DB34∕T 2795-2016 猪传染性胃肠炎病毒与猪流行性腹泻病毒二重RT-PCR检测方法.pdf

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1、ICS11.220B41DB34安徽省地方标准DB34/T2795—2016猪传染性胃肠炎病毒与猪流行性腹泻病毒二重RT-PCR检测方法DuplexRT-PCRassayfordetectionofporcinetransmissiblegastroenteritisvirusandporcineepidemicdiarrheavirus文稿版次选择2016-12-30发布2017-01-30实施安徽省质量技术监督局发布DB34/T2795—2016前言本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。本标准由安徽省农业科学院畜牧兽医研究所提出。本

2、标准由安徽省农业标准化技术委员会归口。本标准起草单位:安徽省农业科学院畜牧兽医研究所。本标准起草人:潘孝成、张丹俊、赵瑞宏、沈学怀、戴银、胡晓苗、杨永新、周学利、侯宏艳、王重龙、李庆岗、张玉、王杨龙、陈福军、何为俊。IDB34/T2795—2016猪传染性胃肠炎病毒与猪流行性腹泻病毒二重RT-PCR检测方法1范围本标准规定了猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)与猪流行性腹泻病毒(PEDV)二重RT-PCR检测方法的技术要求。本标准适用于猪肠内容物、粪便以及细胞培养物中TGEV和/或PEDV核酸的检测。2缩略语下列缩略语适用于本文件。TGEV:猪传染性胃肠

3、炎病毒(porcinetransmissiblegastroenteritisvirus)PEDV:猪流行性腹泻病毒(porcineepidemicdiarrheavirus)PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)RT-PCR:反转录聚合酶链式反应(reversetranscription-polymerasechainreaction)RNA:核糖核酸(ribonucleicacid)DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)DEPC:焦炭酸二乙酯(diethylpyrocarbonate)

4、Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleosidetriphosphate)M-MLV:莫洛尼氏鼠白血病病毒(moloneymurineleukemiavirus)PBS:磷酸缓冲液(phosphatebuffersolution)TAE:Tris-乙酸电泳缓冲液(trisacetate-EDTAbuffer)EB:溴化乙锭(ethidiumbromide)3主要仪器3.1PCR扩增仪。3.2台式低温高速离心机(最大离心力12000g以上)。3.3电泳仪。3.4凝胶

5、成像系统。3.5冰箱(-20℃;-80℃)。3.6微波炉。3.7分析天平(准确度0.01g以上)。3.8水浴锅。3.9微量移液器(2.5µL;10µL;200µL;1000µL)。4试剂和材料1DB34/T2795—20164.1RNA抽提试剂:Trizol或其他商品化RNA提取试剂。4.2氯仿、异丙醇、无水乙醇。4.3M-MLV反转录酶。4.4RNA酶抑制剂。4.5DEPC处理的灭菌水。4.6TaqDNA聚合酶。4.7dNTP。4.8DNA分子质量标准(DL2000DNAMarker)。4.9RT-PCR反应试剂。4.10EB(10µg/µL)或

6、核酸染料。4.11磷酸盐缓冲液(PBS,0.01mol/L,pH7.2),见附录A中的A.1。4.1250×TAE电泳缓冲液,见附录A中的A.2。4.131%琼脂糖凝胶,见附录A中的A.3。4.14引物:——TGEV扩增上游引物,5’-TTACAAACTCGCTATCGCATGC-3’,下游引物,5’-TCTTGTCACATCACCTTTACCTGC-3’;——PEDV扩增上游引物,5’-GTGGTCGGAAGAGTAATAACATAC-3’,下游引物,5’-CCCATGAAGCACTTTCTCACTATC-3’,引物浓度均为10pmol/µL。4

7、.15对照样品:——阳性对照样品:猪传染性胃肠炎病毒(VERO细胞培养)与猪流行性腹泻病毒(PK15细胞培养)的细胞培养混合物或猪传染性胃肠炎-猪流行性腹泻-猪轮状病毒三联弱毒冻干活疫苗;——阴性对照样品:正常细胞培养混合物(VERO和PK15细胞)、正常猪肠道内容物或正常猪粪便样品。5样品的采集及处理5.1采样工具15mL离心管、1.5mL离心管、剪刀、镊子和研钵,经121(±2)℃,15min高压灭菌并烘干。5.2采样方法5.2.1肠内容物的采集与处理采取病死或剖杀猪的小肠内容物1g左右,按1:5倍体积加入PBS,研磨冻融3次,装入15mL灭菌

8、离心管中,8000g离心10min,取上清液转入1.5mL离心管中,-80℃保存备用。5.2.2粪便的采集与前处理取发病猪

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