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时间:2019-07-13
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1、PubMed的使用生物信息学2班A组内容提要:PubMed的基本使用方法PubMed的高级使用方法PubMed与MyNCBI一、PubMed的基本使用通过作者搜索在搜索框中输入作者姓及名首字母,不要在搜索框中输入标点,点击Go。如果你只知道作者的名字而不知道姓氏,需要使用作者搜索标签[AU]。使用Limit选框可以作者搜索引擎,输入你知道的名字会自动生成含有姓氏的姓名。使用刊物名搜索在搜索框中输入刊物名或者题目的缩写,可以附加任何相关条目,点击Go。与搜索姓名时相同同样可以运用Limit选框,同样在刊物搜索引擎中会自
2、动生成完整的刊物名,如下:PubMed把所有可检索关键词按字母顺序排列,方便读者快速查找。1点击Preview/Index框(几个选框的内容)2在页面底部选择检索领域3在检索框中输入关键词,如果想检索所有领域,检索框为空。4点击Index5在检索词后的括号内会显示关键词使用频率6选择相应的词条,可以使用布尔逻辑语法(系统从左到右识别优先级别)。7添加其他的检索条目,进一步精确描述检索对象,缩小检索范围。预测检索结果(Preview),在展开检索结果之前预览引用频率:1点击Preview/Index栏2在检索框
3、中输入检索关键词3点击Preview.就可以看见检索内容4如果想看检索频率,就点击它的链接搜索参考文献前,可以用Preview进一步限制检索范围1在检索框中输入检索关键词2点击预览,会看到现实的结果3按这种方法,把范围缩小到可以准确找到结果的程度注:Preview只显示History中的最近三个检索词,检索历史包括19条历史检索信息查看搜索历史记录点击History按钮,会显示搜索的运行结果。例如:某次检索的运行结果为:#18PMCLinksforPubMed(Searchavianinfluenza)12:28:
4、03644,点击蓝色的结果数644,可以查看搜索结果。点击搜索号码(例如本例中的#18)可以打开选项菜单,包括布尔逻辑符AND,OR、NOT,以及Delete、Go、Details等。Clipboardclipboard可以暂时保存所检索的文献,最多可保存500条,8小时之后就会被删除。要想永久无限量的保存检索文献需要注册MyNCBI。Details显示检索的一些细节:解读搜索结果PubMed的搜索结果以汇总的方式罗列出来,看以下的搜索结果分析表:获得摘要点击文章的标题阅读摘要,如果显示“Noabstractava
5、ilable”说明没有摘要供阅读。二、PubMed的高级使用方法1、想使搜索的效率更高可以使用一些搜索域和标签来缩小搜索范围,这些标签如下:Affiliation[AD]ArticleIdentifier[AID]AllFields[ALL]Author[AU]CommentCorrectionsCorporateAuthor[CN]CreateDate[CRDT]EC/RNNumber[RN]EntrezDate[EDAT]Filter[FILTER]FirstAuthorName[1AU]FullAuthorNam
6、e[FAU]FullInvestigatorName[FIR]GrantNumber[GR]Investigator[IR]Issue[IP]JournalTitle[TA]Language[LA]LastAuthor[LASTAU]LocationID[LID]MeSHDate[MHDA]MeSHMajorTopic[MAJR]MeSHSubheadings[SH]MeSHTerms[MH]NLMUniqueID[JID]OtherTerm[OT]OwnerPagination[PG]PersonalNameasSu
7、bject[PS]PharmacologicalActionMeSHTerms[PA]PlaceofPublication[PL]PMCID&MIDPublicationDate[DP]PublicationType[PT]SecondarySourceID[SI]Subset[SB]SubstanceName[NM]TextWords[TW]Title[TI]Title/Abstract[TIAB]TransliteratedTitle[TT]UID[PMID]Volume[VI]2、如何使用SingleCitatio
8、nMatcher在PubMed工具条中点击SingleCitationMatcher,通过它可以实现一对一的检索。输入要检索的单一信息,系统会根据PubMed中的内存对关键词进行自动匹配,比如作者姓名的全拼和简写,第一作者,所有作
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