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时间:2019-11-22
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1、产品临床试验工作问题小结产品临床试验工作可分为五方面:一、工作前的计划与准备:试验方案拟定与试验用品的准备;二、试验样本准备:人全血基因组DNA提取及信息整理;三、试验样本检测:RT-PCR检测及结果分析;四、工作流程中问题的发现、交流与解决;五、收尾与总结。针对此次苏大附一院临床试验工作流程中出现的诸多问题,做如下总结与思考:一、工作前的计划与准备-一-种类与数量试齡川品的准备:1、试剂盒:基因型检测试剂盒:反应液/反应酶/质控品血液基因组DNA提取试剂盒2、耗材:移液器(枪):1000ul/20
2、0ul/50ul/10ul/2ul(口色长尖)吸头(枪尖):20ul(白色长尖)/200ul(黄色)/1000ul(蓝色)吸头盒(三种规格)荧光PCR管(长且不透明、8联排)和盖子Eppendrof管(1.5ml)多空板(96孔/60孔)、样本储存盒(72孔)、Marker笔、手套3、样木信息对照表二、试验样本准备(人全血基因组DNA提取)一-节奏与程度提取前的检查与准备:1、检杏试剂盒各溶液,若产生沉淀,须在室温放置一段时间,必要时可在37°C水浴预热,溶解沉淀;2、依据提取步骤,为溶液编号;3、
3、缓冲液GD和漂洗液PW需加入适量无水乙醇;4、剪去吸附柱的盖子提取步骤:1、第二次加入细胞裂解液CLJ裂解红细胞)时,需要剧烈振荡,以充分混匀沉淀(可见管中液体深红,并有较多泡沫,管底无结块沉淀);2、加入缓冲液GB后,充分颠倒混匀(如不充分,可能会产生白色沉淀,一般37°C放置时会消失,不影响后续试验3、56°C水浴时间延长至30~40min,其间颠倒混匀数次,观察溶液是否变得清亮,并为收集管编号(如未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA量少、纯度不加,直接影响荧光检测);4、水浴后加
4、入200U1无水乙醇,岀现絮状沉淀,轻柔颠倒混匀(此时DNA析出,故自此步骤开始,颠倒要轻柔缓慢,否则破坏DNA结构);5、最后向吸附膜中间位置悬空滴加100U1超纯水。三、试验样本检测:RT-PCR检测及结果分析-一精细、顺序、安全RT-PCR前的准备:1、超净工作台紫外光灭菌;2、从-20C取出扩增反应所盂的反应液和质控品,置于室温溶解,涡旋混匀约10s,离心待用(可使试剂充分溶解混匀,避免因体系溶质不均匀影响反应);3、准备荧光PCR八联排管(白色/长管一长管与ABI7500仪器符合度较好,利
5、于充分受热,否则严重影响检测结果,导致荧光信号低),并适当标记;RT-PCR反应体系的分装与加样:1、移液器的“连续吸放液”一调移液器量程至23ul,将排放按钮按至第一停点(第一档),再将吸头垂直浸入液面,平稳松开按钮,在液面Z下,再次将排放按钮按至第一档,排出吸头尖端的气泡后,松开按钮,吸入液体,Z后放液只需按至笫一档即是23ul(如吸头尖端仍有气泡,可反复吸放,直至排净气泡);2、样木放置顺序、吸头安装顺序、试验者感知顺序三者形成“校正机制”,保障顺序加样(校正机制的建立,有助于连贯而正确地加样
6、):3、移液器的吸放液要“慢吸快放”,R试验者要观察吸头尖端,进行视觉“校正”,避免吸空放空;4、放液时,吸头先伸入液面以下放出液体,再在管壁处打净残液(如吸头仍存残液,将移液器按至第二档,将残液打至吸头尖端处,拔掉吸头,并再次安装回去,将残液打回管中);5、不能直接用手触摸PCR管,因为人的手上含冇荧光素,沾染在管壁上的荧光索会影响荧光仪检测。操作时必须戴不含荧光物质的一次性手套并要经常更换(应使用镶子夹取管子和管盖);6、吸头不要氏时间暴露于空气中,避免气溶胶的污染;7、加样完成后,盖紧盖子,并
7、离心;8、超净工作台使用后,用次氯酸钠擦拭,避免试验环境污染;结果分析:分析的思路:1、慕线和阈值的选择和设置是否正确(直接与Ct值相关);2、阳性和空白对照的结果是否匸常(既可验证PCR反应的可靠性,又可以协助判断扩增系统的可信性,空白对照的污染将导致结果失信。如空白对照出现阳性,则为污染,需检查试剂准备区域是否污染、检查使用的器材是否污染、检查实验室的区域分离和人流物流的单向流动等);3、扩增曲线的线形关系如何(“S”型扩增曲线,分为四个阶段:基线期、指数增长期、指数扩增期、平台期);分析中遇到
8、的问题:Q1:扩增曲线不止常,刚进入指数期就很快进入平台期并向右下弯曲;1.基线等设置不当:按仪器说明书重新操作;2.模板量过多:当扩增曲线在10个循环内起峰时,应将模板稀释后使用。Q2:Ct值出现过晚;1•反应条件不佳:未最佳反应条件,可重新设计引物或探针,适当降低退火温度,增加镁离子浓度等;2.PCR各种反应成分的降解或加样量不够;3.扩增产物片段过长:一般采用100-2(X)bp的扩增长度。Q3:无Ct值(信号)出现;1•反应循环数不够:一般都要在35个循环以上
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