鱼类肌肉生长抑制素基因的进化分析【毕业设计】

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1、本科毕业设计（20__届）鱼类肌肉生长抑制素基因的进化分析目录摘要………………………………………………………………………………………….…………………........1关键词……...………………………………………………………………………………….………………........1ABSTRACT…………………………………………………………….…………………………………………...1KEY…………………………………………………………………………………………………………………2引言…………………………………………………………………………………………..

2、.……………………..31材料与方法……………………………………………………………………………………………………….31.1不同物种MSTN基因序列检索…………………………………………………….……………………….31.2序列分析方法………………………………………………………………………..……………………...52结果与分析………………………………………………………………………………………..…...……........52.1MSTN基因的同源性分析………………………………………………………………………………........52.2MSTN氨

3、基酸替换分析..……………………………………………………………………………....…..102.3不同物种MSTN基因的进化分析………………………………………………………………………….103讨论……………………………………………………………………………………………………..……….11致谢……………………………………………………………………………………………………….………..13参考文献………………………………………………………………………………………………….………..14摘要：肌肉生长抑制素（Myostatin，MSTN）基因对肌肉生长起

4、负调控作用。本研究报道了鱼类与哺乳类、鸟类以及各种鱼类之间MSTN基因的同源性和位于MSTN基因序列C端区域上的碱基替换情况，同时还通过构建NJ进化树分析了各种鱼类间的系统进化关系。利用ClustalW多重序列比对，发现MSTN基因上的C端生物活性区在鱼类还是哺乳类或是鸟类，都具有很强的保守性，且在C端都具有一个保守的蛋白酶加工位点RXXR及9个Cys残基。同时在保守性强C端区域内仅有几处存在碱基的替换，其中在碱基数分别为36bp和19bp的两个高度保守片段上，36bp的氨基酸片段，除了大黄鱼有一处R替换G，鸟类和哺乳类有一处D替换A外，所有鱼类

5、都是相同的。19bp的氨基酸片段，除了溪红点鮭有一处T替换A，大西洋鲑有一处I替换V外，从鱼类到哺乳类都是相同的。在ClustalW的基础上通过MEGA4.1软件以35种脊椎动物MSTN氨基酸序列构建的进化树上分析得到，鲈形总目的鱼类（大黄鱼、花鲈、罗非鱼、石鼓鱼、美国红鱼和青鳉）之间相似性高达88%~99%，同时鲈形总目鱼类与其它两种（鲱形总目和鲤形总目）之间的相似性分别有82%~90%及72%~82%，而鲱形总目与鲤形总目的鱼类之间相似性有79%~88%。MSTN的研究将更有助于了解鱼类肌肉发育调控和进化机理。关键词：鱼类；肌肉生长抑制素基因

6、；同源性；进化分析Abstract:ThegeneofMyostatinisanegativeregulatorofskeletalmusclegrowth.ThisstudyreportedthehomologyofMSTNgenebetweenteleostandmammals,aviananddifferentteleost,aswellasthebasesubstitutionthatlocatedintheC-terminalarea.Atthesametime,evolutionarytreeofallkindsofteleostwe

7、rebuiltbyusingtheneighborjoiningmethodofphylogeneticanalysis.AfterClustalWmultiplesequencealignment,strongconservatismintheC-terminalbiologicalactivityareaoftheMSTNgenesallhavebeenfoundinteleost,mammalianoravian.MoreoveritcontainsaRXXRproteolyticprocessingsiteandnineconserved

8、cysteineresidues.Severalbasesubstitution,includingtwohighlyconservat