PCR-DGGE法在慢性胃炎病人舌苔菌群结构研究中的应用.pdf

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1、第l5卷第2期生命科学研究V01.15No.22011年4月LifeScienceResearchApr.2011PCR—DGGE法在慢性胃炎病人舌苔茵群结构研究中的应用张红琳1'2,田凯旋,周东蕊,杜彩贺,张仁敏,陆祖宏(1.东南大学生物与医学工程学院,中国江苏南京210093;2.南京晓庄学院生物化与环境丁程学院,中国江苏南京211171)摘要:在早间未刷牙和进食的情况下,刮取胃炎病人与正常人舌苔,去除杂质,分离菌体,采用酚/氯仿法抽提细菌基因组DNA,并对其中16SrDNAV3可变区进行聚合酶链式反应(P

2、CR)扩增和变性梯度凝胶电泳fDGGE1测定.用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行舌苔茵群结构相似性分析.实验结果表明,采用该方法成功地扩增出l6SrDNAV3区片段.为230bp.DGGE分子指纹图谱结果表明.正常人的舌苔茵群最高相似性为0.74.胃炎病人的舌苔菌群的最高相似性为O.52,正常人的舌苔茵群与胃炎病人的舌苔菌群相似性最高为0.38.即胃炎病人舌苔菌群结构发生了变化.关键词:胃炎;舌苔:16SrDNA:茵群结构中图分类号:Q9331文献标识码:A文章编号:l007—7847(2叭

3、1)O2—0125一O4ApplicationofPCR-DGGEintheAnalysisofStructureofBacteriaColonyfromTongueCoatinginGastritisPatientsZHANGHong一1in,2TIANKai—xuan,ZHOUDong.rui,DUCai—he,ZHANGRen—min.LUZu—hong(1.CollegeofBiologicalScienceandMedicalEngineering,SoutheastUniversit)",Nanji

4、ng210009,Jiangsu,China;2.DepartmentofBiochemicalEngineeringandEnvironmentalEngineering,NanjingXiaozhuangCollege,Nanjing211171,J/an,~:su,China)Abstract:Tonguecoatingofgastritispatientandnormalpersonswerescrapedwithoutcleaningteethandnofoodinthemorning.Impurit

5、ieswereeliminatedandthebacteriawasseparated.ThetotalmicrobialgenomeDNAofeachsamplewasextractedbyphenol—chloroform,V3regionsof16SrDNAwasamplifiedwithPCR,andPCRproductswereanalyzedbyDGGE.ThesimilarityofbacteriastructurewasanalyzedwithBionumerics.Theresultshowe

6、dthatV3regionsof16SrDNAwasextracted,230bp.DGGEsuggestedthatthehighestsimilaritywas0.74innormalpersons,thatofgastritispatientswas0.52,andthatofnormalpersonsandgastritispatientswas0.38.Therefore,somevariationexistedinstructureofbacteriacolonyintonguecoatingofg

7、astritispatient.Keywords:gastritis;tonguecoating;16SrDNA;bacteriacolonystructure(LScienceResearch,2011,15(2):125~128)中医认为,舌苔是散布在舌体上面的一层苔情况,成为指导临床辨证论治的依据[23.正常舌垢,正常舌苔是由脾胃之气上熏、胃津上潮、凝苔是由脱落的角化上皮细胞、唾液、细菌、食物聚于舌面而生⋯.通过对舌质和舌苔的观察,可碎屑及渗出的白细胞等组成。常见的中医舌苔类以测知脏腑气血各种生理功能、病

8、理变化的部分型主要有:薄白苔、薄黄苔、薄白腻苔、薄黄腻收稿日期:2010—11-24;修回日期:2011-03—22基金项目:国家自然科学研究基金资助项目(60701008)作者简介:张纠琳(1975一),女,河北沧州人,博士,副教授,主要从事生殖免疫与微生物检测研究,E.maihvav9@163』.r,m;通讯作者:陆祖宏(1960.),男,东南大学教授、博士生导师,主要从事生物芯片

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