中医药本体工程研究现状

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1、中医药本体工程研究现状关键词:屮医药;本体工程;本体;语义网;综述DOI:10.3969/j.issn.1005-5304.2013.07.051中图分类号:R2-03文献标识码:A文章编号:1005-5304(2013)07-0110-03本体(Ontology)是针对领域概念体系的精确规范,用以指明概念的定义以及概念之间的语义关系。它能使交互各方对特定领域内共用的概念、词汇以及概念分类达成一致,支持知识的共享和重用,解决系统Z间的互操作问题。近年來,本体工程成为中医夯领域广泛关注的研究热点[l]o笔者

2、I韦I绕中医药本体工程,通过查阅近10年相关文献,探讨中医药本体工程的方法、技术、覆盖范围和应用,以期为屮医药本体开发人员提供参考。1概述中医夯学历经数千年的发展,形成了一套完整的知识体系。中医药信息学的一个核心任务,是实现中医药知识体系的数字化,从而面向中医团体提供准确、详实的知识服务。屮医药知识资源具冇鲜明的屮国文化特征,包含大量古汉语成分,难以精确描述。现代医学所使用的知识建模方法并不完全适合于中医药领域。因此,迫切需要提岀创新的知识建模方法,以支持中医夯知识的数字化建设。近年来,学者们开始尝试基于

3、领域本体,研制符合中医药领域特点的知识表达框架,解决中医学知识的获取、分析和推理等问题,包括在国家知识基础设施(NationalKnowledgeInfrastructure,NKI)的建设过程屮,构建了屮医领域本体,如屮医诊断方法、屮医术语、屮医证候、屮医脉象、中医病机等30多个中医木体类,用于实现中医学知识的获取、分析和推理[2-3]o尹氏等[4]针对中医药术语标准化过程中面临的问题,使用本体工程方法,研制了中医药学语言系统(TCMLS)o此外,本体述被用于阴阳理论[5]、五行理论[6]、中医诊断[7

4、]、证候学[8]、基金项目:国家科技重大专项-重大新药创制(2009ZX09301-005-01);国家高技术研究发展计划(2006AA01A122);第52批中国博士后科学基金面上项目(2012M520559);中国中医科学院基本科研业务费口主选题项目(zz060303)通讯作者:崔蒙,E-mail:cui@mail.cintcm.ac.cn中药学⑼、方剂学[10]、治则治法[11]、针灸学[12]、中医古籍[13]等领域的知识建模和知识获取。这些研究表明,领域木体为中医药知识体系的形式化表达和系统管理

5、提供了一种有效手段。2中医约本体工程方法学研究本体工程多是面向特定领域开展的,其方法在各个领域中不尽相同。屮医药领域的本体建设仍处于起步和探索阶段,其方法学体系尚未成熟、亟待完善。日前,国内外尚缺乏构建中医药领域木体的成熟流程、方法和标准规范。中医药领域的知识体系独具特色,极为复杂。中医药本体建设必然是一项复杂的系统工程,涉及中医团体的广泛参与和密切协作。若没有合适的方法学作为指导,就难以在不同的本体工程中贯彻一致的设计原则,这不利于本体的规模化和互操作。因此,需要对中医笏本体工程方法学进行深入研究。在方

6、法学研究屮,学者们首先提出了一些构建屮医药本体的基本原则。如林氏[10]提出对中医药概念的表达不必单纯强求标准化和一致性,而应在本体的启发和应用上,完整、忠实、准确地表达中医药传统理论的语义,并做到机读、通用、可共享,为实现中医药资源数字化奠定基础。方氏[14]提出,中医药木体的建立必须在深入理解中医药领域知识的基础上进行。这些原则对本体工程的实施都具有指导意义。本体工程方法学中的一项关键任务是顶层本体的设计。中医顶层本体不仅为中医本体的构建提供了框架,而且有利于实现中医本体同其他领域本体之间的整合,是构

7、建完整中医本体的基础。高氏等[15]对中医顶层本体的构建做了初步探索,并指出中医顶层本体必须包括一般科学的概念接口、一般生物医学的概念接口和屮医的最高层的抽象概念。另外,TCMLS的语义网络中包括层次化的语义类型和通用的语义关系,为TCMLS的构建提供了框架,也可被视为一个顶层本体[16]。TCMLS是在本体论指导下构建的大型术语系统,旨在提供一套计算机化的术语系统,支持中医药数字资源的系统整合和深度利用,向中医团体提供开放、智能的知识服务[4,16]。方氏[14]提出了一套基于本体构建TCMLS的方案,

8、其中涉及木体类及其层次结构、语义系统、概念集合、术语规范、通用编码等诸多方1何,并提出了本体规范存储和查询的方法,以帮助用户管理和获取中医约信息。曾氏[17]论述了TCMLS的构建思路、设计原则、架构与方法,包括术语及定义的采集范围及标准、定义类(Class)和类的层次结构(Hierarchy).语义关系等。谢氏等[18-19]对TCMLS的语义网络作了深入分析,并将其与一体化医学语言系统(UMLS)的语义网络进行了比较研究。

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