紫草素与胸腺嘧啶相互作用的理论研究.pdf

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1、泸州医学院学报2014年第37卷第4期374JoumalofLuzhouMedicalCoUegeVo1．37No．42014紫草素与胸腺嘧啶相互作用的理论研究木王译伟，刘源，蔡延森，蔡皖飞，郭建敏(泸州医学院基础医学院化学教研室，四川泸l、1，646000；四川师范大学化学与材料科学学院)摘要目的：对紫草素与胸腺嘧啶形成的复合物进行了结构优化，比较它们的稳定性和活性，为实验设计合成活性更高的紫草素类抗癌药物指明方向。方法：采用密度泛函理论的M06方法在6-311++G基组水平下对研究对象进行计算，同时我们还应用了分子中的原子(AIM)理论和自然键轨道(NBO)~A论对得到的这

2、些稳定复合物中的氢键的性质和特征进行了分析。结果：得到了14个稳定的紫草素一胸腺嘧啶复合物．发现复合物2的结构是最稳定的。结论：计算结果与临床试验结果一致，该方法用于指导该类化合物的设计合成是可行的。关键词紫草素：胸腺嘧啶；密度泛函理论中图分类号0641；R9文献标识码Adoi：10．3969~．issn．1000—2669．2014．04．008TheoreticalstudyontheinteractionbetweenshikoninandthymineWangYiwei，LiuYuan，CaiYansen，CaiWanfei，GuoJianminDepartmentof

3、Chemistry，LuzhouMedicalCollege；CollegeofChemistryandMaterialScience，SichuanNormalUniversityAbstractObjective：Tostructurallyoptimizetheshik0nin—thyminecomplexesandcomparetheirstabilityandactivityinordertoguidethedesignofsynthesizingmorepotentanti-cancerderivativesofshikonin．Meth-ods：Densityfu

4、nctionM06methodwasusedtooptimizetheconfigurationofshikonin—thyminecomplexat6—311++G料basis．Meanwhiletheoriesofatomsinmolecules(AIM)andnaturalbondorbital(NBO)wereutilizedtoinvestigatethenatureandcharacteristicsofhydrogenbondsinvolvedinallthestablecomplexes．Results：Four—teenstabilizedcomplexesw

5、ereobtainedandcomplex2isthemoststable．Conclusion：Theealeulatderesultisinaccordancewiththatofclinicaltest，indicatingthefeasibilityofthisresearchmethodtoguidethedesigningofthiskindofchemicalcompounds．KeywordsShikonin；Thymine：Densityfunctiontheory胸腺嘧啶是生物遗传物质DNA和RNA的基本选提供有价值的信息【3-51。药物分子与DNA相互作单

6、元之一．在生物的遗传与变异方面扮演重要角色．用的理论研究已有报道[6-9]，Siavash等啕采用密度泛尤其在DNA紫外损伤而导致皮肤癌和其他疾病过函理论的B3LYP方法对抗癌药物加替沙星与DNA程中起着决定性的作用[11。各种抗癌药物，它们的作碱基间的相互作用机制进行了研究：Lv等[91采用相用机制一般都是通过不同形式与DNA及RNA相互同的方法研究了普鲁卡因分子与DNA碱基间的相作用，从而抑制DNA的复制和合成，达到抗癌的作互作用；我4f3+1,组曾对儿茶素、木犀草素、喜树碱等用[21。因此研究药物分子与DNA碱基一胸腺嘧啶的相天然抗癌药物分子与DNA碱基一胞嘧啶的相互作用

7、互作用有助于人们对DNA与药物分子相互作用方进行了研究no_。式的了解。可以阐述一些抗肿瘤、抗病毒药物及致癌紫草为临床常用中药，其味苦、性寒，具有凉血、物的作用机理，为新型药物的设计、修饰、合成和筛活血、解毒和透疹的功效。从紫草植物中分离到紫草萘醌类、酚酸类、生物碱类、苯酚及苯醌类、三萜酸及四川I省科技支撑计划项目(NO：2014SZ0071)甾醇类、黄酮类以及多糖类等物质【l3】。其中最引人注作者简介：王译伟(1984-)，女，讲师，硕士目的是紫草萘醌类化合物，这类物质不仅是紫草的通讯作者