组蛋白修饰在两细胞系上的分布分析.pdf

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1、分类号UDC论文题目10126—31046013密级编号学院：塑堡抖堂皇堇苤堂院学号：31046013研究生：委垄指导老师：送型缝副塾援专业：堑理堂研究方向：堡途生物堑理堂2013年5月15日鼬”明I煳剿本人声明：所呈交的学位论文是本人在导师的指导下进行的研究工作及取得的研究成果。除本文已经注明引用的内容外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得内蒙直太堂及其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：：杰整日期：涩堕：羔!丝指导教

2、师签名：丝垄!i叁日期：型!：三：至璺在学期间研究成果使用承诺书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，即：内蒙古大学有权将学位论文的全部内容或部分保留并向国家有关机构、部门送交学位论文的复印件和磁盘，允许编入有关数据库进行检索，也可以采用影印、缩印或其他复制手段保存、汇编学位论文。为保护学院和导师的知识产权，作者在学期间取得的研究成果属于内蒙古大学。作者今后使用涉及在学期间主要研究内容或研究成果，须征得内蒙古大学就读期间导师的同意；若用于发表论文，版权单位必须署名为内蒙古大学方可投稿或公开发表。学位论文作者签名：盔i盘日期：

3、狸丝：垒：塑指导教师签名：i垒堑】!基日期：盘立!i：皇!超内蒙古大学硕士毕业论文组蛋白修饰在两细胞上的分布分析摘要基因组表达调控是一个非常复杂的过程，除了DNA自身序列的调控作用外，还受到很多表观遗传修饰的调控作用。近年来，人们逐渐发现表观遗传学的重要性及其在医学领域上的应用。组蛋白修饰是表观遗传学研究的一个重要方面，具有重要的理论意义和应用前景，而关于细胞分化的表观遗传学调控和启动子、增强子上的组蛋白修饰分析已成为新的研究热点。本文对人类两个时期细胞系的组蛋白修饰的变化情况进行了分析研究。首先，利用H1(人类胚胎干细胞)和IMR90(人类

4、胚肺成纤维细胞)这两种细胞系的H3K9me3、tt3K9ac、H3K4mel、H3K4me3、H3K27ac、H3K27me3、H3K36me3七种组蛋白修饰的ChiP—seq数据，分析了两种细胞系中的各种组蛋白修饰分布密度，计算了分布的相关性。其次，计算了不同功能区(外显子、内含子、启动子)各类组蛋白修饰间的相关性，进一步讨论了在Hl和IMR90两个细胞系上的组蛋自修饰的变化，为了解组蛋白修饰在细胞生长、分化过程中的重要作用提供了一定的基础。最后，分析了在三个功能区域中组蛋白修饰的分布，进～步了解在两个细胞系中不同功能区域七种组蛋白修饰的分

5、布特征，有助于理解组蛋白修饰的功能。关键词：组蛋白修饰、相关性、ChiP—seq、分布特性内蒙吉大学硕士毕业论文ANALYSISTHEDISTRIBUTIoNOFHISTONEMODIFICATIONINTWOⅪNDSOFCELLSABSTRACTGeneexpressionregulationisaverycomplexprocess．ItisregulatednotonlybyDNAsequence，butalsobythemanyepigeneticmodifications．Inrecentyears，peoplegraduallyf

6、oundtheimportanceandapplicabilityofepigeneticsinmedicalfield．Thestudyofhistonemodification，whichisanimportantcontentofepigeneticresearchhasimportanttheoreticalsignificanceandpracticalapplications．Epigeneticmodificationregulatesanumberofbiologicalprocessessuchascelldifferent

7、iation．Analysisofhistonemodificationsonpromoter，enhanserhasbecomeanewhotresearchtopics．Inthispaper，weanalyzedhistonemodificationsintwohumancells．ByanalyzingtheChIP-seqdataofsevenkindsofhistonemodification(H3K9me3，H3K9ac，H3K4me1，H3K4me3，H3K27ac，H3K27me3andH3K36me3)inH1andIMR

8、90celllines，weobtainedmodificationthedistributionofhistonemodificationsintwocellli