若干代表性基因检测位点的功能介绍.ppt

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1、若干代表性基因检测位点的功能介绍上海交通大学医学院医学遗传学教研室陆振虞2008-11-26遗传多态表观遗传学性状多态SNP（单核苷酸多态性）STR（短串联重复序列）INS/DEL（插入/缺失）CNV(拷贝数量多态)DNA甲基化X染色体失活组蛋白修饰基因组印记疾病出生缺陷肿瘤心脑血管疾病精神疾病用药反应药物毒性药物疗效代谢反应营养元素代谢外源物质代谢（烟酒、致癌物）体质人类学特征肤纹骨骼直接相关改变蛋白质序列、结构改变蛋白质表达数量间接相关与致病位点连锁大多数常见疾病是遗传因素与环境作用的结果高血压糖尿病心血管疾病癌症老年性痴

2、呆哮喘类风湿性关节炎等“人类基因组计划的完成为医学提供了大量信息，由此发展出1000余种疾病的基因诊断技术，目前已经有700余种用于临床。其中大部分可以诊断发病率低的遗传病，但是越来越多的基因诊断技术被用于广大人群，主要用于：1.遗传病的诊断（单基因遗传病为主）2.发现疾病相关的基因变异携带者3.常见疾病的遗传风险预测和易感性评估4.指导个体化用药基因检测和其它正在发展遗传筛选和预防技术将对人类的健康医疗产生巨大的影响。”—美国国家疾病控制中心基因检测部若干代表性基因检测位点的功能介绍MTHFR叶酸代谢——出生缺陷，心脑血管疾

3、病，癌症mtDNA线粒体12sRNA——氨基糖苷类抗生素致耳聋ALDH2酒精代谢通路/硝酸甘油代谢通路——酒精耐受、硝酸甘油药效APOE脂质代谢通路——阿尔茨海默病EGFR肿瘤的基因靶向治疗MTHFR——叶酸代谢通路叶酸是一种水溶性B族维生素，在绿叶蔬菜、水果及动物肝脏中储存丰富。叶酸参与人体新陈代谢的全过程，是合成人体重要物质DNA的必需维生素。在体内的活性形式为四氢叶酸，在体内许多重要的生物合成中作为一碳单位的载体发挥重要功能。可通过腺嘌呤、胸苷酸影响DNA和RNA的合成可通过蛋氨酸代谢影响磷脂、肌酸、神经介质的合成等也为

4、DNA甲基化修饰提供甲基叶酸缺乏新生儿出生缺陷（无脑畸形、唇腭裂、脊柱裂、唐氏综合征）妊娠期综合征高同型半胱氨酸血症（贫血、高脂血症、高血压、肿瘤）叶酸缺少的原因摄入不足吸收利用不良（如酶的缺乏或活性不足）需求量增加（妊娠、代谢率增加等情况下叶酸需要量增加）导致叶酸缺乏。叶酸代谢通路MTHFRC677T、A1298CMTHFR基因存在多种多态型，影响MTHFR活性和热稳定性。（1）677C-T：引起MTHFR热稳定性和活性降低，相对于正常的C/C基因型，纯合子T/T基因型MTHFR活性在37摄氏度降低50%～60%（2）129

5、8A-C：编码后酶分子中谷氨酸被丙氨酸替代，引起MTHFR活性降低。1298A-C与677C-T不同的是，纯合子和杂合子血浆同型半胱氨酸升高和叶酸降低均不明显。然而，如果同时存在1298A-C和677C-T复合变异的杂合子，则MTHFR活性低于野生型40%。（3）中、外多个人群研究中这两个位点的多态现象被证实与多种疾病的仿生风险有显著相关性。MTRAsp919GlyG等位基因可能导致不完整蛋白或酶活性缺失，引起甲基维生素缺乏症G型，经常用来研究与脊柱裂、心梗、Down综合症、高血压、肿瘤、静脉血栓、神经管缺陷等疾病的关系。世界

6、、中国人群都有文章报道该位点的多态现象与叶酸代谢相关疾病或健康问题有显著相关性。MTRRA66GG等位基因型引起甲基维生素缺乏症E型,经常用来研究与脊柱裂、Down综合症、神经管缺陷、白血病等疾病的关系。中、外多个人群研究结果显示，该位点的多态现象与叶酸代谢相关疾病或健康问题有显著相关性。mtDNA——氨基糖苷类抗生素致聋氨基糖苷类抗生素是具有氨基糖与氨基环醇结构的一类抗生素临床主要用于对革兰氏阴性菌、绿脓杆菌等感染的治疗氨基糖苷类药物作用机制氨基糖苷类抗生素对蛋白质合成的始动、延伸、终止三个阶段均有作用，可造成细菌体内核糖体

7、耗竭及蛋白质合成受阻。其作用环节为：①起始阶段。抑制70S始动复合物的形成，使蛋白质合成在早期即终止。②延伸阶段。选择性地与30S亚基上的靶蛋白（如P10）结合，使A位扭曲变形，从而造成mRNA上密码出现错误，将错误的氨基酸掺入肽链，导致合成无功能的蛋白质。③终止阶段。阻止终止密码子与A位结合，阻止肽链脱落。此外，氨基糖苷类药物还可使细菌细胞膜缺损，膜通透性增加，细胞内重要物质外漏和加快氨基糖苷类药物的转运，更加速了细菌的死亡。不良反应耳毒性肾毒性神经肌肉阻滞作用变态反应mtDNA12sRNA突变线粒体基因病遗传特点1、母系遗

8、传(matrilinearinheritance)卵子与精子细胞核的结合是对等的，但细胞质的结合是远远不对等的。在绝大多数情况下，突变的线粒体DNA通过母亲卵子细胞质的线粒体传给子代，通过父亲传递的极为罕见。线粒体基因病系谱2、数量概念一个细胞的细胞质中可有几千个线粒体DNA