利用RIL群体对精米氨基酸含量的QTL定位.doc

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1、利用RIL群体对精米氨基酸含量的QTL定位  摘要:通过一个重组自交系及已构建好的遗传图谱,研究稻米氨基酸含量的QTL定位。结果表明,通过Winqtlcart软件发现多个控制不同氨基酸合成的区段,其中位于第一染色体的RM259~RM580片段影响了多种氨基酸的含量。通过氨基酸含量相关QTL定位的研究,为将来的分子标记辅助选择改良稻米营养品质打下了基础。  关键词:水稻;重组自交系;氨基酸;赖氨酸;数量性状基因座;营养品质  中图分类号:S786文献标识码:A文章编号:0439-811416-340

2、8-04    IdentificationofQTLforAminoAcidContentinMilledRicebyRIL    ZHOUXu-sheng,HEYu-qing      Abstract:ThequantitativetraitlocianalysisforaminoacidcontentinOryzasativaL.wascarriedoutaccordingtotherecombinantinbredlineanditsgeneticmap.Theresultsshowed

3、thatseveralsectionsforcontrolingdifferentaminoacids’sythesiswerefoundbysoftwareofWinqtlcart.TheQTLintheintervalofRM259~RM580onchromosome1influencedsomecontentsofaminoacids.Asaresult,researchingonQTLofaminoacidcontentprovidedapathwaytoimprovenutritiont

4、raitofricebymarker-assistedselection.  Keywords:OryzasativaL.;recombinantinbredline;aminoacid;lys;quantitativetraitloci;nutritiontrait    水稻是我国主要粮食作物之一,随着人民生活水平的提高,人们对稻米的营养功能越来越重视。人体主要通过食物摄取所需的氨基酸,尤其Lys在谷物中含量较低,且在加工过程中易被破坏而缺乏,因此被称为第一限制性氨基酸,也是衡量稻米营养品质的

5、重要指标[1,2]。但是由于营养性状的复杂性,容易受到环境的影响以及测定方法的复杂性,对于稻米氨基酸含量的改良一直比较困难。随着分子标记及遗传图谱的研究深入[3,4],复杂性状的遗传研究成为可能[5,6]。同时由于QTL定位的准确性很高,因此一些科学家建议将初步定位的QTL直接用于育种,大幅降低育种成本[7,8]。利用中国香稻以及川香29B为亲本构建重组自交系群体,研究控制精米氨基酸含量的QTL,为稻米氨基酸含量的遗传研究打下基础,也为将来的分子标记辅助选择改良稻米营养品质提供理论依据。  1材料

6、与方法  1.1试验材料及田间管理  研究所利用的群体是由水稻亲本材料川香29B和中国香稻杂交后利用单粒传培育的235个F9、F10重组自交系。亲本之一川香29B是由四川省农业科学院培育而成的优良保持系,其不育系川香29A具有香味,开花习性好和异交结实率高等特点。中国香稻是中国水稻研究所培育而成的香稻优质晚籼品种。  水稻亲本材料川香29B和中国香稻及其杂交后利用单粒传培育的235个F9、F10重组自交系分别于2008年、2009年种植于华中农业大学试验农场,每个株系种植1行,每行10株,株行距为

7、16.5cm×26.4cm。  1.2性状的考察  1.2.1米粉的制备稻米经自然干燥后室温保存3个月,于4℃冰箱中保存。取25g左右的稻谷脱壳,碾出精米,再打成精米粉,将米粉过100目筛,装入封口塑料袋中,置于-20℃冰箱中保存。  1.2.2精米氨基酸的测定样品须保证均匀,过60~80目筛。根据样品粗蛋白质含量,确定大体称样量,称取50~100mg左右样品于水解管中,加入6~8mL的6mol/L盐酸。液氮冷却,充入氮气,封口。110℃烘箱处理22h。消化后的样品过滤后,去离子水定容至50mL。

8、取200μL样品,真空干燥后加入200μL0.02mol/L的盐酸,振荡均匀。离心后吸150μL上清液于内插管内,以氨基酸测定仪检测。  1.3连锁图谱和QTL的定位  利用Mapmaker/EXP3.0软件构建了一张包含144个SSR标记的分子标记遗传连锁图谱[9-12]。以构建好的分子标记遗传连锁图谱为基础,利用WinQTLCart软件对17种氨基酸性状进行QTL定位。采用LOD值2.0作为阈值来判断QTL存在与否,若标记区间LOD≥2.0则认为该区间存在1个控制该性状的QTL

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