基于rbcL和matK序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置-论文.pdf

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1、热带亚热带植物学报2013，21(2)：116-122JournalofTropicalandSubtropicalBotany基于rbcL~[1matK序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置杨金宏，孔卫青(安康学院，陕西省蚕桑重点实验室，陕西安康725000)摘要：为探究适用于马鞭草科植物的DNA条形码及该类群的系统分类关系，对豆腐柴(Premnamicrophylla)~叶绿体基因vcf6-psbM、trnV-鲫、rbcL、trnL．F、psbM-trnD、atpB．rbcL、trnC-ycf6、trnH-psbA、rp136一inf

2、A-rps8和核基因ITS序列进行了PCR扩增和测序，结果表明，仅rbcL、trn1．F、trnH-psbA序列的PCR扩增以及测序效果较好，而ITS不能得到明显的扩增条带，vc-pbM不能成功测序，其它序列存在有部分双峰或噪值高等问题。根据DNA条形码标准，rbcL序列是所有测试条码中相对最适合的。应用cL和marK序列对马鞭草科(Verbenaceae)_~腐柴属、牡荆属(VitexL．)、马鞭草属(VerbenaL．)和大青属(ClProdendrumL．)等4属与唇形科宝盖草属(LamiumL．)、水苏属(StachysL．)、

3、鼠尾草属(SalviaL．)和香科科属(TeucriumL．)等4属的分类和系统发育关系进行分析，以紫草科LithospermummultiflorumL．为外类群，最大简约法对2个片段的单独和联合矩阵分别构建系统发育树。豆腐柴属和大青属应从马鞭草科划人唇形科，马鞭草属仍归于马鞭草科，而牡荆属的系统学位置还需更多的证据。关键词：rbcL；matK；马鞭草科；豆腐柴属；系统学doi：10．3969~．issn．1005—3395．2O13．02．003SystematicPositionofPartialPlantsofVerbenace

4、aeInferredfromSequencesofChloroplastrbcLandmarKYANGJin．hong，KONGWei．qing’(KeyLaboratoryofSericuhureinShaanxi，AnkangUniversity，Ankang725000，China)Abstract：InordertounderstandsystematicrelationshipofVerbenaceae，chloroplastgenes，suchasycf6-psbM,trnV-atpE，rbcL，trnL—F，psbM-tr

5、nD，atpB—rbcL，trnC—ycf6，trnH-psbA，rp136-infA-rps8andnrDNAITSofPremnamicrophyllaTrucz．wereamplifiedbyPCRandsequenced．Amongtheseloci，rbcL，trnL—FandtrnH-psbAwereeficientforbothPCRamplificationandDNAsequencing，whileothersequencesdon’tconformtoDNAbarcodestandard，ITShadnospecif

6、icbands，ycf6-psbMcouldnotsequencesuccessfully,andtheothershaddoublepeaksorhighnoisyvaluesHowever,cLisbetterthanothersaccordingtoDNAbarcodingstandard．ThephylogeneticrelationshipsamongfourgenerafromVerbenaceae，suchasPremnaL．，VitexL．，VerbenaL．，andClerodendrumL．，andfourgener

7、afromLabiatae，suchasLamiumL．，StachysL．，SalviaL．，andTeucriumL．，werestudiedbybothcombinedandindividualanalyeseusingthechloroplastgenes吐andmatKsequences．ThegenetreeswereconstructedbymaximumparsimonymethodwithLithospermummultiflorumasoutgroup．ItsuggestedmatPremnaL．andClerode

8、ndrumL．weresupposedtobemovedtoLabiataefromVerbenaceaeandVerbenaL．inVerbenaceaetaxonomically,andthesyste