adf教程：如何计算转移积分

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1、费米科技（北京）有限公司刘俊如何计算转移积分-ADF（1）首先得到发生电荷转移的体系的总体结构，通常预先由用户给定，或通过几何结构优化得到。假设用户已经得到体系的结构，如下图所示：如上图所示，主要分为两个部分，两个部分之间发生了电荷转移，下面要演示的，就是如何计算如上图所示的结构中的电荷转移积分。（2）保存总体任务文件：参数设置如上图所示，点击菜单File——Saveas，保存任务，例如名为TransferInt，但不计算。（3）保存其中一个片段计算的任务文件：选中其中一个片段的一个原子，然后按CTRLM，从而选中整个

2、分子；费米科技（北京）有限公司刘俊按CTRLX键剪切（注意一定是剪切，因为后面要用到这个分子的坐标），留下剩余的部分：点击菜单File——Saveas，保存任务，例如名为Thymine；但不急于计算。（4）保存另外一个片段计算的任务文件：费米科技（北京）有限公司刘俊在上一步的界面中，按CTRLA全选，然后按del键删掉上一步计算的分子，然后按CTRLV将上一步剪切的分子粘贴到当前窗口。然后执行File——File——Saveas（注意一定是Saveas），保存为另外一个文件，例如名为Adenine。（5）运行两个任务片

3、段任务：在当前ADFinput窗口，点击SCM-Jobs，打开任务管理器。运行Adenine与Thymine两个任务，两个任务不分先后，也可以同时运行。运行完毕后进行第6步。（6）计算转移积分：在任意ADFinput窗口，执行file——open，打开TransferInt.adf文件，并增加设置如下：用前面的方式，选中Adenine分子，并如下图所示，添加Region：费米科技（北京）有限公司刘俊点击红色方框所示的+号，添加Region：费米科技（北京）有限公司刘俊将上图中红色方框内人Region名字分别改为对应的，

4、Adenine和Thymine。原则上，命名是随意的，但避免使用中文字符和空格等。并且最好与片段计算保存文件名字对应起来，这样避免弄错片段。费米科技（北京）有限公司刘俊第5步完成之后，会分别得到Adenine.t21文件和Thymine.t21文件。按下图所示的设置，尤其注意上方红色方框内的勾一定要选上，下方红色方框内，需要点击，并分别选中第5步产生的Adenine.t21文件和Thymine.t21。另外，需要设置Symmetry为Nosym，如下图所示：费米科技（北京）有限公司刘俊到此为止，计算任务的设置完毕。点击

5、File-Save。并运行此任务。（7）结果查看：转移积分的结果是在*.out文件中以文本的方式显示，在ADFinput（TransferInt.adf）窗口，点击SCM——Output：费米科技（北京）有限公司刘俊备注：上图显示的数据与实际计算不同，上图数据仅为示例（该数据采用DZ基组，LDA泛函等默认设置参数计算得到）。