胃癌差异表达蛋白的蛋白质组学分析.pdf

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1、MedicalScienceJournalofCentralSouthChina，January2015，Vo1．43，No．1DOI：10．15972／j．cnki．43—1509／r．2015．01．004·基础医学·胃癌差异表达蛋白的蛋白质组学分析李素云，陈苏琼，谢远杰，张志伟，贺修胜(1．南华大学肿瘤研究所，湖南衡阳421001；2．南华大学医学院解剖教研室)摘要：目的筛选与鉴定胃癌差异表达蛋白质分子。方法采用定量蛋白组学方法，通过同位素iTRAQ标记胃癌与正常胃黏膜组织总蛋白，然后用强阳

2、离子交换／反相液相色谱(SCX／nanoHPLC)进行电喷雾串联质谱分析(ESI-MS／MS)，获得两组样本的多肽及相对丰度信息，通过数据库搜索与比对，鉴定差异表达蛋白质。结果共鉴定出319个蛋白质，其中表达差异在2倍以上的88个，在胃癌中呈高表达的12个、呈低表达的76个。按蛋白质功能分为七大类：细胞骨架蛋白、分子伴侣、信号传导、生物代谢、凋亡，蛋白质合成与代谢类及其他蛋白质。结论成功筛选了胃癌差异表达蛋白质分子，这些蛋白质的表达改变，可能参与了胃癌的发生和发展。关键词：胃癌；iTRAQTM同位

3、素标记相对和绝对定量；多维液相色谱：串联质谱中图分类号：R735．2文献标识码：AProteomiesAnalysisofDiferentialExpressionProteinsinGastricCarcinomaLISuyun，CHENSuqiong，XIEYuanjie，etal(CancerResearchInstitute，UniversityofSouthChina，Hengyang，Hunan421001，China)Abstract：ObjectiveToidentifythedi

4、fferentialexpressionproteinsbetweengastricadenocarcinomaceils(GAC)andnormalgastricadenoepithelialcells(NGAC)，andtolookforearlydiagnosisofGastriccarcinoma(GC)specificpro—teins．MethodsThetotalproteinswereextractedfromthetissues．Thetotalproteinslabeledwi

5、thdifferentiTRAQstableisotopeweresegregatedwithNano-RPLC—MS／MS，toobtainrelativeabundanceofpeptidesinformation．Thedifl'erentialex—pressionproteinswereidentifiedthroughSWISSPORTdatabase．ResultsThroughQuantitativeproteomicanalysisofGACandNGAC，319proteins

6、wereidentifiedwithMS，88ofwhichweredifferentialexpressionproteins．Therewere12Up—regulationand76Down—regulationproteinsinGAC．Theidentifiedproteinscanbedividedintosevengroupsaccordingtoproteinfunction：biologicaloxidation，signaltransduction，proteincomposi

7、tionandmetabolism，molecularchaperones，cy—toskeleton，apoptoticandothers．ConclusionThedifferentiallyexpressedproteinmoleculesweresuccessfullyscreenedandidentifiedingastriccarcinoma，andtheexpressionchangingoftheseproteinsmaybeinvolvedinthegenesisanddevel

8、—opmentofgastriccarcinoma．Keywords：gastriccarcinoma；iTRAQTM；multidimensionalliquidchromatography；tandemMassspectrometry我国是胃癌的高发区，每年死于胃癌的人数约床所使用的肿瘤诊断标记物有CA19-9、CEA、CA72—为16万人，因此，提高胃癌的诊疗水平，是我国肿瘤4。，但这些标记物对于早期胃癌检测缺乏特异基础及临床研究工作者所面临的挑战¨]。现今临性，仅能用作为术