check cif错误和改正.pdf

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1、问题：_diffrn_measured_fraction_theta_fullLow.......0.93采集数据的完成度偏低，通常要在0.97以上。最好是重新收集数据。解决方法：omit050问题：Nosu'sonH-atoms,butrefinementreportedas.mixed报告中显示对H原子的修正方法是混合模式但没有列出H原子相关的偏差。解决方法：把.CIF中的"mixed"改成"constr"就可以了。问题：CIFContainsnoX-HBonds................

2、......?CIFContainsnoX-Y-HorH-Y-HAngles..........?解决方法：在ins文件中将Bond改为Bond$h命令,再在XL中精修一下就可以了问题：PLAT080_ALERT_2_AMaximumShift/Error............................0.37修正轮数不够多MaximumShift/Error值应该接近于0，至少要在0.02以下。解决方法：增加修正轮数（L.S.后的数值改大）问题：PLAT220_ALERT_2_ALarge

3、Non-SolventOUeq(max)/Ueq(min)...7.95RatioPLAT222_ALERT_3_ALargeNon-SolventHUeq(max)/Ueq(min)...7.78Ratio这二条是指原子有较大的非正定，说明没有修正好。解决方法：可以考虑将这个有较大无序的O进行分比（如占位率0.5：0.5）再修。如果是衍射数据质量不够好而无法得到好的修正结果，那只有重新采集数据了。问题：DENSX01_ALERT_1_ATheratioofthecalculatedtomeasur

4、edcrystaldensityliesoutsidetherange0.80<>1.20Calculateddensity=1.753Measureddensity=0.000PLAT093_ALERT_1_ANosu'sonH-atoms,butrefinementreportedas.mixed解决方法：在cif里将_exptl_crystal_density_meas0改为：_exptl_crystal_density_meas?将_refine_ls_hydrogen_treatmentm

5、ixed改为：_refine_ls_hydrogen_treatmentconstr问题：PLAT211_ALERT_2_AADPofAtomC3isNPD.....................?解决方法：原子非正定，无序或者空间群错误，或者数据不好。这个原子如果在结构中不甚重要，可以按各向同性处理，一般不影响发表。用ISOR命令各向同性，应该可以解决。问题：HirshfeldTestDiffforC1-C2..7.53su解决方法：ins文件里加入delu0.02c1c2（delu限制所指定的

6、原子具有接近指定范围内的位移参数）问题：PLAT052_ALERT_1_A(Proper)AbsorptionCorrectionMethodMissing..?PLAT057_ALERT_3_CCorrectionforAbsorptionRequiredRT(exp)...1.11解决方法：主要注意cif文件中的以下这几行，_exptl_absorpt_correction_type这一项只要做了xcif就一般会自动填'Multi-scan'，你也可根据自己的校正方法来填。一般可能出的问题就是这

7、几行填得串了行，或者T_min与T_max填反了。仔细检查问题：PLAT220_ALERT_2_BLargeNon-SolventCUeq(max)/Ueq(min)...3.83Ratio解决方法：simu0.010.023.8$c（simu限制在一定范围内的原子具有相同的位移参数）问题：解完晶体后checkcif出现A类错误Nos.u.GivenforFlackParameter..............?不知道如何解决解决方法：你这个结构是否有手性？1.如果有手性且有重原子，那在修正中加入F

8、lack指令，修正后重新产生CIF。2.如果没有手性，或有手性但用Mo靶做小于Si元素的结构，则可在CIF的原子信息这一栏的最后面添加一句话，如下所示：_chemical_formula_sum'C10H18O5'_chemical_formula_moiety'C10H18O5'_chemical_formula_weight218.25_chemical_melting_point?_chemical_absolute_configuration'unk'这样就可