基因图谱综述.pdf

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1、分子植物育种，2003年，第1卷，第5/6期，第741—745页MolecularPlantBreeding，2003，Vol.1，No.5/6，741—745文献综述REVIEW基因组图谱综述张海英*许勇王永健国家蔬菜工程技术研究中心，北京2443信箱，北京，100089*通讯作者，zhanghaiying@baafs.net.cn摘要基因组图谱是基因组学研究的一项重要内容。本文概述了目前基因组图谱的种类，作图的基本原理和方法以及基因组图谱的未来发展趋势。关键词基因组图谱OverviewofGenomicM

2、apsZhangHaiying*XuYongWangYongjianNationalEngineeringResearchCenterforVegetable，BeijingP.O.box2443，Beijing，100089*Correspondingauthor，zhanghaiying@baafs.net.cnABSTRACTGenomemapsisoneofimportantresearchfieldsingenomics.Themaptypes，mappingtheoryandmethodandit

3、spotentialapplicationweresummarigedinthispaper.KEYWORDSGenomicmaps些新基因（Madanetal.，1997）。高密度的基因图1引言谱可用于图谱克隆，快速、经济地分离那些影响发育和控制重要经济性状的基因并进行基因的序基因组图谱是将基因在染色体上的分布状态、列分析，为基因组结构与功能的研究打下基础。排列顺序等综合一起而绘成的图谱。建立高等生因此，世界各国都投入了大量的人力、物力进行物详尽的基因组图谱一直是遗传学家们研究的目与人类生活密切相关的基因组

4、图谱的构建工作。标，也是基因组研究的一项重要内容。这是因为，有了一张详尽的基因组图谱，人们可以明确染色2基因组图谱的种类体上基因间的距离及他们之间的相互关系，可以对新基因进行定位，并有助于育种家们选择有利根据使用的标志和手段不同，基因组图谱可基因进行品种间的转移及从野生近缘种中转移一分为：遗传图谱、物理图谱、转录图谱三种。分子植物育种742MolecularPlantBreeding遗传图谱即通过遗传重组所得到的基因线性点测验来进行。数十年来，遗传学家利用形态标排列图（刘树兵等，1999）。它是基因组研究的基

5、记、生化标记和传统的细胞遗传学方法，为构建础，反映了遗传标记与少数功能基因之间的相对各种主要作物的遗传图谱进行了大量的工作，并关系，是开展重要性状基因位点分析的基础。经取得了一定的进展。但植物中可以用肉眼区分的典的遗传图谱是以形态、同工酶等生理生化常规形态标记数量非常有限，很难利用形态学标记对标记来构建的，而现在的分子连锁遗传图谱则基整个基因组进行的分析，而且形态学标记的多态本上是以DNA分子标记为主要标记而构建的。遗性是遗传与环境相互作用的综合结果，受环境影传连锁群中DNA标记的数量、分布状态和杂合度响较大

6、，加之形态标记的数目及多态性非常有限，会影响遗传图谱的应用。遗传图谱一般用厘摩所以在构建遗传图谱时有很大局限性。同功酶等（cM）来表示遗传标志之间的相对距离，1cM所含生化标记检测的方法相对较为简便和快速，所用的DNA分子序列长度随物种及染色体部位等而异。费用也不太高，然而遗憾的是迄今为止人们知道物理图谱即用遗传重组以外的基因定位方法的同功酶位点数太少，而且只分布在染色体组的所得到的基因线性排列图。它是以已定位的DNA部分染色体上，仅在特定组织和时期表达，因此序列标签位点（sequencetaggedsite

7、s，STS）为路其应用受到限制。这种方法也不能绘成一张详尽标，以DNA的实际长度bp、kb、mb为图距的基的连锁遗传图。因此，人们需要一种更为有效的因图谱，显示染色体上基因的绝对位置关系，图谱遗传标记以绘制详尽的遗传图。分子标记是继形上的距离反映DNA的碱基数（苏玉虹等，2001）。态标记、细胞学标记和生化标记之后发展起来的物理图谱的绘制，可以将被克隆基因或DNA标记一种新的遗传标记形式，DNA标记主要包括三大精确地定位于染色体上，对于位置克隆重要性状类：第一大类是基于DNA分子杂交的方法，主要功能基因和研究

8、物种进化有着十分关键的作用指限制性片段长度多态性（RFLP）；第二大类是（钟筱波等，1997），可以为遗传结构的改造和遗基于PCR技术的DNA扩增方法。八十年代后期，传工程育种提供理论依据。由于PCR技术的出现，不仅为基因克隆提供了十转录图谱指利用表达序列标签（expressedse-分便利的方法，也由此而产生多个新的分子标记quencetags，EST）作为标记所构建的分子遗传图技术。由于PCR技