分子克隆技术(1).doc

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1、分子克隆技术龟叔第一部分:填空1•质粒的三种状态:超螺旋,开环,线型2.DNA纯度:吸光值检测:检测260nin、280nm吸光值,紫外分光光度计A26a/A280=1.8-1・9;1・8最佳,低于1・8说明有蛋白质,大于1・8说明有RNAO3•分光光度计:lOD=5()ug/mlDS-DNA或l()D=40ug/mlRNAorSS-DNA4•几种工具酶:限制性内切酶,碱性磷酸酶,连接酶5.限制酶的一个活性单位(1U):原则上指在5幕1反应体系中,37C下,经过1小时的反应将1pg的DNA完全分解所需要的酶量

2、•6•引起星星活性的因素:高浓度的甘油(>5%);•酶过量(>10()U/ug);•低离子强度(v25mM);•高pH(>pH8.0);•有机溶剂(DMSO,乙醇,乙二醇,二甲基乙酰胺;•用其他二价阳离子代替Mg2+(Mn2+,Cu2+,Co2+,Zn2+)6.DNA酶切不完全的主要原因有:dna中有酶抑制剂,甲基化;操作不标准,反应条件不合适;酶活力不够。7.DNA样品中抑制酶活的污染物主要有:蛋白质、酚、氯仿、乙醇、EDTA、SDS、高浓度的盐等均能抑制酶切活性。解决方法:纯化DNA,增加酶作用的单位数,

3、增大反应体积稀释抑制剂,延长反应时间,加入聚阳离子亚精胺。8.DNA的回收纯化:1・低熔点琼脂糖2•透析带电洗脱法3.glassmilk纯化4.柱回收试剂盒9.地高辛(DIG)是灵敏度高、非放射性核酸标记检测体系。dig检测灵敏度接近同位素而无放射性危险、相比荧光则不需要特殊检测设备,相比生物素则没有样本内源干扰之苦,很适合用于核酸非放标记检测。第二部分:简答1、SolutionK2、3的作用solutionI重悬细菌solutionIL其中的SDS[坏细胞壁、膜,使细胞内容物释放出来,NaOH使DNA变性、

4、碱基对打开,使宿主染色体DNA双链分开,而闭合环状的质粒DNA处于拓扑缠绕状态,两个环并不分开SolutionIII中和后,宿主DNA由于很大,碱基还未来得及配对就在冰冷的条件下与SDS、蛋白质、高分子量的RNA等缠绕在一起沉淀下来,而质粒DNA由于很小且双链未分开,能够迅速配对重新形成超螺旋,处于溶解状态2、移液器的使用注意事项a设定移液体积,装配移液枪头。b垂直吸液,慢吸慢放c吸有液体的移液枪不宜平放。d使用后调回最大量程,放回3、尼龙膜、硝酸纤维素膜的异同点尼龙膜更多是用于核酸的转移,也有见于蛋白印迹,

5、比如dotblot,比较于NC膜来说,它的优点是结合力强,特结实又柔软且不易卷曲,机械强度大,便于操作,缺点是背景高—由于尼龙膜电荷密度高,使得非结合区的封闭比疏水性NC膜困难,对于灵敏度高的检测方法,背景问题尤为突出(据分子克隆III说通过热处理的酪蛋白和1%聚乙烯毗咯烷酮延长封闭时间可以改善),而且当转移缓冲液中存在有SDS时蛋白质就容易从尼龙膜上泄漏(通过甲醛固定可以缓解这一情况)。硝酸纤维素膜是蛋白印迹最广泛使用的转移介质,对蛋白有很强的结合能力,而且适用于各种显色方法,NC膜很容易封闭,也不需要特别

6、严谨的清洗条件。转移到NC膜上的蛋白在合适的条件下可以稳定保存很长时间,不过要注意的是纯的硝纤膜在比较脆,又容易卷,操作要小心,不适合用于需要多次重复清洗的用途——因为经不起多次“折磨I

7、nc膜尼龙膜灵敏度和分辨率低恢高结合能力80-110ug/cm2>400ug/cm2林料质地干的NC膜易脆秋而结实粋剂耐受性无无快作程序缓冲液祠湿,避免气泡缓冲液祠湿檢测方式當规染色,可用放射性和非放射性检则不能用阴离子染料适用范国0.45um—般蛋白0.2um—分子里小于20kD蛋白O.lum—分子里小于7kD蛋白低浓度小

8、分子蛋白、酸性蛋白、糖蛋白和蛋白多糖(主要用在核酸检则中)价格价格较便宜便宜4、杂交、预杂交的注意事项预杂交及杂交时保证buffer覆盖膜如果尼龙膜要多次探测,务必保证在任何时候都不要让尼龙膜干燥使用正确的杂交温度(使用DIGEasyHvb,DNA:DNA37—42°C,RNA:RNA68°C,RNA:DNA50°C)■为防止尼龙膜干燥,在准备好下一步处理用试剂之前不要倒掉正在用的溶液■使用合适的探针浓度■探针用之前变性■如果探针与靶DNA的同源性低于80%,热洗时应使用较低的温度(如60°C)■热洗之前应将

9、洗膜液预热到热洗所需温度5、如何判断提取的RNA的质量1)检测RNA溶液的吸光度280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R),1.8-1.92)琼脂糖凝胶电泳:电泳的目的是在于检测28S和18S条带的完整性和他们的比值,或者是mRNAsmear的完整性。一般的,如果28S和18S条带

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