二代测序简介.ppt

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1、第二代测序技术简介公司理念：毅新兴业以生命科学研究为本，致力于科学技术服务，为客户提供完美的科研平台。基因组SNPs（包括芯片、massarray）第二代大规模测序病毒包装miRNA表达谱蛋白组血清多肽谱2DELC-MS（Shotgun法）代谢组NMRLC-MS自主仪器恒温金属浴梯度PCR仪恒温振荡仪Squenom质谱仪SAI质谱仪MALDITOF/TOF测序仪：PolonatorG.007试剂自主研发液体蛋白磁珠SBI试剂慢病毒RNA干扰库MicroRNA研究干细胞研究3内容提纲从Sanger法到新一代测序技术第二

2、代测序平台介绍第二代测序技术应用宏基因组学（Metagenomics）泛基因组学（Pangenomics）KeyGenomicsTechnologies1975-SouthernDNAhybridizationtechnique1977-Sanger’schain-terminationandMaxam、Gilbert’schemicalDNAsequencingmethods1980-Automatedinsituoligonucleotidesynthesisinstrument1985-Mullis’sdisc

3、overyofPCRatCetus1992-Affymatrix(Fodor’sgroup)firstgene-chip1995-ABI’sfirstautomatedDNAsequencer2006-2ndgenerationDNAsequenceronmarket2007andbeyond–SinglemoleculesequencingtechniquesSanger’sMethodLabeledprimer(1)Sequencereactions(4)Sequenceseparations(4)Sequenc

4、eread-out1st-GenerationAutomatedDNASequencerParallelrunson96capillariesonABI3700Limitationof1stGenSequencerThroughputTime-consumingseparationofchain-terminatedfragmentsHardtoproducemassivelyparallelsystembasedelectrophoreticseparationSequencingCostSamplehandlin

5、gDifficulttominiaturizeNeedforFasterandCheaperSequencingTechnologyPersonalGenomeProjectTrendsinNext-GenerationSequencingLarge-scaleandhigh-throughputAmplificationonsolidsurfaceClustergeneration(bridgeorpolonyamplification)EmulsionPCR(fragmentonbeads)Insituseque

6、ncingbychainextensionSequencebysynthesis–DNApolymeraseSequencebyligation–DNAligaseMassivelyparallelprocessingArrayofclusters,beadsMiniaturizationthroughmicrofluidicSinglemoleculedetection测序技术目标陈竺，日本血吸虫基因组人类全基因组测序的目标：1000美元/人2008年预测5年内实现2006年底，美国X大奖基金会设立了基因组Arch

7、onX大奖，奖金高达1000万美元。这项大奖将颁给第一个能在10天之内，用不到100万美元的费用，完成100个人类基因组测序的团队。附加条件是覆盖率不小于98%，误差不大于1/100000bp。Next-GenPlatformsGA–Illumina/SolexaSBSwithreversiblefluorescentterminatorsGSFLX–Roche/454LifeSciencesSBSthroughpyrosequencingSOLiD–ABI/AgencourtSBLwithdualbaseencod

8、ingPOLONATOR—DanaherMotionSBLwithbaseencodingNext-GenSequencingWorkflowFragmentLibraryPreparationRandomPair-endImmobilizationofFragmentSurface,BeadCovalentornon-covalentSequ