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《FADS基因簇SNP与冠心病的易感性研究.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、·2664·国际检验医学杂志2013年1O月第34卷第20期IntJLabMed,October2013,Vo1.34,No.20·临床检验研究论著·FADS基因簇SNP与冠心病的易感性研究林垄,黎四维,马培,周新△(武汉大学中南医院基因诊断中心,湖北武汉430071)摘要:目的评价FADS基因簇单核苷酸多态性与冠心病的相关性,寻找冠心病易感等位基因。方法在冠心病组(375例)和对照组(389例)中,建立应用HRM技术对FADS基因簇5个SNP位点——rs174537、rsl74611、rsl74616、rs174450、rsl74460的基因分型方法并进行等位基因频率
2、分析,对所有SNP位点进行连锁不平衡分析。结果冠心病组和对照组相比,位点rsl74537、rsl74460和rsl74611的基因型分布差异有统计学意义(P<0.05),首次发现rsl74460的C等位与增高的冠心病患病风险相关,CC型携带者罹患冠心病风险较未携带者增高l_64倍EP<0.01,OlR一1.64,95cI=(1.29~2.O8)],两组间位点rsl74616和rsl74450基因型分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论基于HRM技术的基因分型方法快速准确;FADS基因簇SNP位点rsl74537,rsl74460以及rs174611与冠心病易感风险密
3、切相关。关键词:冠心病;脂肪酸去饱和酶类;多态性,单核苷酸;高分辨率熔解DOl:1O.3969/j.issn.1673—4130.2013.20.011文献标识码:A文章编号:1673—4130(2013)20—2664—03AssociationbetweenFADSgeneclusterpolymorphismsandtheriskofCADLinKun,LiSiwei,MaPei,Z0“X△(CenterforGeneDiagnosis,ZhongnanHospitalofWuhanUniversity,Wuhan,Hubei430071,China)Abstra
4、ct:ObjectiveToevaluatetherelationshipbetweenFADSgenepolymorphismsandtheoccurrenceofcoronaryarterydisease,lookingforsusceptibilityallelesinCADpatients.MethodsEstablishSNPgenotypingbasedonhighresolutionmelting(HRM)platformforSNPslocatedinFADSgenecluster—rs174537,rs174611,rs174616,rs174450a
5、ndrs174460,inbothCADgroup(375cases)andcontrolgroup(389cases).Analyzethegenotypesandallelefrequency,andthenperformlinkagedisequilibriuma—nalysisforaUSNPloci.ResultsRemarkabledifferenceswereobservedinrs174537.rs174460andrs174611genotypedistributionbetweenCADgroupandcontrolgroup(P<0.05).Wef
6、irstlyreportedthatthers174460CalleleisassociatedwithahigherriskofCADEP<0.01,OR=1.64,95CI=(1.29—2.08)].Neitherthedifferenceofgenotypedistributionnorthatofallelefrequencywasfoundinlheothertwoloci(P>0.05).ConclusionHRMplatformcanperformgenotypingwithhighsensitivityandaccuracy.Rsl74537,rsl74
7、460andrs174611polymorphismsareassociatedwiththeriskofCAD,andtheyaresusceptibilitylociforCAD.Keywords:coronarydisease;fattyaciddesaturases;polymorphism,singlenucleotide;highresolutionmelt冠心病是一种复杂疾病,是多基因和环境相互作用的结脉造影明确诊断的冠心病患者,随机抽样选取375例,其中,男果。在冠心病的众多危险因素中,遗传背景是最重要的因素之性197例,
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