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时间:2020-04-18
《基于rbcL和matK序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、热带亚热带植物学报2013,21(2):116-122JournalofTropicalandSubtropicalBotany基于rbcL~[1matK序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置杨金宏,孔卫青(安康学院,陕西省蚕桑重点实验室,陕西安康725000)摘要:为探究适用于马鞭草科植物的DNA条形码及该类群的系统分类关系,对豆腐柴(Premnamicrophylla)~叶绿体基因vcf6-psbM、trnV-鲫、rbcL、trnL.F、psbM-trnD、atpB.rbcL、trnC-ycf6、trnH-psbA、rp136一inf
2、A-rps8和核基因ITS序列进行了PCR扩增和测序,结果表明,仅rbcL、trn1.F、trnH-psbA序列的PCR扩增以及测序效果较好,而ITS不能得到明显的扩增条带,vc-pbM不能成功测序,其它序列存在有部分双峰或噪值高等问题。根据DNA条形码标准,rbcL序列是所有测试条码中相对最适合的。应用cL和marK序列对马鞭草科(Verbenaceae)_~腐柴属、牡荆属(VitexL.)、马鞭草属(VerbenaL.)和大青属(ClProdendrumL.)等4属与唇形科宝盖草属(LamiumL.)、水苏属(StachysL.)、
3、鼠尾草属(SalviaL.)和香科科属(TeucriumL.)等4属的分类和系统发育关系进行分析,以紫草科LithospermummultiflorumL.为外类群,最大简约法对2个片段的单独和联合矩阵分别构建系统发育树。豆腐柴属和大青属应从马鞭草科划人唇形科,马鞭草属仍归于马鞭草科,而牡荆属的系统学位置还需更多的证据。关键词:rbcL;matK;马鞭草科;豆腐柴属;系统学doi:10.3969~.issn.1005—3395.2O13.02.003SystematicPositionofPartialPlantsofVerbenace
4、aeInferredfromSequencesofChloroplastrbcLandmarKYANGJin.hong,KONGWei.qing’(KeyLaboratoryofSericuhureinShaanxi,AnkangUniversity,Ankang725000,China)Abstract:InordertounderstandsystematicrelationshipofVerbenaceae,chloroplastgenes,suchasycf6-psbM,trnV-atpE,rbcL,trnL—F,psbM-tr
5、nD,atpB—rbcL,trnC—ycf6,trnH-psbA,rp136-infA-rps8andnrDNAITSofPremnamicrophyllaTrucz.wereamplifiedbyPCRandsequenced.Amongtheseloci,rbcL,trnL—FandtrnH-psbAwereeficientforbothPCRamplificationandDNAsequencing,whileothersequencesdon’tconformtoDNAbarcodestandard,ITShadnospecif
6、icbands,ycf6-psbMcouldnotsequencesuccessfully,andtheothershaddoublepeaksorhighnoisyvaluesHowever,cLisbetterthanothersaccordingtoDNAbarcodingstandard.ThephylogeneticrelationshipsamongfourgenerafromVerbenaceae,suchasPremnaL.,VitexL.,VerbenaL.,andClerodendrumL.,andfourgener
7、afromLabiatae,suchasLamiumL.,StachysL.,SalviaL.,andTeucriumL.,werestudiedbybothcombinedandindividualanalyeseusingthechloroplastgenes吐andmatKsequences.ThegenetreeswereconstructedbymaximumparsimonymethodwithLithospermummultiflorumasoutgroup.ItsuggestedmatPremnaL.andClerode
8、ndrumL.weresupposedtobemovedtoLabiataefromVerbenaceaeandVerbenaL.inVerbenaceaetaxonomically,andthesyste
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