Pubmed全攻略使用教程.doc

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1、PubMed检索系统简介PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.NationalLibraryofMedicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向M

2、EDLINE移加一次。PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINErecordinprocess]的说明，并标有[Recordassuppliedbypublisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science或Nature）上发表的地理学文章等。PubMed系统的主要特点1.词汇自动转换功能（AutomaticTermMapping）在PubMed主页的检

3、索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。（1）MeSH转换表（MeSHTranslationTable），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitaminh"，系统将其转换成"Biotin[MeSHTems]ORVitaminh[Textword]"后进行检索。（2）刊名转换表（JournalTanslationTable），包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全

4、称转换为“MEDLINE缩写[JournalName]"后进行检索。如：在检索提问框中键入：“newenglandjournalofmedicine",PubMed将其转换为"NEnglJMed[JournalName]"后进行检索。（3）短语表（Phraselist）。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS:UnifiedMedicalLanguageSystem）和补充概念（物质）名称表[SupplementaryConcept(Substance)Name]。如果PubMed系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的

5、词，就会查找短词表。（4）著者索引（AuthorIndex）。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语，PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND）在全部字段中检索。如："singlecell"，系统就会自动将其分成两个词：“single“和“cell”检索，其检索表达式为：“singleANDcell”。要查验检索词的转换情况，可点击“Details”键。2.截词检索功能PubMed允许使

6、用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入“bacter*”，系统会找到那些前一部分是bacter的单词（如bacteria,bacterium,bacteriophage等），并对其分别进行检索。如果这咱词少于150个，PubMed会逐个词检索，若超过150个（如：Staph*）,PubMed将显示如下警告信息：“Wildcardsearchfor'term*'usedonlythefirst150variations.Lengthentherootwordtosearchforallendings"。截词功能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括“infe

7、ctions”，但不包括“infectioncontrol”等。使用截词功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。3.强制检索功能如上所述，在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”，系统会高速用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索；但是，当键入的词语无匹配词时，PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程，若仍然没有匹配词，系统就将短语分解成单词，再用AND联在一起在全部字段中检索。很明显，这样检索的结果是不符合用户要求的。因此，PubMed允许