基因组编辑技术研究进展

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1、生物技术通报·技术与方法·BIOTECHNOLOGYBULLETIN2014年第11期基因组编辑技术研究进展吴璐王磊任远原辉(深圳华大基因研究院,深圳518083)摘要:利用基因组编辑技术可以对生物基因组特定位点进行人工修饰,研究相关基因的功能,进而应用于基础研究和临床治疗方面。序列特异性的DNA结合结构域与非特异性的DNA修饰结构域组合而成的人工酶是基因组编辑工具的重要组成部分。主要介绍了锌指核酸酶(ZFNs)、转录激活样效应因子核酸酶(TALEN)、归巢核酸内切酶(Meganucleases)和成簇间隔短回文重复(CRIS

2、PR)4种基因组编辑技术的特点、原理、构建方法及应用,为相关的研究和应用提供参考。关键词:基因编辑ZFNsTALENCRISPR同源重组TheResearchofGenomeEditingWuLuWangLeiRenYuanYuanHui(BGI-Shenzhen,Shenzhen518083)Abstract:GenomeEditingcanbeusedtooperateartificiallyalmostanygeneincellsororganisms.Thisresearchmethodofgenefunctionis

3、usefulforfundamentalresearchandclinictreatment.ThemajorcomponentofthistoolisartificialnucleasewithspecificDNA-bindingdomainandnon-specificDNA-modifyingdomain.Thisarticlereviewsthecharacteristics,principle,constructionandapplicationofZFN,TALENandCRISPR/Cas,whichwould

4、beusefulreferenceforrelatedresearch.Keywords:GeneeditingZFNsTALENCRISPRHomologousrecombination基因组定点编辑技术,可以实现对一个或多个修复(Homologydirectedrecombinationrepair,HDR)目的基因的敲除,或是把外源基因敲入到指定位点,和非同源末端连接(Non-homologousendjoining,也可以利用转录因子在转录水平上对目的基因的表NHEJ)两种方式修复。在同源序列(外源引入或同达水平进行调

5、控,这项技术是研究基因功能并对基源染色体)存在的情况下,同源重组修复(HDR)因的功能加以利用的最有效手段。可实现外源基因的插入或基因的靶向修复;在没有基因组定点编辑工具主要有锌指核酸酶(Zinc-同源序列的情况下,细胞趋向于利用非同源的末端fingernucleases,ZFNs)、转录激活样效应因子核酸连接(NHEJ)进行DNA的修复,它可能引入或删酶(Transcriptionactivator-likeeffectornucleases,TA-除一个或多个碱基从而造成基因移码突变,使相关LEN)、归巢核酸内切酶(Meg

6、anucleases)和成簇间隔基因被敲除。4种基因组编辑技术的序列靶向识别、短回文重复(ThetypeIIclusteredregularlyinterspaced人工构建方法等均有很大不同。shortpalindromicrepeats,CRISPR),以上工具均可1锌指核酸酶(ZFNs)以对基因组进行精确的定点修饰,工作原理基于核ZFN是一种人工改造的核酸内切酶,它由特异酸内切酶在基因组的特定位点进行切割,从而形成性的DNA结合结构域和非特异性的切割域两部分DNA双链断裂(Doublestrandbreak,DSB)。细

7、胞中构成,其中结合域由一系列串联的具有Cys2-His2存在天然的DNA损伤应答机制,DSB会被同源重组结构的锌指蛋白构成,切割域主要是指核酸内切酶收稿日期:2014-01-26基金项目:深圳市战略新兴产业发展专项资金项目(CXZZ20120615141322654)作者简介:吴璐,女,硕士,研究方向:分子生物学;E-mail:wulu@genomics.cn通讯作者:原辉,男,博士,研究方向:动植物分子育种;E-mail:yuanhui@genomics.cn2014年第11期吴璐等:基因组编辑技术研究进展85FokI。在基

8、因组靶标位点左右两边各设计一个ZFN中切割域和锌指核酸酶的切割域类似,均为FokI内(分别根据正负链的序列),识别结构域将两个ZFN切酶;TALEN的结合域是经过人工改造的TALE蛋结合到基因组特定位点,当两个识别位点的间距为白,这种蛋白最初来源于一种植物病原菌——黄单6-8

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