PBS简要使用说明.pdf

《PBS简要使用说明.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在应用文档-天天文库。

1、PBS作业调度系统简要使用说明提交作业以test01用户登录到lxcn01..04任一节点,并ssh到lx0110上使用qsub命令行提交作业下面是418号作业的输出使用脚本提交作业脚本内容如下：提交作业及查看作业状态（要查看列详尽作业相关请执行qstat-fjob_id）：下面的为419号作业标准输出部分截图作业提交脚本编写参考其实质是shell脚本，只不过添加了一些PBS参数或设定而已常用的PBS选项有：选项描述参考#PBS-NmyJob指定作业名，默认为脚本名#PBS-l指定作业资源，此处为四个节点每个节点２个nodes=4:ppn=2虚拟处理器#PBS-qqueuenam

2、e绑定作业队列#PBS-l每个作业运行时能使用的最大wall-clocktimewalltime=01:00:00#PBS-o指定作业标准输出文档及路径mypath/my.out#PBS-e指定作业标准错误输文档及路径mypath/my.err#PBS-joe标准输出与标准错误输出合流#PBS-W在作业开始前把file_list复制到计算节点stagein=file_list#PBS-W在作业完成后把file_list复制到计算节点stageout=file_list#PBS-mb在作业开始时给用户发送邮件#PBS-me在作业结束时给用户发送邮件#PBS-ma在作业中断时给用户发

3、送邮件允许用户对在同一行上带有相同标志的命令#PBS-mba进行分组，否则只有最后一个命令被执行#PBS-rn指定在作业执行失败后不再重试#PBS-V导入所有环境变量这里要特别说明一下是的#PBS-l，其格式与qsub-l是一样的，下面举例说明ex1:qsub-lnodes=5等价于脚本中的#PBS-lnodes=5,表示使用集群中任意五个节点来执行该作业ex2:qsub-lnodes=2:server+14等价于脚本中的#PBS-lnodes=2:server+14,表示使用集群中的两个server节点与另外十四个节点来执行该作业ex3:qsub-lnodes=4:ppn=2等

4、价于脚本中的#PBS-lnodes=4:ppn=2，表示该作业需要四个节点且每个节点都有两个虚拟处理器空闲ex4:qsub-lnodes=lx0111:ppn=4+lx0112:ppn=2等价于脚本中的#PBS-lnodes=lx0111:ppn=4+lx0112:ppn=2，表示该作业需要lx0111上的四个空闲处理器与lx0112上的两个空闲处理器来共同完成注：更详细用法请参照官方手册常用命令pbsnodes:查看节点状态相关参数有：-a列出所有结点及其属性，属性包括“state”和“properties”-o将指定结点的状态标记为“offline”。这将帮助管理员暂时停止某

5、些结点的服务-l以行的方式列出被标记的结点的状态，如-lfree，-loffline-c清除结点列表中的“offline”或“down”状态设置，使结点可以被分配给作业-r清除指定结点的“offline”状态qsub:作业提交，前面已有举例qdel:取消作业，指定相关作业的ID号即可，非结束态的作业才能被取消qhold:挂起作业qrls:取消挂起qstat:查看作业状态qstat[-f][-a][-i][-n][-s][-R][-Q][-q][-B][-u]参数说明：-fjobid列出指定作业的信息-a列出系统所有作业-i列出不在运行的作业-n列出分配给此作业的结点-s列出队列管

6、理员与scheduler所提供的建议-R列出磁盘预留信息-Q操作符是destinationid，指明请求的是队列状态-q列出队列状态，并以alternative形式显示-auuserid列出指定用户的所有作业-B列出PBSServer信息-r列出所有正在运行的作业-Qfqueue列出指定队列的信息其中，有以下几种状态C：作业完成E：作业退出H：作业挂起中Q：作业排队中R：作业运行中T：作业被移走W：作业等待中S：作业中断更多更详细内容：DoNotTouch!!!通过队列资源控制实现对用户可用资源的控制先建立一个队列test00并指定队列成员能使用的最大CPU核数为100,命令如下

7、qmgr-c'createqueuetest00'qmgr-c'setqueuetest00queue_type=Execution'qmgr-c'setqueuetest00resources_max.procct=100'qmgr-c'setqueuetest00acl_group_enable=True'qmgr-c'setqueuetest00acl_groups=users'qmgr-c'setqueuetest00enabled=True'qmgr-c'setqueu