scifinder绘图面板介绍

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1、SciFinderWeb源于化学，超越化学的一站式检索平台医学院SciFinder高级培训王晓鹏SciFinder培训专员2013年5月22日星期三提纲专题一：结构面板的全方位介绍专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质专题三：反应检索的思路专题四：高级反应检索应用举例CASisadivisionoftheAmericanChemicalSociety.2Copyright2011AmericanChemicalSociety.Allrightsreserved.控制面板上的功能键CASisadivisionoftheAmericanChemica

2、lSociety.3Copyright2011AmericanChemicalSociety.Allrightsreserved.将CAS号、SMILES、InChI等转换将所画结构存为模板，保存之后为结构式的模板可以点击直接使用检查原子、键之间是否有空隙，对绘图面板进行个性化设置，如防止单一结构被当成碎片检索结构式的格式、常用元素等CASisadivisionoftheAmericanChemicalSociety.4Copyright2011AmericanChemicalSociety.Allrightsreserved.SciFinder结构绘制工

3、具橡皮结构和反应切换功能铅笔常用基团元素周期表R基团定义工具可变基团可变位置连接工具重复基团工具模版工具结构检索选择碳链工具索套选择工具选择工具单双键，RS构原子锁定工具型，不确定键定义工具环锁定工具镜面旋转工具旋转工具C原子和单键恢复工具正电子负电子常见环，多元环工具SciFinder中的反应定义工具结构和反应切换功能反应检索选择反应箭头反应角色定义工具反应原子标记工具反应位置标记工具反应官能团列表6元素周期表可变基团常用官能团R基团CASisadivisionoftheAmericanChemicalSociety.7Copyright2011Amer

4、icanChemicalSociety.Allrightsreserved.可变位置连接工具重复基团定义工具环锁定工具原子锁定工具（保证环结构不成为别的环系的一部（保证原子不发生别的取代）分；保证链状结构不会成环）可以检索到不能检索到CASisadivisionoftheAmericanChemicalSociety.8Copyright2011AmericanChemicalSociety.Allrightsreserved.反应角色定义工具原子标记工具（标记反应前后相对应的原子）反应位置标记工具（标记反应过程中形成或断裂的键）代表任意的键，可以是单键、

5、双键或者三键CASisadivisionoftheAmericanChemicalSociety.9Copyright2011AmericanChemicalSociety.Allrightsreserved.提纲专题一：结构面板的全方位介绍专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质专题三：反应检索的思路专题四：高级反应检索应用举例CASisadivisionoftheAmericanChemicalSociety.10Copyright2011AmericanChemicalSociety.Allrightsreserved.案例一：有机物通式结构

6、的亚结构检索CASisadivisionoftheAmericanChemicalSociety.11Copyright2011AmericanChemicalSociety.Allrightsreserved.亚结构检索以下结构通式的物质ORR=S,P,NH2HN2-5X要求：1苯环上任意取代一个卤素2碳链可以重复2至5次3R基团可以是S,P或氨基将结构通式绘入画图面板，进行亚结构检索。12物质检索界面13亚结构检索结果链状结构成为环系的一部分，不是我们需要的亚结构14用Refine对结构式进行进一步限定用环锁定工具锁定结构中的环系和碳链，保证环系不成为

7、别的环系的一部分，保证碳链不会成环。15限定之后的结果集对限定之后的结果集进行SubstanceRole分析，选择有制备信息的物质。16得到物质角色为制备的物质结果集17再使用Analyze中的Elements对物质中的元素进行分析继续用Analyze/Refine进行后处理，获取更多的结构信息。18提纲专题一：结构面板的全方位介绍专题二：亚结构检索具有特定结构要求的物质专题三：反应检索的思路专题四：高级反应检索应用举例CASisadivisionoftheAmericanChemicalSociety.19Copyright2011America

8、nChemicalSociety.Allrightsreserve