使用 sequin 批量提交序列图解教程(by raindy)

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1、FujianAgricultureandForestryUniversity生信系列课件Sequin 批量提交序列AgraphicguideforSequintosubmitsequence（内部交流）Raindyok@qq.com2012.12准备工作•序列文件•序列信息•联系信息序列文件•格式必须是FASTA，扩展名不限；•序列内容只有含有常见的五种碱基字母（A/C/T/G/U）序列信息SeqIdOrganismIsolateCountryCollection-dateHostXQ2Potatov

2、irusYXQ2China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ3PotatovirusYXQ3China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ4PotatovirusYXQ4China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ5PotatovirusYXQ5China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ8PotatovirusYXQ8China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ9Potatoviru

3、sYXQ9China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ10PotatovirusYXQ10China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ11PotatovirusYXQ11China30-Mar-2011Solanumtuberosum相关信息（Organism、Isolate、Country、Collection-date、Host）注意：列（column）之间的界定符号是Tab符，不是空格。联系信息联系方式联系信息（续上）完整填写后，可以导出为模板单位

4、通讯地址启动Sequin开始操作…1启动序列提交读取保存的已有提交记录2设置序列发布日期，默认是接收后立即发布3导入联系方式模板4使用常规的提交向导5批量提交6导入预先准备的序列文件(FASTA格式)7导入预先准备的序列信息8序列注释9CDS为编码区信息10批量添加序列的定义行，并添加前缀1116全部修改完成，点此12修改编码区信息，双击即可弹出窗口，修改相关信息13修改编码区位置1415接受修改提交前，最好验证一下提交序列是否有重要错误，并根据提示修改！17验证提交文件是否存在明显错误？18主要检查

5、Error、Reject是否有明显错误19准备提交20提示保存*.sqn文件，作为附件提交正式提交，将生成*.sqn文件作为附件，并简要说明一下所提交的序列的简要信息，发到gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov《Sequin 批量提交序列》http://t.qq.com.cn/raindyE-mail:raindy@fafu.edu.cnorraindyok@qq.comNetdisk:http://raindy.ys168.com