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《平台扫描仪结合imagej软件测定番茄叶面积》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、万方数据中国蔬菜201l(2):73—77CHINAVECETABLES高建昌郭广君国艳梅王孝宣杜永臣‘(中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081)摘要:利用扫描仪获取标准图形,对ImageJ软件测定番茄叶面积的准确性进行了验证。发现不同的扫描分辨率(100、200和300DPI)对图形面积没有显著影响,200DPI的分辨率为较好的扫描参数。以番茄叶片为试材,对剪纸法与图像处理法进行比较,发现二者差异不显著。在此基础上,建立了一种扫描仪结合ImageJ软件测定番茄叶面积的方法。关键词:扫描仪;Imag
2、eJ;图像处理;分辨率;番茄;叶面积中图分类号:$641.2文献标识码:A文章编号:1000—6346(2011)02—0073—05MeasuringPlantLeafAreabyScannerandImageJSoftwareGAOJian-chang,GUOGuang-jan,GUOYan-mei,WANGXiao-xuan,DUYong-chen’(Institute矽VegetablesandFlowers,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing1
3、00081,China)Abstract:Theaccuracyofmeasuringtomato(LycopersiconesculentumMill.)leafareabyImageJsoftwarewasconfirmedthroughmeasuringscannedstandardshape.Therewasnosignificantdifferenceforareawith100,200and300DPI.And200DPIwasbetter.Twomethodsofpaper-cuttingan
4、dimageprocessingformeasuringtomatoleafareawerecomparedandtherewasnosignificantdifference.Basedontheresult,themethodofmeasuringtomatoleafareawithscannerandImageJsoftwarewasestablished.Keywords:Scanner;ImageJsoftware;Imageprocessing;DPI;Tomato;Leafarea叶片是植物地
5、上部与外部环境进行交互的重要部分,是植物进行光合作用、蒸腾作用和呼吸作用的主要器官。而叶面积是生理生化、遗传育种以及作物栽培的重要测定指标。叶面积的准确测定对于深入研究光合效率、蒸腾速率和逆境胁迫等生理指标有重要意义。目前常用的叶面积测定方法主要有光电测定法、剪纸法、打孔测定法、排水量测定法、系数测定法、数格测定法等(乔富廉,2002),各有优缺点。近年来,随着数码照相技术以及计算机图像处理软件发展,研究者建立了一些基于数码照相和扫描仪结合Photoshop软件测定叶面积的方法(肖强等,2005;李宝光等,
6、2006;石景荪等,2007o相比传统的方法,利用电脑软件测定植物叶面积受人为因素影响较小,叶片形状、颜色、厚薄等对测定结果无显著影响;同时测定收稿日期:2010—09—04;接受日期:2010—11-Ol基金项目:国家自然科学基金项目(30900987),国家“973”项目子课题(2009CB009004—02),中国农业科学院基本科研业务费项目,农业部园艺作物遗传改良重点开放实验室作者简介:高建昌。男.助理研究员,专业方向:蔬菜遗传育种,E—mail:gaojoh@mail.cal&$.net.cn·通
7、讯作者(CoIrespondingauthor):杜永臣,男,研究员,博士生导师,专业方向:蔬菜遗传育种,E-mail:yongchen.du@mail.caas.net.ca.r吁卜n爿刀番定J¨了澳L卜●剧”软TJeganI厶口结义,t毒置南]J手台积平面万方数据74中国蔬菜CHINAVEGETABLES2011年1月(下)方法快速简便,适用范围广。基于图像处理软件测定叶面积主要是通过分析图片的分辨率(DPI,DotPerInch,指单位长度内的像素数目,1英寸:2.54cm)来实现的。ImageJ(V
8、1.43)(WayneRashand,2010)是由美国国家心理健康研究所的WayneRasband博士开发的一款图像处理和分析软件,该软件可以处理TIFF、GIF、JPEG、BMP、DICOM、FITS等图像格式,能实现对图片像素的获取直接输出叶面积大小。相比采用Photoshop软件,步骤简单,无需编程就可实现大量样品的处理,更为快捷。本试验旨在探讨采用扫描仪和ImageJ软件测定番茄(Lycopersico
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