烟草根际与非根际细菌的系统发育多样性研究.doc

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1、烟草根际与非根际细菌的系统发育多样性研究　　摘要：运用纯培养法和基于１６ＳｒＲＮＡ基因序列的系统发育分析对烟草根际与非根际土壤中可培养细菌多样性进行了研究。用ＮＡ、１／１０ＮＡ、Ｒ２Ａ、１／１０Ｒ２Ａ培养基分别从烟草根际与非根际土壤中分离了１７株与２８株细菌。１６ＳｒＲＮＡ序列分析结果表明，１７株根际细菌可分为５个属６个种，７株属于厚壁菌门，４株属于变形菌门α－变形菌纲，４株属于放线菌门，２株属于变形菌门β－变形菌纲；２８株非根际细菌可分为９个属１７个种，１５株属于厚壁菌门，６株属于放线菌门，４株属于变形菌门β－变形菌纲，２株属于变形菌门α－变形菌纲，１株属于拟杆菌门。芽

2、孢杆菌属为优势菌属。１株细菌可能为新种或属。研究表明烟草根际与非根际土壤中含有较为丰富的微生物资源。　　关键词：烟草；可培养细菌；根际；非根际；１６ＳｒＲＮＡ；系统发育分析；多样性　　中图分类号：ＴＳ４１＋４；Ｑ９３－３３１文献标识码：Ａ文章编号：0439－８11405－1058-05　　　　PhylogeneticDiversityofCulturebleBacteriainRhizosphereandNon-rhizosphere　　ofTabacco　　　　ＬＩＮＦｅｎｇ－ｍｉｎa，ＪＩＷｅｎ－ｘｉｕb，ＬＩＨｕ－ｌｉｎa　　　　　　Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｃｕｌｔｕｒｅ

3、ｂｌｅｂａｃｔｅｒｉａｗｅｒｅｉｓｏｌａｔｅｄｆｒｏｍｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅａｎｄｎｏｎ－ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅｏｆｔａｂａｃｃｏｓｏｉｌｂｙｃｏｎｖｅｎｔｉｏｎａｌｃｕｌｔｕｒｅ－ｄｅｐｅｎｄｅｎｔｍｅｔｈｏｄａｎｄｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄｂｙｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓｂａｓｅｄｏｎ１６ＳｒＲＮＡｇｅｎｅｓｅｑｕｅｎｃｅｔｏｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｔｈｅｉｒｄｉｖｅｒｓｉｔｙ．ＵｓｉｎｇＮＡ，１／１０ＮＡ，Ｒ２Ａａｎｄ１／１０Ｒ２Ａｍｅｄｉｕｍ，１８ａｎｄ２７ｂａｃｔｅｒｉａｓｔｒａｉｎｓｗｅｒｅｉｓｏｌａｔｅｄｆｒｏｍｔｗｏｓａｍｐｌｅｓｏｉｌｒｅｓｐｅｃｔ

4、ｉｖｅｌｙ．Ｔｈｅ１６ＳｒＲＮＡｒｅｓｕｌｔｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅ１８ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅｂａｃｔｅｒｉａｉｓｏｌａｔｅｓｂｅｌｏｎｇｅｄｔｏ９ｓｐｅｃｉｅｓｏｆ５ｇｅｎｕｓ，ｏｆｗｈｉｃｈ８ｗｅｒｅｍｅｍｂｅｒｓｏｆＦｉｒｍｉｃｕｔｅｓ；４ｗｅｒｅｉｎＡｌｐｈａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ；４ｂｅｌｏｎｇｅｄｔｏＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ；ａｎｄ１ｂｅｌｏｎｇｅｄｔｏＢｅｔａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ．Ｔｈｅ２７ｎｏｎ－ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅｂｅｌｏｎｇｅｄｔｏ１６ｓｐｅｃｉｅｓｉｎ９ｇｅｎｕｓ，ａｎｄｉｎｃｌｕｄｉｎｇｍｅｍｂｅｒｓｏｆＦｉｒｍｉｃｕｔｅｓ，

5、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ，Ｂｅｔａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ，Ａｌｐｈａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ，ａｎｄＢａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓｐｈｙ．ｎｏｖ．．Ａｍｏｎｇｔｈｅｓｅｂａｃｔｅｒｉａ，Ｂａｃｉｌｌｕｓｗａｓｔｈｅｄｏｍｉｎａｎｔｇｅｎｕｓ．１ｂａｃｔｅｒｉｕｍｉｓｏｌａｔｅｗａｓｃａｎｄｉｄａｔｅｎｅｗｓｐｅｃｉｅｓｏｒｇｅｎｕｓ．Ｔｈｅｈｅｒｅｗｅｒｅａｂｕｎｄａｎｔｓｐｅｃｉｅｓｄｉｖｅｒｓｉｔｙａｎｄｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｂａｃｔｅｒｉａｉｎｔｈｅｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅａｎｄｎｏｎ－ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅｏｆｔａｂａｃｃｏｓｏｉｌ

6、．　　Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｔｏｂａｃｃｏ；ｃｕｌｔｉｖａｂｌｅｂａｃｔｅｒｉａ；ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅ；ｎｏｎ－ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅ；１６SｒＲＮＡｇｅｎｅ；ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓ；ｂａｃｔｅｒｉａｌｄｉｖｅｒｓｉｔｙ　　　　植物根际是土壤－植物生态系统物质交换的活跃界面，土壤细菌既是土壤微生物区系的重要组成部分，也是土壤物质流和能量流的主要推动者［１］。根际中细菌种类丰富，存在着许多对植物有益的细菌群落，土壤微生物种类、数量以及分布已成为评价土壤生态环境质量的重要指标［２］。非根际微生物的研究虽然不多，但是有着广阔的发展前景。当前，充分利用分子生物学技

7、术，通过对非根际环境的１６ＳｒＲＮＡ等的检测，鉴定出较快分解的凋落物区系的微生物种类。研究特定凋落物的分解和特定种的微生物间相互的关系以及机理，对土壤微生物学、土壤营养学和植物生理学及其交叉学科都有一定的意义［３－５］。　　近年来，各国学者对烟草土壤微生物进行了大量的研究，包括微生物种类和数量［６，７］、农艺措施对土壤微生物的影响［８，９］和土壤功能菌的研究和开发［１０］等，目前，对烟草根际和非根际土壤可培养细菌系统发育多样性的研究尚属空白。　　本文采用稀释平板法分离培养烟草根际和非根际土壤中的细菌，并依据１６ＳｒＲＮＡ序列特