《二代测序简介》PPT课件.ppt

《《二代测序简介》PPT课件.ppt》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。

1、第二代测序技术简介公司理念：毅新兴业以生命科学研究为本，致力于科学技术服务，为客户提供完美的科研平台。基因组SNPs（包括芯片、massarray）第二代大规模测序病毒包装miRNA表达谱蛋白组血清多肽谱2DELC-MS（Shotgun法）代谢组NMRLC-MS自主仪器恒温金属浴梯度PCR仪恒温振荡仪Squenom质谱仪SAI质谱仪MALDITOF/TOF测序仪：PolonatorG.007试剂自主研发液体蛋白磁珠SBI试剂慢病毒RNA干扰库MicroRNA研究干细胞研究3内容提纲从Sanger法到新一代测序技术第二代测序平台介绍第二代测序技术应用宏基因组学（M

2、etagenomics）泛基因组学（Pangenomics）KeyGenomicsTechnologies1975-SouthernDNAhybridizationtechnique1977-Sanger’schain-terminationandMaxam、Gilbert’schemicalDNAsequencingmethods1980-Automatedinsituoligonucleotidesynthesisinstrument1985-Mullis’sdiscoveryofPCRatCetus1992-Affymatrix(Fodor’sgroup)

3、firstgene-chip1995-ABI’sfirstautomatedDNAsequencer2006-2ndgenerationDNAsequenceronmarket2007andbeyond–SinglemoleculesequencingtechniquesSanger’sMethodLabeledprimer(1)Sequencereactions(4)Sequenceseparations(4)Sequenceread-out1st-GenerationAutomatedDNASequencerParallelrunson96capillari

4、esonABI3700Limitationof1stGenSequencerThroughputTime-consumingseparationofchain-terminatedfragmentsHardtoproducemassivelyparallelsystembasedelectrophoreticseparationSequencingCostSamplehandlingDifficulttominiaturizeNeedforFasterandCheaperSequencingTechnologyPersonalGenomeProjectTrend

5、sinNext-GenerationSequencingLarge-scaleandhigh-throughputAmplificationonsolidsurfaceClustergeneration(bridgeorpolonyamplification)EmulsionPCR(fragmentonbeads)InsitusequencingbychainextensionSequencebysynthesis–DNApolymeraseSequencebyligation–DNAligaseMassivelyparallelprocessingArrayo

6、fclusters,beadsMiniaturizationthroughmicrofluidicSinglemoleculedetection测序技术目标陈竺，日本血吸虫基因组人类全基因组测序的目标：1000美元/人2008年预测5年内实现2006年底，美国X大奖基金会设立了基因组ArchonX大奖，奖金高达1000万美元。这项大奖将颁给第一个能在10天之内，用不到100万美元的费用，完成100个人类基因组测序的团队。附加条件是覆盖率不小于98%，误差不大于1/100000bp。Next-GenPlatformsGA–Illumina/SolexaSBSwit

7、hreversiblefluorescentterminatorsGSFLX–Roche/454LifeSciencesSBSthroughpyrosequencingSOLiD–ABI/AgencourtSBLwithdualbaseencodingPOLONATOR—DanaherMotionSBLwithbaseencodingNext-GenSequencingWorkflowFragmentLibraryPreparationRandomPair-endImmobilizationofFragmentSurface,BeadCovalentornon-

8、covalentSequ