型。迄今为止,根据HBV全基因核苷酸序列的异质性8%限的地区流行,据近年来的研究表明其可能通过特殊途径进行[7]或S区基因序列差异4%,将HBV分为A、B、C、D、E、F、G、传播,并且可能与基因型A合并感染。在我国内地主要流H8种基因型[1,2]。近年来对HBV基因型亚型的研究也逐渐行A、B、C、D4种HBV基因型,所占比例分别为1.2%、开展,如Huy等[3]通过对分别来自东南亚及远东的HBVC基39.3%、50.2%、8.1%,并且各地区流行的基因型也存在较大因型患者56例
6、前S1/前S2片断及10例全HBVC基因型序差异,北方地区以C型为主,约占81.6%;南方地区则以B型列分析认为,C基因型至少可以分为HBV/C1、HBV/C22个为主,C型也占相当比例[8]。这些地域分布不同可能与感染途[9]亚型,其中HBV/C1型来自东南亚,如越南、泰国等,HBV/C2径有一定相关性。刘映霞等研究提示了基因C型与母婴垂来自远东地区,包括日本、韩国和中国。而由于流行区域不同,直传播感染有关。研究者将A型的两种亚型命名为:Aa(a代表Asia)、Ae型(e3基因型与变异代表Europ
7、ean);B型的两种亚型分为Ba(a代表Asia)、Bj(j代基因型与1896位变异HBV最常见的变异是前C区1896[4,5]表Japan)型。位的变异,前C区的第28位氨基酸的TGG变为终止密码子HBV由双链环状DNA构成,长度约3.2kb,根据HBV全TAG,从而导致HBeAg合成终止,但HBVDNA阳性。这一基因序列的同源性>92%,或S基因序列同源性>96%,可以变异在B、C、D基因型较常见,而A基因型由于1858位的胞嘧将HBV分为不同的基因型。目前进行HBV基因型分型的方啶C与1896位的
8、G配对,排斥该点的选择变异。越南有关研法主要有:(1)全基因或S基因序列分测定型法:全基因序列最究表明,基因型B的HBeAg血清学转化率和G1896A明显高[10]为准确、可靠,但费用高,耗时长,操作复杂,不利于大规模调查于基因型C。研究,后来Norder等发现单独使用S基因序列测定进行基因基因型与C区启动子(CP)变异CP常见的变异为1762、分型的方法,初步简化了基因分型的工序。(2)聚合酶链反应1764的变异,此2点的变异为核心启动子
