诺禾致源高分文章集锦-微生物多样性

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1、与獭兔便型及体重相关的细菌群落Thebacterialcommunitiesassociatedwithfecaltypesandbodyweightofrexrabbits研究对象：獭兔粪便期刊：ScientificReports影响因子：5.578合作单位：四川农业大学发表时间：2015年3月摘要Rexrabbitisanimportantsmallherbivoreforfurandmeatproduction.However,littleisknownaboutthegutmicrobiotainrexrabbit,esp

2、eciallyregardingtheirrelationshipwithdifferentfecaltypesandgrowthofthehosts.WecharacterizedthemicrobiotaofbothhardandsoftfecesfromrexrabbitswithhighandlowbodyweightbyusingtheIlluminaMiSeqplatformtargetingtheV4regionofthe16SrDNA.Highweightrexrabbitspossessdistinctivemi

3、crobiotainhardfeces,butnotinsoftfeces,fromthelowweightgroup.WedetectedtheoverrepresentationofseveralgenerasuchasYS2/Cyanobacteria,andBacteroidalesandunderrepresentationofgenerasuchasAnaeroplasmaspp.andClostridiaceaeinhighweighthardfeces.Betweenfecaltypes,severalbacter

4、ialtaxasuchasRuminococcaceae,andAkkermansiaspp.wereenrichedinsoftfeces.PICRUStanalysisrevealedthatmetabolicpathwayssuchas'stilbenoid,diarylheptanoid,gingerolbiosynthesis'wereenrichedinhighweightrabbits,andpathwaysrelatedto'xenobioticsbiodegradation'and'varioustypesofN

5、-glycanbiosynthesis'wereoverrepresentedinrabbitsoftfeces.Ourstudyprovidesfoundationtogeneratehypothesisaimingtotesttherolesthatdifferentbacterialtaxaplayinthegrowthandcaecotrophyofrexrabbits.关键词獭兔；肠道微生物；16SV4方法流程研究背景獭兔是一种小型食草类哺乳动物，取材因其皮毛及肉产品的实用价值而被广选取不同雌兔同日产下的80只幼崽，并区

6、分硬粪和软粪类型，每个类型基于70泛饲养。獭兔有两种便型：硬型和软型。天和90天的体重选取轻重各10只兔子，已有研究表明硬粪和软粪包含的营养取第90天的粪便进行后续研究物质存在差异，然而，对于其中微生建库物群落组成还知之甚少。肠道微生物PowerFecalTMDNAisolationkit在维持哺乳动物机体健康方面具有重要作用。已有研究表明，肠道微生物同宿主关键功能关系密切，例如肥胖、测序IlluminaMiSeq肠道免疫成熟、营养限制等。因此，16SV4区我们推测肠道微生物因便型的不同而存在差异，且与獭兔的生长有关。研信息分析1

7、.OTU聚类和分析究目的包括：I.展现并比较獭兔硬粪2.α-多样性分析和软粪中的微生物群落II.鉴定与獭兔3.β-多样性分析生长有关的细菌物种。4.LEfSe分析1研究结果1、獭兔硬粪个体菌群在高低体重组间差异显著，而软粪个体菌群在高低体重组间差异却不显著,这一发现刷新了人们对獭兔后肠菌群和体重关系的认识（图1）。图1不同体重獭兔细菌群落结构及相对丰度2、在硬粪个体中高体重獭兔与低体重獭兔的微生物群落组成有差异，然而在软粪个体中未表现出体重相关的差异。Ruminococcaceae和Akkermansiaspp.在软粪个体中为优势

8、物种。3、LEfSe分析寻找显著性差异物种，獭兔硬粪个体显著性差异物种较软粪个体中多。参考文献微ZengB,HanS,WangP,etal.Thebacterialcommunitiesassociatedwithfecaltypesandbody