ALK三种方法学比较.doc

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1、在非小细胞肺癌EML4-ALK融合基因检测中RT-PCR，IHC及FISH三种方法学比较——优化临床检测的应用背景:棘皮微管蛋白4和渐变性淋巴瘤激酶融合基因（EML4-ALK）在非小细胞肺癌中的检出率为3%-13%。为了更好的选择治疗方案，准确的检测出EML4-ALK融合基因是非常重要的。目的：比较RT-PCR，IHC，和FISH三种方法在检测EML4-ALK融合基因上的优劣势。设计：挑选46例EGFR基因野生型的肺腺癌患者（野生型，n=42,；突变型，n=4）。再分别用IHC，FISH，RT-PCR法对样本进行检测。结果：RT-PCR，FISH和IHC三种方法均检出具有EML4-

2、ALK3a/b突变的患者占4%（2例/46）。FISH和IHC在EML4-ALKvariant3a/b的检测结果完全一致的。而在EML4-ALKvariant1的检测结果存在差异。这批标本中通过RT-PCR检测出EML4-ALKvariant1的突变占20%（9/46例）。对vrriant1阳性的标本通过FISH法3次重复，其符合率仅11%（1例/9例）。同样方法，IHC法重复检测3次，其variant1阳性符合率仅为11%（1例/9例）。综合分析，在这批EGFR野生型为主的肺腺癌患者中，EML4-ALKvariant1和3a/b的总体检出率为24%（11例/46）。其中有1例标本

3、同时具有EML4-ALKvariant11与EGFR21外显子突变。结论：在EML4-ALK融合基因检测中，FISH法的结果判读受操作人员的主观影响很大，而RT-PCR是最敏感且受主观因素影响最小的方法。