仪器方法建立-LTQ series.pdf

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1、LTQInstrumentSetup(((方法设置(方法设置)))点击桌面上的图标,进入Xcalibur工作站的主界面点击,进入方法设置界面:1点击,进入质谱方法设置界面:点击,出现如下质谱参数设置界面:2MSDetectorSetup参数设置:Acquiretime(min):质谱采集时间,一般时间设定与色谱梯度时间设置相一致Segment:设置整个时间分为几段。如设为2,则整个时间分为两个时间段,不同的时间段可以去设置不同的ScanEventsStartdelay(min):一般设为0,如果

2、设为2,则质谱在液相梯度启动后2分钟才开采集信号Segment设置:ScanEvent:,可以设置有几个扫描事件TuneMethod:点击,调入通过LTQTune保存的Tune文件,指定实验采用的Tune方法,即硬件参数包括源区的气体,温度,喷雾电压等FullScan参数设置,如下图:3设置ScanDescription参数:MassRange一般情况下选择Normal,ScanRate一般选择Normal,ScanType选择Full,Polarity选择检测模式(Positive或Negat

3、ive),DataType选择采集质谱数据的为峰形图(Profile)或棒状图(Centroid)设置ScanRange参数:FirstMass(m/z)设置扫描范围起始质量数,LastMass设置扫描范围结束点质量数。其他参数均可以不设,APCICoronaOn,APPILampOn可不勾选。多级质谱扫描参数设置,如下图:4设置ScanDescription参数:MassRange一般情况下选择Normal,ScanRate一般选择Normal,ScanType选择Full,Polarity选

4、择检测模式(Positive或Negative),DataType选择采集质谱数据的为峰形图(Profile)或棒状图(Centroid)MSnSetting:如果要做二级质谱,在n为2这一行中进行设置,ParentMass(m/z)中键入母离子的质荷比,Act.Type下拉选择碰撞方式(CID或PQD),Iso.Width(m/z)中键入母离子的隔离窗口,一般设为2,NormalizedCollisionEnergy键入碰撞能量,Act.Q(0.25)和ActTime(ms)(30)不用改动。如

5、果要继续做三级质谱,在n为3这一行中设置各参数,设置参照二级质谱的各参数含义。设置ScanRange参数:FirstMass(m/z)设置扫描范围起始质量数,LastMass设置扫描范围结束点质量数。其他参数均可以不设,APCICoronaOn,APPILampOn可不勾选。选择离子扫描(SIM)参数设置,如下图:设置ScanDescription参数:MassRange一般情况下选择Normal,ScanRate一般选择Normal,ScanType选择SIM,Polarity选择检测模式(P

6、ositive或Negative),DataType选择采集质谱数据的为峰形图(Profile)或棒状图(Centroid)设置ScanRange参数:SIM时Input会自动切换到Center/Width。CenterMass(m/z)设置扫描范围中心质量数,Width(m/z)设置扫描窗口范围。其他参数均可以不设,APCICoronaOn,APPILampOn可不勾选。数据依赖性扫描(DependantScan):当样品组分特别复杂,而且都是未知物时,我们没有办法预先知道里面含有哪些m/z的

7、组n分,所以如果要获得各组分的一级或多级质谱数据只能运行多针分别采集FullScan和MS数据。如果希望运行一针就获得这些信息,可以采用DependantScan,让仪器根据前一次扫描的峰强去自动触发选择排名前n(n需要自己定义)强的母离子做多级质谱,设置方法如下5要采用DependantScan时,ScanEvent的数目必须大于或等于2,如上图中ScanEvent的数目为2。一般ScanEvent1我们设为FullScan,ScanEvent2勾选DependantScan,如下图:点击“Se

8、tting”,进入参数设置。Global常用设置:“Global”“Global”中,设置选择某一m/z范围内的离子去做多级质谱,通常情况下不对范围设限制,使用默认参数即可。6“Global”“MassWidths”中的参数用于设定离子的m/z筛选窗口,均使用默认值即可。Exclusionmasswidth:当使用动态排除时,去排除某一母离子的m/z筛选窗口;Parentmasswidth:ParentMassList中母离子的m/z筛选窗口;Rejectmasswidth:R

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