暗纹东方鲀生长激素基因克隆与同源性分析

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1、江西农业大学学报2010,32(2):0236-0242http://xuebao.jxau.edu.cnActaAgriculturaeUniversitatisJiangxiensisE-mail:ndxb7775@sina.com暗纹东方鲀生长激素基因克隆与同源性分析112严美姣,吴旭,李钟杰(1.福建农林大学动物科学学院,福建福州350002;2.中国科学院水生生物研究所,湖北武汉430072)摘要:克隆获得暗纹东方鲀GH基因,该基因包含6个外显子和5个内含子,在此基础上获得其cDNA序列,共有591bp,编码196个氨基酸。将该cDNA序列转换成蛋白质序列后

2、,结合NCBI数据库中得到的其它24种脊椎动物生长激素基因的蛋白质序列,运用MEGA3.1,以UPGMA法构建东方鲀等25种脊椎动物的生长激素基因进化树,14种鱼类中除了鳗鲡和鳝鱼外聚为一大类,其它动物中哺乳动物、反刍动物、家禽、爬行动物、人以及鳗鲡等聚为另一大类,暗纹东方鲀与红鳍东方鲀生长激素基因的氨基酸同源性达到100%,与斗鱼、杜父鱼、金鲈生长激素基因的氨基酸同源性达到70%以上,与人的生长激素基因的氨基酸同源性也达到40%;斑马鱼、草鱼、鲋鱼以及鲤鱼之间生长激素基因的氨基酸同源性在85%以上;哺乳动物、反刍动物、家禽的生长激素基因的氨基酸同源性在90%左右。从

3、进化树的结果来看,与传统分类学研究结果基本一致,为进一步研究GH基因在胚胎发育及个体生长中的功能奠定基础。关键词:暗纹东方鲀;生长激素基因(GH);分子克隆;序列分析中图分类号:S965.225文献标识码:A文章编号:1000-2286(2010)02-0236-07MolecularCloningandSequenceAnalysisofTakifugufasciatusGHgene112YANMei2jiao,WUXu,LIZhong2jie(1.CollegeofAnimalScience,FujianAgricultureandForestryUniversi

4、ty,Fuzhou350002,China;2.Ini2tituteofHydrobiology,CAS,Wuhan430072,China)Abstract:GHgeneinTakifugufasciatuswascloned,andtherewere6exonsand5intronsintheGHgene,196aminoacidswerecoded.ThesequencesofcDNAwerebroughtoutbasedonthestructureofGHgene.TheacidsequencesofGHgeneinTakifugu,combinedwitho

5、ther24vertebratespecieswereobtainedfromtheGeneBank,andthephylogenetictreeofGHgenewasconstructedwithMEGA3.1usingUPGMAmethod.IntheUPGMAconsensustree,25speciesweredividedintotwoclusters.Theresultswerefounda2greeingwiththosebytraditionalclassification,Whichestablishesagoodfoundationforfurth

6、erstudiesonGHgenefunctionsintheembryonicdevelopmentandthebodygrowth.Keywords:Takifugufasciatus;GHgene;molecularcloning;sequenceanalysis生长激素(growthhormone,GH)是由脑垂体前叶嗜酸性细胞分泌的一种约200个氨基酸的单一肽[1]链蛋白质激素。GH不但能增强鱼体食欲,促进饵料转化率,提高生长速率,在鱼类能量代谢、渗透[2-3]压、性成熟、行为以及免疫力等方面也起着重要调节作用。对生长激素基因的研究越来越受到重视,迄今已克隆

7、包括人、大鼠、小鼠、牛、鸡、绵羊、罗非鱼、虹鳟、鳗鲡、金枪鱼、牙鲆、鲤鱼等多种脊椎动物收稿日期:2009-12-08修回日期:2010-03-18基金项目:福建省教育厅科技项目(JA09095)、淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题项目(2008FB014)和福建农林大学青年教师基金项目(08B16)作者简介:严美姣(1974-),女,副教授,博士,主要从事鱼类生理与分子生态研究,E-mail:yanmeijiao@163.com。第2期严美姣等:暗纹东方鲀生长激素基因克隆与同源性分析·237·在内的GH基因。在鱼类方面,Sekine等最早从大马

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