福建农林大学蛋白质组学复习材料

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1、1.遗传图谱、物理图谱、基因组图谱这三个图谱之间的相关性遗传图谱：采用遗传学分析的方法将基因或其他DNA分子标记在染色体相对位置上构建的连锁图。表示不同基因之间的相对位置，以及不同基因之间的相对距离！物理图谱：采用分子生物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定基因组的实际位置所构建的位置图。遗传图谱与物理图谱的共同Z处都是确定基因或DNA分子标记在染色体上的排列位置。基因作图(genemapping)是一种遗传学作图，用来定位染色体中特定的DNA片段。是基因组研究的成果之一，主要分为以重组率为定位依据的遗传舆图，以及以

2、DNA片段实际位置为依据的物理舆图。2.蛋白质组学与传统蛋白质化学的区别%1蛋白质组学研究与传统蛋白质化学研究不同。传统责白质的研究主要针对单个蛋白质。蛋白质组学以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对彖。%1蛋白质化学包括研究蛋白质的结构和功能，通常涉及物理生物化学或机械酶学，蛋白质组学的内容是系统生物学，而不是结构生物学。③蛋白质化学研究工作通常包括完整序列测定、结构测定以及进行结构控制功能的模型研究;蛋白质组学需进行复杂混合物的分析，通过在数据库匹配工具下进行部分序列测定。3・蛋白质组学与基因组学研究技术上有什么

3、区别？基因组学蛋白质组学环境静态动态数量少多能否扩增利用PCR扩增无法扩增检测技术利用互补链抗原抗体结合对象唯一不同实体基因组学是一门关于基因组图、测序和基因组分析的科学，基因组学表达的最终产物是一组蛋白质，即蛋白质组。蛋白质组学是在基因组学的研究基础上发展起來的。1.蛋白质组学与基因组学的区别。%1蛋白质表达水平不能从mRNA表达水平来预测。%1蛋白质组与它的状态相对应。③2.上述区别的根本原因是蛋白质组学研究对象比基因组学研究更复杂，为什么？数量多、结构更为复杂、是动态反应发育过程%1蛋白质的组成及结构比基因更复杂；%

4、1蛋白质的数目远大于基因的数目；%1基因是相对静态的，生物体屮的基因组在不同环境下是相同的，而蛋白质是动态的,随时间、空间的变化而变化。3.2-DE技术与微阵列(Microarray)2-DE是等电聚焦电泳和SDS-FAGE的组合，即先进行等电聚焦电泳(按照pl分离)，然后再进行SDS-PAGE(按照分子大小)，经染色得到的电泳图是个二维分布的蛋白质图。是针对大量蛋白质的分离手段。DNA微阵列技术(microarray)指在固体表面上固定成千上万DNA克降片段，用荧光或其他标记的mRNA,cDNA或基因组DNA探针进行杂交

5、，从而同时快速检测多个基因表达状况或发现新基因，进行DNA序列分析等的一种新技术,其基木原理是基于分子杂交技术。微阵列技术是一种探索基因组功能的有力手段。1.2D-HPLC（多维液相色谱）色谱分离技术的优点，与2-DE的区别。色谱定义：任何将混合物组分在两相中（固定相和流动相）进行分配的分离技术。原理：混合物溶解在同一溶剂中，当流动相流经固定相吋，混合物组分可以与溶剂以及固定相基质分子间发生作用。HPLC优点：（包含区别）%1速度快儿个小时可完成全部分离，而2・DE分离一般需要1〜2d。%1自动化由于在溶液状态样品处理方便

6、、快速，避免了2DE从胶上冋收样品的繁复操作，分析过程易于与质谱联接。%1多用途对各种蛋白质均适用，而2DE対分子量过大（＞200kD）或过小（＜10kD）蛋白质不易分离。2.1-DE电泳技术的优缺点优点：%1免除了样品从1D胶向2D胶过渡时的繁复操作。%1与准确、灵敏、高分辨的质谱鉴定技术相结合，可能发展成2-DE的替代方法之一。缺点：%11-DE得到的分离度是相当有限的；%1在凝胶上的单一蛋白质条带实际上可能含有多种蛋白质；%1在胶上蛋白酶切和多肽序列的直接测定方面还存在一些问题。1.什么叫电泳？电泳的载体分哪两大类？

7、凝胶作为载体的特点电泳技术就是由各种带电粒子在电场中迁移率不同而进行分离的一种技术。电泳的载体分凝胶电泳、有两性电解质的载体？凝胶作为载体的特点：%1孔径与蛋白质分子大小相近，而且具有制胶方便、易于显色、透明等优点，是双向凝胶电泳的首选支持介质。%1凝胶通过分子筛的作用增强了蛋白质迁移时依赖于分子大小的分离能力。2.样品的制备包括哪几个过程，细胞破碎裂解获取蛋白质的方法，可以分为哪几类？过程：细胞的破碎、裂解、蛋白质沉淀及杂质的去除%1根据工具的不同，细胞破碎分为：机械法（研磨法、组织捣碎法）、物理法（超声波处理法、反复冻

8、融法、冷热交替法、压力杯法）、化学与生物化学法（有机溶剂处理法、酶解法、自溶法、渗透压冲击法）；%1根据破碎力度的不同，细胞破碎方法分为：温和的方法、剧烈的方法3.样品制备过程中遵循的原则（1）要保证蛋白质的完全溶解（2）要避免蛋白质降解或丢失（3）要去除杂质的干扰（4）勿反复冻融以制备好的样品4.蛋白