真核生物启动子.doc

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1、真核生物启动子 由于真核生物中有三种不同的RNA聚合酶,因此也有三种不同的启动子,其中以启动子Ⅱ最为复杂,它和原核的启动子有很多不同:(1)有多种元件:TATA框,GC框,CATT框,OCT等;(2)结构不恒定。有的有多种框盒如组蛋白H2B;有的只有TATA框和GC框,如SV40早期转录蛋白,(3)它们的位置、序列、距离和方向都不完全相同,(4)有的有远距离的调控元件存在,如增强子;(5)这些元件常常起到控制转录效率和选择起始位点的作用;(6)不直接和RNApol结合。转录时先和其它转录激活因子相结合,再

2、和聚合酶结合。    (一)Ⅱ类基因的启动子和调控区Ⅱ类基因的启动子由核心元件和上游元件组成。核心元件包括TATA框和转录起始位点附近的启始子(initiator,Inr)。在起始点一般没有同源序列,但mRNA的第一个碱基倾向A,另一侧翼由Py组成(在原核启动子的CAT起始序列也有这种情况),称为起始子(initiator),一般由PY2CAPY5构成,位于-3~+5,可能提供RNApolⅡ识别。无论TATA是否存在,Inr对于启动子的强度和起始位点的选择都是十分重要的。现已分离纯化了与Inr特异结合的蛋

3、白质因子。 1. 核心元件TATA框合又称Hogness框,Goldberg-Hogness框,俚语称为金砖(Goldbrick),其一致序列是:T85A97T93A85A63A83A50,常在起始位点的上游-25左右,相当于原核的-10序列。但-10是不可缺少的,而真核启动中也有的缺乏TATA框。其作用是:(1)选择正确的转录起始位点,保证精确起始,故也称为选择子(selector),当有的基因缺少TATA框时,可能由Inr来替代它的这一作用,如鼠的脱氨核苷转移酶(Tdt)基因就没有TATA框,但有17

4、bp的Inr;(2)影响转录的速率。TATA框的8bp的保守序列一般都是由A.T对组成,少数情况在其中的两个位点上由G.C对取代了A.T,可见它是较容易打开。当它的序列因发生突变和缺失而改变时就会影响它和酶的结合能力,从而影响转录的能力。在伴清蛋白基因中,当TATA框突变为TAGA后,转录效率大大降低。兔的珠蛋白基因当TATA框的保守序列ATAAAA人工突变为ATGTAA时转录效率会下降80%。人的b珠蛋白基因的ATAAA序列变为ATGAAA或ATAG/CAA时珠蛋白产量也会大大降低而出现地中海贫血症。 

5、2.  上游启动子元件(UPE)上游元件包括CAATbox、GCbox、等,它们的保守序列和结合的蛋白质因子也各不相   CAATbox的保守序列是GGCTCAATCT,一般位于上游-75bp左右紧靠-80,其功能是控制转录起始活性。能和CTF(识别CATT的转录因子)相结合。GCbox的保守序列是GTGGGCGGGGCAAT,常以多拷贝形式存在-90处。在真生物和病毒的一些启动子中常存在GC框,如鼠二氢酸叶酸还原酶启动子,猴基因组中的双向启动子,SV40,疱疹病毒等基因的启动子中,可被转录因子SPI所识

6、别。它的作用也是控制转录效率。还有其它的一些UPE,如八聚体(Octamer),KB,ATF等 3. 远端调控区(1)增强子远端调控区较常见的是增强子(enhomcer)。至少在有时候增强子的存在可以增强启动子的转录活性。它是在1981年由Benerji,Rusconi小组和Chambom等发现的,又称远上游序列(farupstreamseguence)。其特点是:①具有远距离效应。常在上游-200bp处,但可增强远处启动子的转录,即使相距十几Kb也能发挥其作用;②无方向性。无论在靶基因的上游,下游或内部

7、都可发挥增强转录的作用;③顺式调节。只调节位于同一染色体体上的靶基因,而对其它染色体上的基因无作用;④无物种和基因的特异性,可以接到异源基因上发挥作用,如将SV40的增强子接到兔β-珠蛋白基因前,引入Lela细胞,此珠蛋白基因转录增强200倍。⑤具有组织的特异性。SV40的增强子在3T3细胞中比多瘤病毒的增强子要弱,但在Hela细胞中SV40的增强子比多瘤病毒的要强5倍,抗体基因的增强子只有在B淋巴细胞中才起作用。增强子的效应需特定的蛋白质因子参与。⑥有相位性。其作用和DNA的构象有关。⑦有的增强子可以对

8、外部信号产生反应。如热体克基因在高温下才表达。编码重金属蛋白的金属硫蛋白基因在镉和锌存在下才表达。某些增强子可以被固醇类激素所激活。病毒SV40的增强子是最先被描述的,它由2个72bp的重复序列组成。位于上游-200bp处。每个72bp的单元中都有A、B两个功能域。它们在一起共含有5个序列元件(GTⅡ,GTI,Sph.11,sphI和P),这5个元件对转录来说是很重要的。不同的序列模块是作为特殊转录因子识别序列。增强子的某些结

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