基于Gene Ontology的miRNA功能相似性的研究.pdf

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2、ｌｐｐ誦，ＨＰ＃＾Ａ＃－ｍｍ．—＂識二。一五年六月．．、？？？，＇．Ｉ．＇＇＇戶‘：’ｖ／－．、．＾．■‘Ｖ：；．．，？＇？．＞＇ｒ．．＇．．‘．．，：＇？？－？？－，：，，＇．■Ｖ．＇．■．．．．分类号ＴＰ３９１密级公开ＵＤＣ硕±学位论文基于ＧｅｎｅＯｎｔｏｌｏｇｙ的ｍｉＲＮ乂功能相似性的研究藍朝巧学科专业计算机软件与理论指导教师陈庆锋论文答辩日期２０１５年５月２９日学位授予日期２

3、０１５年６月３０日答辩委员会主席隙友巧教授级高级工程师广西大学学位论文原创性声明和使用授权说明原创性声明本人声明所呈交的论文，是本人在导师的指导下独立进斤研究所取得的研巧成果。除己持别加标注和致谢的地方外，论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写的研究成果，也不包含本人或他人为获得广西大一学或其它单位的学位而使用过的材料。与我同工作的同事对本论文的研究工作所做的贡献均已在论文中作了明确说明。本人在导师指导下所完成的学位论文及相关的职务作品，知识产权归属广西大学。本人授权广西大学拥有学位论文的部分使用权，即：学校有权保存并向国家

4、有关部口或机构送交学位论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅，可将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播，可Ｗ采用影印、缩印或其它复制手段保存、汇编学位论文。本学位论文属于：□保密，在年解密后适用授权。口不保密。＂＂ｃｔ在上相应方框内打Ｖ）化？。论文作者签名：复贫日期？Ｚ防．＾．豕Ｕ＇指导教师签名，：識曰期Ｗ作者联系电话；电子邮箱基于ＧｅｎｅＯｎｔｏｌｏｇｙ的ｍｉＲＮＡ功能相似性的研究摘要ｍｉＲＮＡ功能相似性可用来预测未知的ｍｉＲＮＡ的功能，研究ｍｉＲＮＡｓ之间的相互作用。ｍｉＲＮＡ序列和结构

5、的相似性可用来度量ｍｉＲＮＡ的功能相似性，然而有些ｍｉＲＮＡ具有相似的序列和结构，一。因此但是它们却有不同的功能，需要个有效的度量方法来度量ｍｉＲＮＡ之间的功能。由于在很多生物过程中，ｍｉＲＭ通过改变转录后的鞭标基因来调控，所ＷｍｉＲＮＡ的功能相似性可由它的鞭标基因来度量。而鞭标基因的相似性可｛＾用ＧｅｎｅＯｎｔｏｌｏｇｙ（ＧＯ）来计算。一ＧＯｍＲＮＡ本文提出了个项的混合值来度量两个ｉ相对应的靴标基因的ＧＯ项的相似性。这个相似性可转换成为两个ｍｉＲＮＡ之间的相似性。这个絕合值主要基于项的后继节点、深度权重和项到根项么间选的关系

6、。通过谱聚类算法将ｍｉＲＮＡ聚类，来验证算法的可行性。采用自我调整的方法和最小的类内距离方差的方法来分别计算出谱聚类中ｍｉＲＮＡ的邻矩阵的较优参数和聚类的个数。结果表明，本文的方法对算法时间不敏感，能够很好的度量Ｇ一Ｏ项之间的相似性，从而将功能相似的ｍｉＲＮＡ聚到起。与其他传统的基于边或基于节点算法相比。，具有更高的准确度本文的方法还可Ｗ用来对新发现的ｍｉＲＮＡ进斤功能注释。：ｍｉＲＮＡＧｅｎｅＯｎｔｏｌｏｇｙ；混合值！谱关键词；聚类；ＩＭｅａｓｕｒｉｎＦｕｎｃｔｉｏｎＳｉｍｉｌａｒｉｔｏｆｍｉＲＮＡｂｕｓｉｎＧｅｎｅＯｎｔ

7、ｏｌｏｇｙｙｇｇｙＡＢＳＴＲＡＣＴＴｈｅｆｉｍｃｔｉｏｎｓｉｍｉｌａｒｉｔｙｏｆｍｉＲＮＡｓｃａｎｂｅａｐｐｌｉｅｄｔｏｐｒｅ出ｃｔ化ｅｆｉｍｃｔｉｏｎｏｆｕｎｋｎｏｗｎｍｉＲＮＡｓａｎｄｓｔｕｄ化ｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｏｆｍｉＲＮＡｓ．ＳｅｕｅｎｃｅａｎｄｓｔｒｕｃｔｕｒｅｙｑｓｉｍｉｌａｒｉｔｙｏｆｍｉＲＮＡｃａｎｂｅａｐｐｌｉｅｄ化ｍｅａｓｕｒｅ化ｅｉｒｆｉｍｃｔｉｏｎｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ．Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｓｏｍｅｍｉＲＮＡｓ