节瓜及近缘葫芦科作物种质资源rDNA-ITS序列分析与系统进化研究.pdf

《节瓜及近缘葫芦科作物种质资源rDNA-ITS序列分析与系统进化研究.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、植物遗传资源学报2014，15(5)：1096．1106JournalofP1antGeneticResourcesDOI：10．13430／j．cnki．jpgr．2014．05．026节瓜及近缘葫芦科作物种质资源rDNA．ITS序列分析与系统进化研究赵芹，谢大森，何晓明，陈仁芳，彭庆务，罗少波(广东省农业科学院蔬菜研究所，广州510640；2西南大学生物技术学院／农业部蚕桑学重点开放实验室，重庆400715)摘要：通过PCR扩增获得了56份节瓜种质资源及7份相关瓜类种质资源的rDNA．ITS序列．测序后结合GenB8nk中34份葫芦科作物的ITS序列，利用生物信息学软件分析序

2、列长度、变异位点、G+C含量、遗传分歧、同源性百分比差异、系统进化关系。节瓜种质资源ITS基本序列全长612～617bp，G+C含量59．97％一61．07％，供试材料间共96个变异位点，其中一些变异位点有明显的种性特征，可作为特异DNA指纹鉴别位点。基于ITS序列差异，56份节瓜材料聚为5大类、其中12—2—3材料为单独一个分支，黑毛节瓜H2251为第二分支，H5FA为第三分支，剩余节瓜材料聚为第四、五分支。节瓜材料12—2—3与其他材料遗传分歧最大，农艺性状与抗性也差异较大，可用作节瓜杂交育种的亲本以扩大选择范围。节瓜的系统位置排列在lndomelothriablumei(G

3、U799496)与Dactyliandrawelwitschii(HQ201973)之间，与Indomelothriablumei亲缘关系最近；Mrbayes软件分析表明，葫芦科作物Zehneriathwaitesii(AM981145)、Ctenolepiscerasiformis(AM981142)、Cucu．mismelo(AM36377)、Dactyliandrawelwitschii(HQ201973)、Trochomeriamacrocarpa(AM981141)最原始，系统进化顺序为甜瓜一南瓜、栝楼、苦瓜、丝瓜、西瓜、蒲瓜一冬瓜、节瓜一黄瓜。本研究通过分析节瓜及近缘

4、葫芦科作物种质资源的ITS序列，为其系统进化、DNA指纹鉴男l】、育种亲本选择及比较组学分析等提供了分子生物学依据。关键词：节瓜；葫芦科作物；种质资源；rDNA．ITS；序列分析；系统进化AnalysisontheInternalTranscribedSpacers(ITS)SequencesandPhylogeneticsofChieh—quaanditsAfinisCucurbitaceaeGermplasmResourcesZHAOQin，XIEDa—sen，HEXiao—ming，CHENRen—fang，PENGQing—WU，LUOShao·bo(VegetableR

5、esearchInstitute，GuangdongAcademyofAgriculturalSciences，Guangzhou510640；KeySericulturalLaboratoryofMin~tryofAriculture／CollegeofBiotechnology，SouthwestUniversity，Chongqing400715)Abstract：56chieh—quaand7othercucurbitsgermplasmresourceswerecollectedfromsouthChina，subsequentlyrDNA—ITSamplieation

6、andsequencingwereperformed．CombiningITSsequencesofseveralcucurbita’ceousplantsdownloadedfromGenBank，thelengths，variablesites，G+Ccontent，geneticdivergences，homolo—gies，phylogeneties，andsystempositionwereanalyzedbybioinformaticsoftwares．ITScompletesequencesofchieh．quaanditsaffiniscucurbitaceaeg

7、ermplasmresourceswereobtained．Thefull—lengthofehieh—quaITSwas612—617bp．G+Ccontentwere59．97％一61．07％．Thesequencealignmentresultsshowedthattherewere94variablesites(ITS1：47，ITS2：40，5．8S：7)amongchieh—quagermplasmresources，someofwhichhadsignificant